PDB-5w2q: Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis KasA in complex w...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5w2q

タイトル

Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis KasA in complex with 6U5

要素

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1

キーワード

TRANSFERASE / BETA KETOACYL SYNTHASE I / LIPID SYNTHESIS / FATTY ACID BIOSYNTHESIS

機能・相同性

機能・相同性情報

meromycolic acid 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity / fatty acid biosynthetic process / cytosol
類似検索 - 分子機能

生物種

Mycobacterium tuberculosis (結核菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Capodagli, G.C. / Neiditch, M.B.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: MBio / 年: 2018
タイトル: Synergistic Lethality of a Binary Inhibitor of Mycobacterium tuberculosis KasA.
著者: Kumar, P. / Capodagli, G.C. / Awasthi, D. / Shrestha, R. / Maharaja, K. / Sukheja, P. / Li, S.G. / Inoyama, D. / Zimmerman, M. / Ho Liang, H.P. / Sarathy, J. / Mina, M. / Rasic, G. / Russo, R. ...

履歴

登録	2017年6月6日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年12月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年1月9日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5w2q.cif.gz	178.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5w2q.ent.gz	139 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5w2q.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5w2q_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5w2q_full_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示
XML形式データ	5w2q_validation.xml.gz	19.2 KB	表示
CIF形式データ	5w2q_validation.cif.gz	27.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w2/5w2q ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w2/5w2q	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5w2oC 5w2pC 5w2sC 4c6uS 2wgd 2wge 2wgf 2wgg 4c6v 4c6w 4c6x 4c6z 4c70 4c71 4c72 4c73 5ld8 S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5w2o-1 6p9k-1 6p9m-1 2wgf-3 2wgf-4 5sxo-1 6y2i-d 2wge-1 2wgg-2 6y2j-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#90 - 2007年6月脂肪酸合成酵素 (Fatty Acid Synthase) 類似性 (8) #216 - 2017年12月生分解性プラスチック (Biodegradable Plastic) 類似性 (1) #70 - 2005年10月人工設計タンパク質 (Designer Proteins) 類似性 (1)

登録構造単位

A: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1

ヘテロ分子

46.9 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1

ヘテロ分子

A: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
93.7 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	77.289, 77.289, 145.126
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	152
Space group name H-M	P3₁21

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-690- HOH
2	1	A-713- HOH

-
タンパク質 , 1種, 1分子 A

#1: タンパク質	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1 / Beta-ketoacyl-ACP synthase 1 / KAS 1 分子量: 45788.625 Da / 分子数: 1 / 変異: M24V / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (結核菌) 株: ATCC 35801 / TMC 107 / Erdman / 遺伝子: kasA, ERDMAN_2470 発現宿主: Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 (バクテリア) 参照: UniProt: H8ESN0, beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I

#1: タンパク質

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 1 / Beta-ketoacyl-ACP synthase 1 / KAS 1

分子量: 45788.625 Da / 分子数: 1 / 変異: M24V / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Mycobacterium tuberculosis (結核菌)
株: ATCC 35801 / TMC 107 / Erdman / 遺伝子: kasA, ERDMAN_2470
発現宿主:

Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 (バクテリア)
参照: UniProt: H8ESN0, beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I

-
非ポリマー , 6種, 208分子

#2: 化合物	ChemComp-6U5 / ~{N}-(1-methylindazol-6-yl)butane-1-sulfonamide 分子量: 267.347 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₂H₁₇N₃O₂S
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#5: 化合物	ChemComp-IPA / ISOPROPYL ALCOHOL / 2-PROPANOL / 2-プロパノ-ル分子量: 60.095 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O / コメント: alkaloid*YM
#6: 化合物	ChemComp-TCE / 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid / 3-[bis(2-carboxyethyl)phosphanyl]propanoic acid / トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン分子量: 250.186 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₉H₁₅O₆P
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 200 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.9 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.59 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 9.5 詳細: 200mM NaCl, 8% Isopropanol, 1mM Tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride (TCEP HCl)

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRL

/ ビームライン: BL14-1 / 波長: 1.1808 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2016年4月26日

放射

モノクロメーター: Si 111 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.1808 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.8→50 Å / Num. obs: 47310 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7.3 % / B_iso Wilson estimate: 30.14 Å² / CC_1/2: 1 / R_merge(I) obs: 0.05 / R_pim(I) all: 0.02 / R_rim(I) all: 0.054 / Χ²: 1.158 / Net I/av σ(I): 38.5 / Net I/σ(I): 12.7

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
1.8-1.83	7.3	0.847	2.3	0.757	0.338	0.913	0.952	100
1.83-1.86	7.3	0.705		0.832	0.281	0.759	0.953	100
1.86-1.9	7.3	0.619		0.864	0.247	0.667	1.066	100
1.9-1.94	7.2	0.566		0.891	0.227	0.61	1.334	100
1.94-1.98	7.3	0.393		0.935	0.156	0.423	1.123	100
1.98-2.03	7.3	0.298		0.963	0.118	0.321	1.137	100
2.03-2.08	7.3	0.27		0.969	0.108	0.291	1.366	100
2.08-2.13	7.3	0.199		0.983	0.079	0.214	1.218	100
2.13-2.2	7.4	0.166		0.986	0.066	0.179	1.263	100
2.2-2.27	7.3	0.174		0.982	0.07	0.188	1.497	100
2.27-2.35	7.3	0.124		0.993	0.049	0.133	1.299	100
2.35-2.44	7.4	0.1		0.995	0.039	0.107	1.314	100
2.44-2.55	7.3	0.085		0.996	0.033	0.091	1.222	100
2.55-2.69	7.3	0.074		0.995	0.029	0.08	1.24	100
2.69-2.86	7.4	0.062		0.998	0.024	0.066	1.237	100
2.86-3.08	7.3	0.058		0.997	0.023	0.063	1.409	100
3.08-3.39	7.3	0.044		0.999	0.017	0.047	1.147	100
3.39-3.88	7.3	0.034		0.999	0.013	0.037	0.911	100
3.88-4.88	7.2	0.025		0.999	0.01	0.027	0.76	99.9
4.88-50	6.9	0.02		1	0.008	0.022	0.733	99.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX	1.10_2155	精密化
PDB_EXTRACT	3.22	データ抽出
HKL-2000		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4C6U

4c6u

解像度: 1.8→49.199 Å / SU ML: 0.17 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 18.93

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1862	1990	4.21 %
R_work	0.1557	-	-
obs	0.157	47247	99.95 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 108.43 Å² / B_iso mean: 37.127 Å² / B_iso min: 19.94 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.8→49.199 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3024	0	71	200	3295
B_iso mean	-	-	54.85	41.46	-
残基数	-	-	-	-	414

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	3173
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.832	4314
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.056	475
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	571
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.541	1883

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 14 / % reflection obs: 100 %

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all
1.8001-1.8451	0.2929	140	0.2319	3198	3338
1.8451-1.895	0.2476	137	0.2162	3169	3306
1.895-1.9508	0.2957	142	0.2283	3189	3331
1.9508-2.0137	0.2246	139	0.1787	3171	3310
2.0137-2.0857	0.2245	145	0.1725	3229	3374
2.0857-2.1692	0.2079	137	0.1582	3187	3324
2.1692-2.268	0.1931	141	0.1655	3211	3352
2.268-2.3875	0.1642	144	0.1604	3202	3346
2.3875-2.5371	0.227	140	0.1604	3219	3359
2.5371-2.733	0.2409	145	0.1672	3237	3382
2.733-3.008	0.1831	141	0.1665	3226	3367
3.008-3.4431	0.1778	145	0.1563	3269	3414
3.4431-4.3376	0.1689	146	0.1343	3305	3451
4.3376-49.2177	0.1472	148	0.1384	3445	3593

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.8974	0.3736	0.2621	1.1917	-0.0317	1.4471	0.142	-0.0467	-0.1935	0.1233	-0.0421	0.2699	0.2741	-0.1442	-0.0917	0.3235	-0.0925	0.0171	0.1797	0.0006	0.3136	26.4192	-17.3551	-13.1708
2	1.711	-0.5184	-0.2706	0.2875	0.2961	1.4641	0.0295	-0.516	-0.4757	0.3075	-0.3452	-0.389	0.6701	0.2749	0.1444	0.4827	-0.0238	-0.0929	0.2663	0.1036	0.3525	47.4234	-18.4983	-3.4409
3	6.5591	3.6644	0.9633	7.228	1.1241	3.0747	0.5874	-0.1548	-0.2642	0.5178	-0.5903	-1.1782	0.7198	1.096	-0.0471	0.3884	0.0438	-0.0642	0.6267	0.1675	0.7188	60.919	-10.6532	-8.7777
4	2.7168	1.3873	1.1376	2.1131	1.5381	2.772	0.2787	-0.3873	-0.3705	0.5634	-0.2583	-0.6462	0.2435	0.2173	0.0095	0.3842	-0.052	-0.1162	0.3026	0.0596	0.3421	51.2923	-13.2589	-6.6978
5	2.2465	-0.6705	0.3909	3.1351	0.6423	1.7069	0.1807	0.325	-0.2144	-0.3039	-0.3003	-0.3951	0.7314	0.272	0.1172	0.4316	0.1144	0.0329	0.2865	0.0292	0.3201	47.6449	-18.0269	-26.6699
6	5.9168	2.0717	0.6856	1.8762	0.1809	1.5164	-0.0278	0.1258	-0.9351	-0.3452	0.027	-0.1789	0.8327	-0.0011	-0.047	0.5533	0.0053	-0.028	0.2099	-0.037	0.331	33.3155	-22.5567	-24.7688
7	3.0256	-3.245	1.9343	5.5412	-4.2096	3.4578	0.1686	0.3763	-0.4185	-0.4218	0.0685	0.5008	0.9047	-0.2133	-0.1499	0.5456	-0.0218	-0.11	0.2978	-0.0807	0.3994	23.2065	-19.729	-34.171
8	1.6834	0.1408	0.1266	1.5677	-0.1054	1.0897	0.1235	-0.156	0.1808	-0.1328	-0.2404	-0.0242	0.0502	0.0235	0.1121	0.2768	0.0161	-0.0195	0.183	-0.004	0.2471	39.2814	-7.5073	-26.1698
9	6.137	0.3211	-0.2229	4.1191	-3.5084	6.281	0.0251	-0.1634	-1.0536	0.0436	-0.3642	-0.9772	0.0787	0.7559	0.3562	0.3365	0.0334	0.0314	0.4282	0.0834	0.5903	59.7361	-2.7918	-34.7323
10	0.7547	-0.243	-0.2114	1.7788	-0.5556	0.8079	0.1672	0.0437	0.0561	-0.1057	-0.174	0.0615	0.075	0.0108	0.005	0.2929	0.0064	-0.0081	0.1905	-0.0275	0.2476	34.7848	-7.519	-24.7354
11	3.0393	-0.8278	0.1565	3.2488	-0.3026	2.1079	0.2857	-0.378	0.1713	0.9786	0.0549	-0.3865	-0.2693	0.1846	-0.2482	0.5437	-0.1135	-0.0945	0.3382	-0.0076	0.3667	49.4409	-2.401	-1.9226
12	4.4637	-0.3393	-2.8685	5.2255	-2.464	3.2248	0.081	-0.7889	-0.3643	0.778	-0.1397	-0.5088	0.3494	0.9005	-0.0692	0.7251	-0.1156	-0.2167	0.5457	0.1308	0.4339	48.5932	-15.2504	5.0551
13	4.4569	-2.1483	-0.1418	1.7295	0.7515	1.7324	0.1235	-0.9508	-0.1925	1.0899	-0.1701	0.1768	-0.1724	0.2253	-0.0555	0.7065	-0.1895	-0.0377	0.3681	0.0362	0.2898	39.7905	-7.502	6.5241
14	0.6897	0.1759	-0.2366	1.5988	-0.8025	0.5109	0.1844	-0.0344	-0.0005	0.2822	-0.183	0.0524	0.1576	0.0258	0.0325	0.3196	-0.0451	-0.0023	0.212	-0.0358	0.2424	35.7749	-11.5526	-11.8997
15	2.6798	0.4344	0.771	2.9763	1.9834	4.3745	0.2677	0.0533	-0.7091	-0.2473	0.0356	0.7528	0.6214	-0.824	-0.2432	0.4545	-0.1624	-0.0796	0.331	-0.0359	0.5287	16.0768	-22.0373	-22.649
16	0.412	0.2235	0.0595	1.7742	-0.4395	1.4188	0.1894	-0.1829	0.0689	0.5811	-0.1328	0.3238	-0.1444	-0.1008	-0.0639	0.3888	-0.0683	0.1066	0.2186	-0.0389	0.2843	25.8394	-0.5646	-5.841
17	2.8777	0.7855	-0.627	2.8288	-3.3147	3.9549	0.1338	-0.5365	0.4877	0.862	0.1868	0.1767	-0.4275	-0.2877	-0.3211	0.5336	-0.068	0.1804	0.313	-0.073	0.4445	20.7282	-1.2201	2.9016
18	0.1209	0.1105	0.0872	0.9412	-0.4174	0.5514	0.1686	-0.2179	-0.0127	0.3834	-0.1784	0.1553	0.0775	0.0382	-0.0054	0.4077	-0.1046	0.0277	0.2266	0.0032	0.2608	31.6508	-14.586	-5.3711
19	5.9602	-2.2383	1.8467	5.1905	-0.6191	2.99	0.0505	-0.3473	0.6165	1.1888	-0.382	0.1354	-0.0777	-0.2642	0.2293	0.881	-0.2121	0.0712	0.4171	0.0004	0.3494	34.0752	-5.5215	10.9881
20	0.4217	-0.5535	0.2487	1.3118	-0.5214	1.5392	0.1495	-0.1592	-0.0873	0.4737	-0.0805	0.3072	0.0359	-0.1619	-0.0235	0.4235	-0.1227	0.0929	0.2477	-0.0127	0.3145	24.9549	-10.9032	-4.2239

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 3:39)	A	3 - 39
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 40:46)	A	40 - 46
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 47:55)	A	47 - 55
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 56:65)	A	56 - 65
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 66:86)	A	66 - 86
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 87:99)	A	87 - 99
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 100:106)	A	100 - 106
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 107:123)	A	107 - 123
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 124:137)	A	124 - 137
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 138:209)	A	138 - 209
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain A and resid 210:220)	A	210 - 220
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain A and resid 221:225)	A	221 - 225
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain A and resid 226:233)	A	226 - 233
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain A and resid 234:250)	A	234 - 250
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain A and resid 251:262)	A	251 - 262
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain A and resid 263:326)	A	263 - 326
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain A and resid 327:333)	A	327 - 333
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain A and resid 334:372)	A	334 - 372
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain A and resid 373:381)	A	373 - 381
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain A and resid 382:416)	A	382 - 416

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 1分子 A

-
非ポリマー , 6種, 208分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 1種, 1分子 A

-非ポリマー , 6種, 208分子

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 1分子 A

-
非ポリマー , 6種, 208分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)