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- PDB-6gk9: Inhibited structure of IMPDH from Pseudomonas aeruginosa -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6gk9
タイトルInhibited structure of IMPDH from Pseudomonas aeruginosa
要素Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
キーワードOXIDOREDUCTASE / IMP dehydrogenase / nucleotide biosynthesis / allosteric regulation
機能・相同性
機能・相同性情報


IMP dehydrogenase activity / IMP dehydrogenase / GMP biosynthetic process / GTP biosynthetic process / ATP binding / identical protein binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase / IMP dehydrogenase / GMP reductase, conserved site / IMP dehydrogenase / GMP reductase signature. / IMP dehydrogenase/GMP reductase / IMP dehydrogenase / GMP reductase domain / IMP dehydrogenase / GMP reductase domain / Domain in cystathionine beta-synthase and other proteins. / CBS domain superfamily / CBS domain / CBS domain ...Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase / IMP dehydrogenase / GMP reductase, conserved site / IMP dehydrogenase / GMP reductase signature. / IMP dehydrogenase/GMP reductase / IMP dehydrogenase / GMP reductase domain / IMP dehydrogenase / GMP reductase domain / Domain in cystathionine beta-synthase and other proteins. / CBS domain superfamily / CBS domain / CBS domain / CBS domain profile. / Aldolase-type TIM barrel
類似検索 - ドメイン・相同性
Chem-F2K / Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
類似検索 - 構成要素
生物種Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.54 Å
データ登録者Labesse, G. / Alexandre, T. / Haouz, A. / Munier-Lehmann, H.
引用ジャーナル: Eur J Med Chem / : 2019
タイトル: First-in-class allosteric inhibitors of bacterial IMPDHs.
著者: Alexandre, T. / Lupan, A. / Helynck, O. / Vichier-Guerre, S. / Dugue, L. / Gelin, M. / Haouz, A. / Labesse, G. / Munier-Lehmann, H.
履歴
登録2018年5月18日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02019年2月27日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12024年1月17日Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
B: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
C: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
D: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
E: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
F: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
G: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
H: Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)432,23911
ポリマ-431,5108
非ポリマー7293
17,691982
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: SAXS, scanning transmission electron microscopy, mass spectrometry, gel filtration, equilibrium centrifugation
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
Buried area31950 Å2
ΔGint-191 kcal/mol
Surface area124620 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)115.640, 196.958, 123.628
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 113.990, 90.000
Int Tables number4
Space group name H-MP1211

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要素

#1: タンパク質
Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase / IMPDH


分子量: 53938.699 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa PAO1 (緑膿菌)
遺伝子: guaB, PA3770 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9HXM5, IMP dehydrogenase
#2: 化合物 ChemComp-F2K / (5~{S})-7-azanyl-5-(4-chlorophenyl)-2,4-bis(oxidanylidene)-1,5-dihydropyrano[2,3-d]pyrimidine-6-carbonitrile


分子量: 316.699 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / : C14H9ClN4O3
#3: 化合物 ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / : SO4
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 982 / 由来タイプ: 天然 / : H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.74 %
結晶化温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法
詳細: Protein concentration: 7.8 mg.mL-1 lithium chloride 500 mM, ammonium sulphate 50 mM, PEG8000 8%

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SOLEIL / ビームライン: PROXIMA 1 / 波長: 0.98011 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年10月7日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.98011 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.54→48.99 Å / Num. all: 165995 / Num. obs: 165995 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 4.7 % / Biso Wilson estimate: 43.37 Å2 / Rpim(I) all: 0.069 / Rrim(I) all: 0.153 / Rsym value: 0.121 / Net I/av σ(I): 4.1 / Net I/σ(I): 7.6 / Num. measured all: 778371
反射 シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)冗長度 (%)Rmerge(I) obsMean I/σ(I) obsNum. unique obsRpim(I) allRrim(I) allRsym value% possible all
2.54-2.684.70.5081.4242400.2790.6290.508100
2.68-2.844.60.3352.1228640.1870.4180.335100
2.84-3.044.70.2452.9215330.1370.3050.245100
3.04-3.284.70.1714200200.0950.2130.171100
3.28-3.594.70.1245.2184370.070.1560.124100
3.59-4.024.70.1055.8166870.060.1320.105100
4.02-4.644.70.0916.5147410.0530.1150.091100
4.64-5.684.70.096.4124590.0510.1130.09100
5.68-8.034.70.0896.396630.0510.1120.089100
8.03-48.994.60.0895.153510.0530.1130.08999.5

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換
Phasing MRRfactor: 35.41 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO
最高解像度最低解像度
Rotation2.54 Å48.99 Å
Translation2.54 Å48.99 Å

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類NB
XDSデータ削減
SCALA3.3.15データスケーリング
PHASER2.1.4位相決定
PHENIX精密化
PDB_EXTRACT3.24データ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 4dqw
解像度: 2.54→48.99 Å / SU ML: 0.28 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 19.39
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2054 8272 4.99 %
Rwork0.1593 --
obs0.1616 165931 99.98 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 187.4 Å2 / Biso mean: 53.6059 Å2 / Biso min: 18.66 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.54→48.99 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数23216 0 67 982 24265
Biso mean--95.1 52.48 -
残基数----3142
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 30 / % reflection obs: 100 %

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all
2.54-2.56890.26932660.216353045570
2.5689-2.59910.26542730.20351865459
2.5991-2.63080.25012970.196352715568
2.6308-2.66410.24982330.184752455478
2.6641-2.69910.25052720.1852505522
2.6991-2.73610.24992690.179152515520
2.7361-2.77520.22932840.170152215505
2.7752-2.81660.2292690.168952775546
2.8166-2.86060.22212980.17151855483
2.8606-2.90750.2312700.182552725542
2.9075-2.95760.27922680.188752535521
2.9576-3.01140.22972600.197652285488
3.0114-3.06930.23262690.183252645533
3.0693-3.1320.2432890.175652695558
3.132-3.20010.23112710.177652365507
3.2001-3.27450.22852780.168852305508
3.2745-3.35640.2142620.165752565518
3.3564-3.44710.21662700.167952625532
3.4471-3.54850.19882670.168152485515
3.5485-3.6630.20932720.157552415513
3.663-3.79390.18482630.149652805543
3.7939-3.94570.19912910.145452625553
3.9457-4.12520.16842980.137752345532
4.1252-4.34250.18672880.127552395527
4.3425-4.61440.17532930.124952715564
4.6144-4.97040.1592750.123952395514
4.9704-5.470.18973000.143752725572
5.47-6.26010.19732760.155552815557
6.2601-7.88180.19632750.155652875562
7.8818-48.99860.20182760.181553455621
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
10.9232-0.26020.24540.4053-0.52351.27080.0376-0.2552-0.0160.0603-0.067-0.03580.0450.20570.06660.2522-0.0036-0.00690.3001-0.00470.261458.2990.820111.3243
22.14740.611-1.45962.0302-1.55484.12480.1032-0.09810.03330.05970.17480.1234-0.3992-0.3953-0.26310.5351-0.01010.04470.8223-0.00530.384486.7434-4.857330.9607
31.89830.4002-0.20571.1173-0.25781.0455-0.0246-0.2526-0.08560.087-0.0232-0.1257-0.00150.02710.03430.2470.0033-0.01690.2861-0.01840.21751.07451.8078.4927
41.25730.64020.11180.9280.28050.44460.1017-0.23810.06460.015-0.088-0.0866-0.06460.1045-0.00890.2126-0.03240.01880.2834-0.00470.309187.4219-25.4598-10.1267
52.3139-1.2663-1.23823.27061.11611.77580.0067-0.32390.2479-0.3540.3065-0.3318-0.32410.4276-0.28020.3702-0.08240.07350.8019-0.08170.4492105.2459-3.157718.2782
60.52510.11230.86070.38380.94672.4001-0.0592-0.30220.08870.1884-0.04310.15090.2139-0.00480.14990.3511-0.06140.07360.6044-0.0190.468997.7874-19.954510.6571
71.22290.3828-0.00320.8905-0.07281.48390.02930.06030.0227-0.0306-0.0087-0.082-0.07680.006-0.02430.21620.00960.03270.2442-0.01380.32184.1776-28.9631-19.1727
81.14730.03670.43621.25450.31860.87260.0927-0.259-0.34620.0909-0.06340.14780.186-0.113-0.02010.251-0.02930.02880.31410.07910.351214.9913-20.84560.1472
92.49740.1485-0.1293.20430.73762.76420.02740.59080.01250.3880.31161.1711-0.7806-0.5012-0.26670.9910.05050.31930.98820.06221.26983.7139-50.333218.716
100.32870.5616-0.5742.19-2.25932.4311-0.333-0.2558-0.7630.6680.1173-0.03360.7572-0.26210.18070.8679-0.01830.16030.58890.26090.805710.1386-35.866415.1075
111.1196-0.11940.64750.66720.16091.44960.0511-0.0362-0.19540.0374-0.05810.07610.0975-0.02930.0180.2259-0.00380.04410.31070.03520.345315.3451-14.8808-5.5
125.19723.2114-2.12644.0329-1.73731.92050.06690.0042-0.19280.3427-0.0517-0.1493-0.3285-0.11280.02530.28040.0294-0.02170.3034-0.00420.280420.02025.1235-23.2248
130.46440.0970.7050.58130.50342.3957-0.16140.39350.032-0.34470.21520.13230.0124-0.1087-0.06460.3992-0.0868-0.04760.44530.01790.284515.2813-5.9382-52.389
141.8263-0.6191-0.54472.8193-0.0082.15530.11640.3554-0.0492-0.43550.07180.23490.078-0.149-0.13410.558-0.0755-0.20720.850.17130.52481.7583-21.5803-78.1088
150.820.84991.11052.23571.39922.0923-0.10850.09090.1576-0.26710.00990.3358-0.1222-0.1970.10290.493-0.049-0.09370.57680.09090.331711.438-2.3733-59.0186
163.73111.6738-0.00061.21250.96341.968-0.18630.14990.1324-0.10910.10480.1317-0.121-0.13130.01780.4534-0.0044-0.0460.27890.06580.314923.780110.6016-41.9897
170.41760.37870.16481.83550.56351.48720.03650.0234-0.0585-0.1098-0.0268-0.1075-0.0184-0.0068-0.01840.2485-0.0109-0.02080.3080.04640.257119.7942-5.1842-36.1055
180.94650.0217-0.21131.1468-0.04441.1061-0.0122-0.0555-0.06990.12020.07070.1760.0372-0.2466-0.04980.29920.0138-0.03380.18950.01770.43345.319-53.3452-2.173
192.7296-0.2763-2.02812.2753-0.18843.0943-0.1676-0.4415-0.09190.830.15690.76-0.1449-0.07690.06010.65770.07660.1240.5954-0.0080.759222.0119-57.840620.6295
201.42970.25240.23720.8571-0.06471.1688-0.06830.05550.0420.01430.07980.0859-0.0045-0.0374-0.01960.2860.01830.00030.17010.01850.389552.8805-52.1947-7.0148
211.6437-0.54012.22781.02190.20316.45770.20730.0004-0.065-0.14030.29440.140.2043-0.2226-0.48110.2633-0.071-0.00060.28810.06160.287737.074616.3136-25.033
222.3308-0.23170.46011.4230.21011.1568-0.13270.460.0674-0.42340.1657-0.308-0.13920.4189-0.0230.4787-0.11450.14040.4483-0.01470.345163.829420.5508-38.5362
232.4497-0.743-1.54221.90820.16124.368-0.25480.33320.1887-0.13130.3103-0.4157-0.18730.4938-0.05990.3547-0.10590.08050.3718-0.02830.461168.981624.5388-24.7653
241.9462-0.242-0.04220.1837-0.59922.3118-0.08430.1230.0004-0.17010.0841-0.1807-0.03020.155-0.01850.3465-0.04830.04830.2445-0.04560.374358.595424.3572-20.017
252.2937-0.2099-0.22090.05260.09621.69370.07010.25920.0885-0.00460.0625-0.23290.2374-0.1211-0.12120.3858-0.05580.01010.245-0.00560.2850.75717.2381-30.2097
262.2198-0.5936-0.40831.82570.87962.21690.00950.1508-0.1072-0.44340.2355-0.13850.3950.1073-0.2470.4825-0.08750.01210.2974-0.01540.285850.09059.2688-37.2585
274.84671.78292.13882.16931.27592.28280.0191-0.1323-0.0596-0.3836-0.0571-0.07460.09740.06510.05140.41080.02410.01180.4030.00540.275873.5054-37.399-42.6394
281.12280.13020.0961.5407-0.31991.54060.02860.41070.1744-0.5111-0.0524-0.0857-0.16570.27230.02320.6098-0.04350.07040.452-0.01670.297472.2061-17.0327-58.4572
290.5929-0.954-0.5182.4303-0.11631.37180.33980.25930.5224-0.4868-0.021-0.5219-0.4950.0031-0.25750.8975-0.0850.06370.48610.10060.585572.8114-3.1608-65.3344
301.1509-0.08150.07383.2368-0.20672.1355-0.02220.55850.1805-1.0523-0.04570.1837-0.01760.14010.03610.8318-0.03040.0290.6596-0.00630.293866.8082-20.5377-69.5867
312.47580.69640.12081.897-1.08690.80170.10950.2893-0.0227-0.5459-0.11090.1283-0.21060.2544-0.00390.6859-0.00290.01340.5032-0.12380.279264.4058-32.8107-63.7211
321.38040.41810.88382.0962-0.13040.93720.0505-0.03350.1517-0.1461-0.13990.0646-0.1350.00180.08520.4631-0.02410.08440.4238-0.06740.307370.9069-22.2473-48.1949
331.46530.0033-0.06740.7979-0.41390.3435-0.05710.2186-0.0182-0.26370.21990.33690.2016-0.3037-0.13190.5457-0.0689-0.18010.5467-0.0030.486530.109-46.2447-50.8585
343.3297-1.754-0.82112.66080.30171.5320.1705-0.4865-1.4755-0.05270.00971.18260.5962-0.6532-0.15530.9672-0.3223-0.31011.00090.25141.1505-5.2867-41.8012-67.0666
353.1874-0.98842.25760.3374-0.68151.60110.26790.0112-0.24-0.30240.05560.41620.45470.1345-0.32520.8419-0.0718-0.27840.6970.07780.830713.601-40.1064-70.3162
361.1968-0.0464-0.08981.2345-0.59361.68240.06910.1586-0.2386-0.26850.14480.28510.1625-0.1873-0.18610.4444-0.0594-0.14390.3401-0.04660.405336.7346-49.137-45.004
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 0 through 105 )A0 - 105
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 106 through 202 )A106 - 202
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 203 through 467 )A203 - 467
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'B' and (resid 1 through 105 )B1 - 105
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'B' and (resid 106 through 166 )B106 - 166
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'B' and (resid 167 through 223 )B167 - 223
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 224 through 466 )B224 - 466
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'C' and (resid 1 through 107 )C1 - 107
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'C' and (resid 108 through 177 )C108 - 177
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'C' and (resid 178 through 219 )C178 - 219
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'C' and (resid 220 through 467 )C220 - 467
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'D' and (resid 1 through 24 )D1 - 24
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'D' and (resid 25 through 98 )D25 - 98
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'D' and (resid 99 through 176 )D99 - 176
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'D' and (resid 177 through 266 )D177 - 266
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'D' and (resid 267 through 315 )D267 - 315
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'D' and (resid 316 through 466 )D316 - 466
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'E' and (resid 1 through 105 )E1 - 105
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'E' and (resid 106 through 210 )E106 - 210
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'E' and (resid 211 through 467 )E211 - 467
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'F' and (resid 1 through 24 )F1 - 24
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'F' and (resid 25 through 226 )F25 - 226
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'F' and (resid 227 through 253 )F227 - 253
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'F' and (resid 254 through 315 )F254 - 315
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'F' and (resid 316 through 371 )F316 - 371
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'F' and (resid 372 through 466 )F372 - 466
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'G' and (resid 1 through 24 )G1 - 24
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'G' and (resid 25 through 75 )G25 - 75
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'G' and (resid 76 through 208 )G76 - 208
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'G' and (resid 209 through 253 )G209 - 253
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'G' and (resid 254 through 315 )G254 - 315
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'G' and (resid 316 through 466 )G316 - 466
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'H' and (resid 1 through 105 )H1 - 105
34X-RAY DIFFRACTION34chain 'H' and (resid 106 through 166 )H106 - 166
35X-RAY DIFFRACTION35chain 'H' and (resid 167 through 212 )H167 - 212
36X-RAY DIFFRACTION36chain 'H' and (resid 213 through 467 )H213 - 467

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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