登録情報 | データベース: PDB / ID: 6fpx |
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タイトル | Structure of S. pombe Mmi1 in complex with 11-mer RNA |
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要素 | - RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*AP*AP*AP*CP*CP*UP*A)-3')
- YTH domain-containing protein mmi1
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN / Meiosis mRNA decay |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
regulation of termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled / nuclear RNA surveillance / siRNA-independent facultative heterochromatin formation / regulation of siRNA-independent facultative heterochromatin formation / nuclear exosome focus / nuclear mRNA surveillance of spliceosomal pre-mRNA splicing / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts / Mei2 nuclear dot complex / heterochromatin island / lncRNA catabolic process ...regulation of termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled / nuclear RNA surveillance / siRNA-independent facultative heterochromatin formation / regulation of siRNA-independent facultative heterochromatin formation / nuclear exosome focus / nuclear mRNA surveillance of spliceosomal pre-mRNA splicing / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts / Mei2 nuclear dot complex / heterochromatin island / lncRNA catabolic process / CCR4-NOT complex binding / protein-RNA adaptor activity / nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing / regulatory ncRNA 3'-end processing / N6-methyladenosine-containing RNA reader activity / pre-mRNA binding / lncRNA binding / mRNA destabilization / pre-mRNA intronic binding / mRNA binding / chromatin / DNA binding / RNA binding / nucleus / cytoplasm類似検索 - 分子機能 RNA / RNA (> 10) / RNA binding exosome specificity factor Mmi1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_yeast.gif) Schizosaccharomyces pombe (分裂酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.97 Å |
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データ登録者 | Stowell, J.A.W. / Hill, C.H. / Yu, M. / Wagstaff, J.L. / McLaughlin, S.H. / Freund, S.M.V. / Passmore, L.A. |
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資金援助 | 英国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Medical Research Council (United Kingdom) | MC_U105192715 | 英国 | European Research Council | 261151 | |
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引用 | ジャーナル: J. Biol. Chem. / 年: 2018 タイトル: A low-complexity region in the YTH domain protein Mmi1 enhances RNA binding. 著者: Stowell, J.A.W. / Wagstaff, J.L. / Hill, C.H. / Yu, M. / McLaughlin, S.H. / Freund, S.M.V. / Passmore, L.A. |
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履歴 | 登録 | 2018年2月12日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2018年5月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年6月27日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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