+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5j98 | ||||||
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Title | Crystal structure of Slow Bee Paralysis Virus at 2.6A resolution | ||||||
Components |
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Keywords | VIRUS / icosahedral virus / honeybee / protrusion | ||||||
Function / homology | Function and homology information host cell membrane / viral capsid / RNA helicase activity / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / structural molecule activity / proteolysis / RNA binding ...host cell membrane / viral capsid / RNA helicase activity / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / structural molecule activity / proteolysis / RNA binding / ATP binding / membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Slow bee paralysis virus | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.6 Å | ||||||
Authors | Kalynych, S. / Levdansky, Y. / Palkova, L. / Plevka, P. | ||||||
Citation | Journal: J.Virol. / Year: 2016 Title: Virion Structure of Iflavirus Slow Bee Paralysis Virus at 2.6-Angstrom Resolution. Authors: Kalynych, S. / Pridal, A. / Palkova, L. / Levdansky, Y. / de Miranda, J.R. / Plevka, P. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5j98.cif.gz | 195.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5j98.ent.gz | 154.2 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5j98.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j9/5j98 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j9/5j98 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 5cdcC 5cddC 5j96SC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
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2 |
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3 |
| x 5||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| x 6||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I60 (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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