[English] 日本語
Yorodumi- PDB-7avr: The tetrameric structure of haloalkane dehalogenase DpaA from Par... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7avr | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | The tetrameric structure of haloalkane dehalogenase DpaA from Paraglaciecola agarilytica NO2 | ||||||||||||||||||||||||
Components | Haloalkane dehalogenase 1 | ||||||||||||||||||||||||
Keywords | HYDROLASE / Haloalkane dehalogenase / enzyme / tetramer | ||||||||||||||||||||||||
Function / homology | Epoxide hydrolase-like / alpha/beta hydrolase fold / catalytic activity / Alpha/beta hydrolase fold-1 / Alpha/Beta hydrolase fold / Haloalkane dehalogenase 1 Function and homology information | ||||||||||||||||||||||||
Biological species | Paraglaciecola agarilytica NO2 (bacteria) | ||||||||||||||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2 Å | ||||||||||||||||||||||||
Authors | Mazur, A. / Kolenko, P. / Prudnikova, T. / Grinkevich, P. / Kuta Smatanova, I. | ||||||||||||||||||||||||
Funding support | Czech Republic, Germany, 7items
| ||||||||||||||||||||||||
Citation | Journal: Acta Crystallogr D Struct Biol / Year: 2021 Title: The tetrameric structure of the novel haloalkane dehalogenase DpaA from Paraglaciecola agarilytica NO2. Authors: Mazur, A. / Prudnikova, T. / Grinkevich, P. / Mesters, J.R. / Mrazova, D. / Chaloupkova, R. / Damborsky, J. / Kuty, M. / Kolenko, P. / Kuta Smatanova, I. | ||||||||||||||||||||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7avr.cif.gz | 511.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb7avr.ent.gz | 417.2 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7avr.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/av/7avr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/av/7avr | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Related structure data | 2xt0S S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Components on special symmetry positions |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 0 / Refine code: 0
|