登録情報 | データベース: PDB / ID: 5yka |
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タイトル | Crystal structure of the Kdo hydroxylase KdoO, a non-heme Fe(II) alphaketoglutarate dependent dioxygenase in complex with cobalt(II) |
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要素 | Uncharacterized protein KdoO |
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キーワード | BIOSYNTHETIC PROTEIN / Fe(II)/O2/alphaketoglutarate dependent dioxygenase / KDO2-lipid A dioxygenase / deoxysugar dioxygenase / LPS biosynthesis |
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機能・相同性 | Kdo hydroxylase / 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid (Kdo) hydroxylase / metal ion binding / ACETATE ION / : / 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid (Kdo) hydroxylase機能・相同性情報 |
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生物種 | Methylacidiphilum infernorum (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.448 Å |
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データ登録者 | Chung, H.S. / Pemble, C.W. / Joo, S.H. / Raetz, C.R. |
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資金援助 | 日本, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Korea Institute of Sceince and Technology | | 日本 |
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引用 | ジャーナル: J. Mol. Biol. / 年: 2018 タイトル: Biochemical and Structural Insights into an Fe(II)/ alpha-Ketoglutarate/O2-Dependent Dioxygenase, Kdo 3-Hydroxylase (KdoO). 著者: Joo, S.H. / Pemble, C.W. / Yang, E.G. / Raetz, C.R.H. / Chung, H.S. |
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履歴 | 登録 | 2017年10月12日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年9月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年10月24日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2024年3月27日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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