分子量: 5964.977 Da / 分子数: 1 / 断片: X domain, UNP residues 459-509 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: This peptide contains residues S459-P509. The two N-terminal GS residues are left from an N-terminal GST-tag cleaved with thrombin. 由来: (組換発現) Peste-des-petits-ruminants virus (ウイルス) 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q91QS4
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実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
Sample state
Spectrometer-ID
タイプ
1
1
1
isotropic
1
2D 1H-15N HSQC
1
2
1
isotropic
1
3D HNCO
1
3
1
isotropic
1
3D HNCA
1
4
1
isotropic
1
3D HN(CA)CB
1
5
1
isotropic
1
3DHN(COCA)CB
1
8
1
isotropic
1
3DHN(CO)CA
1
7
1
isotropic
1
3DHBHA(CO)NH
1
6
1
isotropic
1
2D NOESY
1
9
1
isotropic
1
3D 1H-15N NOESY
1
12
1
isotropic
1
2D 1H-13C HSQC aliphatic
1
11
2
isotropic
2
2D 1H-13C HSQC aliphatic
1
10
2
isotropic
2
3D (H)CCH-TOCSY
1
13
2
isotropic
2
3D 1H-13C NOESY aliphatic
1
14
2
isotropic
2
2D NOESY
-
試料調製
詳細
タイプ
Solution-ID
内容
Label
溶媒系
solution
1
200 uM [U-13C; U-15N] PPRV_PXD, 20 mM sodium phosphate, 300 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O
13C15N_H2O
93% H2O/7% D2O
solution
2
200 uM [U-13C; U-15N] PPRV_PXD, 20 mM sodium phosphate, 300 mM sodium chloride, 100% D2O
13C15N_D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
200uM
PPRV_PXD
[U-13C; U-15N]
1
20mM
sodiumphosphate
naturalabundance
1
300mM
sodiumchloride
naturalabundance
1
200uM
PPRV_PXD
[U-13C; U-15N]
2
20mM
sodiumphosphate
naturalabundance
2
300mM
sodiumchloride
naturalabundance
2
試料状態
イオン強度: 300 mM / Ionic strength err: 30 / Label: 288K / pH: 7.4 / 圧: 1 bar / 温度: 288.0 K / Temperature err: 0.2
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker AVANCE III
Bruker
AVANCEIII
800
1
Bruker AVANCE III
Bruker
AVANCEIII
950
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
2.2.2
BrukerBiospin
解析
CcpNmr Analysis
2.2.2
CCPN
chemicalshiftassignment
TALOS+
YangShen, NIDDK
データ解析
CcpNmr Analysis
2.2.2
CCPN
peakpicking
CYANA
3.97
Guntert, MumenthalerandWuthrich
structurecalculation
精密化
手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 5
代表構造
選択基準: target function
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20