登録情報 | データベース: PDB / ID: 5xmh |
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タイトル | Crystal structure of an IgM rheumatoid factor YES8c in complex with IgG1 Fc |
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要素 | - Immunoglobulin gamma-1 heavy chain
- YES8c heavy chain
- YES8c light chain
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キーワード | IMMUNE SYSTEM / Immunoglobulin / Complex / Rheumatoid factor / Autoantibody |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
immunoglobulin complex, circulating / immunoglobulin receptor binding / complement activation, classical pathway / antigen binding / antibacterial humoral response / blood microparticle / extracellular exosome / plasma membrane類似検索 - 分子機能 Immunoglobulin V-Type / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site / Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature. / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Immunoglobulin C-Type / Immunoglobulin C1-set / Immunoglobulin C1-set domain ...Immunoglobulin V-Type / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site / Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature. / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Immunoglobulin C-Type / Immunoglobulin C1-set / Immunoglobulin C1-set domain / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2.8 Å |
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データ登録者 | Shiroishi, M. / Shimokawa, K. / Lee, J.M. / Kusakabe, M. / Ueda, T. |
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資金援助 | 日本, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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JSPS KAKENHI | 23655160 | 日本 | JSPS KAKENHI | 15K15184 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: J. Biol. Chem. / 年: 2018 タイトル: Structure-function analyses of a stereotypic rheumatoid factor unravel the structural basis for germline-encoded antibody autoreactivity. 著者: Shiroishi, M. / Ito, Y. / Shimokawa, K. / Lee, J.M. / Kusakabe, T. / Ueda, T. |
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履歴 | 登録 | 2017年5月15日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年3月21日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年5月16日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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