PDB-5j32: Isopropylmalate dehydrogenase in complex with isopropylmalate

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5j32

タイトル

Isopropylmalate dehydrogenase in complex with isopropylmalate

要素

3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

キーワード

OXIDOREDUCTASE / dehydrogenase / leucine biosynthesis / glucosinolate biosynthesis

機能・相同性

機能・相同性情報

embryo sac development / 3-isopropylmalate dehydrogenase / 3-isopropylmalate dehydrogenase activity / pollen development / L-leucine biosynthetic process / chloroplast envelope / plastid / chloroplast stroma / NAD+ binding / chloroplast ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.933 Å

データ登録者

Jez, J.M. / Lee, S.G.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2016
タイトル: Structure and Mechanism of Isopropylmalate Dehydrogenase from Arabidopsis thaliana: INSIGHTS ON LEUCINE AND ALIPHATIC GLUCOSINOLATE BIOSYNTHESIS.
著者: Lee, S.G. / Nwumeh, R. / Jez, J.M.

履歴

登録	2016年3月30日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年5月11日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年5月18日	Group: Database references
改定 1.2	2016年7月6日	Group: Database references
改定 1.3	2017年9月27日	Group: Advisory / Author supporting evidence ...Advisory / Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_audit_support ...citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.4	2019年11月27日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.5	2023年9月27日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5j32.cif.gz	583.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5j32.ent.gz	476 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5j32.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5j32_validation.pdf.gz	474.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5j32_full_validation.pdf.gz	481.5 KB	表示
XML形式データ	5j32_validation.xml.gz	65.5 KB	表示
CIF形式データ	5j32_validation.cif.gz	98.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j3/5j32 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j3/5j32	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5j33C 5j34C 3r8wS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4nas-1 3w5f-2 3w7s-1 4q8h-d 3dtu-1 6gs1-d 3jzf-d 1khk-d 2d69-2 6ik7-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#129 - 2010年9月イソクエン酸脱水素酵素 (Isocitrate Dehydrogenase) 類似性 (5) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (5)

登録構造単位

A: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

B: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

C: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

D: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

ヘテロ分子

174 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

B: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
86.8 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

D: 3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
86.8 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	96.059, 49.622, 158.969
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 105.44, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	3-isopropylmalate dehydrogenase 2, chloroplastic / IMDH 2 / Beta-IPM dehydrogenase 2 分子量: 43204.086 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) 遺伝子: IMDH2, IMDH, At1g80560, T21F11.11 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P93832, 3-isopropylmalate dehydrogenase
#2: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 式: Mg
#3: 化合物	ChemComp-IPM / 3-ISOPROPYLMALIC ACID / (2R,3S)-3-イソプロピル-D-リンゴ酸分子量: 176.167 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₁₂O₅
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1434 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.1 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.48 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1.0 M ammonium phosphate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, and 5 mM isopropylmalate

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.979 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2012年10月12日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.93→32.5 Å / Num. obs: 104824 / % possible obs: 96.4 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.15 % / R_sym value: 0.093 / Net I/σ(I): 11
反射シェル	解像度: 1.93→1.96 Å / 冗長度: 3.1 % / R_merge(I) obs: 0.624 / Mean I/σ(I) obs: 2 / % possible all: 92.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.8.1_1168	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3R8W

3r8w

解像度: 1.933→32.475 Å / SU ML: 0.18 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 18.51 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.198	5246	5.01 %
R_work	0.1587	-	-
obs	0.1607	104735	96.08 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.933→32.475 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10948	0	52	1434	12434

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	11222
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.021	15189
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.326	4201
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.066	1746
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	1998

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.9328-1.9548	0.2697	177	0.2045	2790	X-RAY DIFFRACTION	83
1.9548-1.9778	0.2526	167	0.1925	3206	X-RAY DIFFRACTION	93
1.9778-2.0019	0.2319	179	0.1923	3324	X-RAY DIFFRACTION	95
2.0019-2.0272	0.2633	161	0.1885	3183	X-RAY DIFFRACTION	95
2.0272-2.0539	0.2294	174	0.1774	3208	X-RAY DIFFRACTION	93
2.0539-2.082	0.2282	203	0.1765	3266	X-RAY DIFFRACTION	96
2.082-2.1118	0.2301	175	0.1698	3270	X-RAY DIFFRACTION	97
2.1118-2.1433	0.2104	163	0.1709	3249	X-RAY DIFFRACTION	94
2.1433-2.1768	0.2197	173	0.1637	3314	X-RAY DIFFRACTION	97
2.1768-2.2124	0.2184	181	0.16	3348	X-RAY DIFFRACTION	98
2.2124-2.2506	0.1992	157	0.1647	3319	X-RAY DIFFRACTION	94
2.2506-2.2915	0.209	183	0.1617	3325	X-RAY DIFFRACTION	98
2.2915-2.3356	0.2022	200	0.1543	3317	X-RAY DIFFRACTION	97
2.3356-2.3832	0.206	162	0.1597	3296	X-RAY DIFFRACTION	96
2.3832-2.435	0.2067	166	0.1556	3408	X-RAY DIFFRACTION	99
2.435-2.4917	0.1973	176	0.1539	3335	X-RAY DIFFRACTION	96
2.4917-2.5539	0.2262	179	0.1582	3387	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5539-2.623	0.2159	170	0.1612	3367	X-RAY DIFFRACTION	96
2.623-2.7001	0.202	160	0.16	3422	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7001-2.7872	0.1872	189	0.1566	3347	X-RAY DIFFRACTION	97
2.7872-2.8868	0.2065	166	0.1543	3429	X-RAY DIFFRACTION	99
2.8868-3.0023	0.189	164	0.1593	3393	X-RAY DIFFRACTION	98
3.0023-3.1388	0.1974	195	0.1477	3339	X-RAY DIFFRACTION	97
3.1388-3.3041	0.164	163	0.1397	3421	X-RAY DIFFRACTION	98
3.3041-3.5109	0.1942	174	0.1388	3385	X-RAY DIFFRACTION	98
3.5109-3.7816	0.1608	184	0.142	3374	X-RAY DIFFRACTION	97
3.7816-4.1615	0.1839	175	0.1376	3369	X-RAY DIFFRACTION	96
4.1615-4.7621	0.1579	191	0.1399	3317	X-RAY DIFFRACTION	96
4.7621-5.9935	0.1715	176	0.1756	3373	X-RAY DIFFRACTION	95
5.9935-32.4792	0.2122	163	0.1881	3408	X-RAY DIFFRACTION	93

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.3596	0.0705	0.0443	0.8829	-0.138	1.7092	0.0466	-0.2056	0.1715	0.1025	0.0434	0.0917	-0.1754	-0.0075	-0.0869	0.1356	-0.0223	0.0315	0.1349	-0.0104	0.0967	18.8399	9.5734	35.9181
2	0.9847	0.2399	0.0057	0.6558	-0.096	0.7887	0.0119	-0.0858	-0.0715	0.038	-0.0336	-0.0232	0.0753	0.0022	0.0176	0.0818	-0.0052	0.0184	0.081	0.0288	0.0845	26.3769	-3.6797	16.5068
3	1.179	1.2918	0.3059	2.6256	-0.192	2.3037	-0.1341	0.2377	0.4104	-0.1015	0.0165	0.5299	-0.2509	-0.1426	0.0019	0.1282	-0.0156	0.0283	0.1105	0.0373	0.1729	7.4924	8.2654	25.4838
4	2.1857	1.0605	0.6865	0.7393	0.2788	1.2582	0.0988	-0.2021	-0.4372	0.1559	-0.0444	-0.0308	0.1602	0.0711	-0.0056	0.1667	-0.0331	0.0698	0.1487	0.0509	0.1537	12.0691	-6.7963	34.8097
5	1.4459	-0.1287	-0.0504	1.9207	-0.1349	3.2336	0.0335	-0.263	0.02	0.1709	-0.1501	0.3004	-0.0776	-0.3507	0.048	0.1035	-0.0153	0.0586	0.2241	0.0015	0.1734	-2.7243	-1.4921	29.2475
6	1.6718	0.1019	0.3412	1.5462	0.2733	0.847	0.0522	0.1137	-0.1077	-0.0879	0.0446	-0.119	0.0435	0.1588	-0.0276	0.0938	0.0054	0.0738	0.1134	0.0232	0.0865	35.9227	-3.9421	-16.813
7	0.6414	0.0375	0.0349	0.6699	-0.1294	0.8544	0.0026	-0.0013	0.0516	-0.0054	-0.0089	0.0302	-0.0646	-0.0059	0.0052	0.0665	-0.0056	0.0238	0.0639	0.0203	0.0795	23.0279	7.8485	0.4631
8	1.5574	-0.2374	0.163	2.6755	-0.6066	2.2496	0.0218	-0.1075	-0.3305	0.1551	0.0154	-0.0862	0.1853	0.0659	-0.0225	0.0961	-0.0097	0.0058	0.0952	0.031	0.1356	25.7143	-13.0217	-10.8299
9	2.2621	1.7019	0.1952	2.0322	-0.3106	1.1647	-0.0181	0.1612	0.3431	-0.1587	0.1059	0.474	-0.0968	-0.0945	-0.0973	0.096	0.0198	-0.0016	0.1053	0.0116	0.1262	18.4281	-0.1801	-21.5297
10	2.4235	0.2568	-0.1807	3.2403	-1.3336	3.3686	0.0215	0.2371	-0.2497	-0.2804	0.1052	0.0685	0.2464	-0.184	-0.1167	0.108	-0.0221	-0.0309	0.0932	-0.0105	0.1221	13.6495	-15.4787	-19.2714
11	1.7177	-0.6183	0.3716	1.7612	0.4261	0.9804	0.0596	0.2203	-0.0772	-0.1914	-0.039	0.0158	0.0457	0.1075	0.0041	0.1514	0.0077	0.0541	0.1595	0.0097	0.0871	11.1615	6.8926	63.9835
12	1.1352	-0.1347	0.0293	0.9223	-0.1318	0.9061	0.0011	0.0877	0.1127	-0.003	-0.0473	-0.0714	-0.1778	0.0958	0.0343	0.1481	-0.0261	0.0192	0.0982	0.0358	0.0991	9.2934	21.8088	82.9807
13	3.1489	0.6147	-0.271	3.8482	-0.4885	2.9519	-0.0087	-0.083	-0.2428	-0.2695	-0.1696	0.3549	-0.0252	-0.1505	0.1409	0.129	0.0469	-0.0041	0.1235	-0.0141	0.132	-2.813	10.2236	65.5609
14	2.6689	0.4931	0.1854	0.0958	0.0356	1.189	0.0951	0.0549	0.5769	-0.2928	-0.1768	-0.1564	-0.3356	0.0857	0.0247	0.2762	0.006	0.0444	0.1617	0.0727	0.1999	6.2082	25.1095	60
15	1.2706	0.3984	-0.3887	2.6403	-0.7348	2.7156	0.0906	0.4188	0.0437	-0.3908	-0.1436	0.4057	-0.0381	-0.2565	0.0625	0.2326	0.0599	-0.1115	0.2826	0.0009	0.2007	-10.5061	19.7789	58.1289
16	1.154	-0.4022	0.456	1.4509	0.0539	1.6568	-0.0875	0.0621	0.1261	0.1473	0.0785	-0.0942	-0.0431	0.1014	-0.0151	0.1446	-0.004	0.0123	0.1197	0.0228	0.086	1.0576	22.1909	116.3212
17	0.8867	0.0367	-0.0598	0.4797	0.0133	0.7828	-0.0431	-0.0657	-0.0612	-0.0216	0.0188	0.0274	0.0083	-0.0604	0.0242	0.1298	-0.0016	0.0179	0.0794	0.0208	0.0797	-1.7121	10.2715	95.1167
18	2.3188	0.0086	0.297	0.8367	0.146	1.2262	-0.1496	-0.0111	0.3838	-0.1339	-0.0206	-0.2355	-0.1514	0.1028	0.1105	0.1759	-0.019	0.008	0.1303	0.0613	0.1407	-5.1448	31.2629	106.4195
19	1.2241	-0.9785	0.1341	1.7031	-1.3385	1.6556	0.1937	-0.2049	-0.3783	-0.2211	0.0882	0.4601	0.3079	-0.3139	-0.2516	0.1356	-0.0272	-0.0123	0.1711	0.0642	0.1867	-16.9144	18.251	111.5848
20	2.6004	0.1658	0.3145	2.7593	-1.0187	3.753	-0.0419	-0.1398	0.2662	0.3026	0.0823	0.1993	-0.2411	-0.3803	-0.0275	0.158	0.033	0.0482	0.1488	0.0348	0.1815	-19.097	34.363	106.1833

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	CHAIN A AND RESID 31:142
2	X-RAY DIFFRACTION	2	CHAIN A AND RESID 143:316
3	X-RAY DIFFRACTION	3	CHAIN A AND RESID 317:337
4	X-RAY DIFFRACTION	4	CHAIN A AND RESID 338:367
5	X-RAY DIFFRACTION	5	CHAIN A AND RESID 368:399
6	X-RAY DIFFRACTION	6	CHAIN B AND RESID 36:142
7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN B AND RESID 143:316
8	X-RAY DIFFRACTION	8	CHAIN B AND RESID 317:337
9	X-RAY DIFFRACTION	9	CHAIN B AND RESID 338:367
10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN B AND RESID 368:400
11	X-RAY DIFFRACTION	11	CHAIN C AND RESID 41:142
12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN C AND RESID 143:316
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN C AND RESID 317:337
14	X-RAY DIFFRACTION	14	CHAIN C AND RESID 338:367
15	X-RAY DIFFRACTION	15	CHAIN C AND RESID 368:396
16	X-RAY DIFFRACTION	16	CHAIN D AND RESID 38:142
17	X-RAY DIFFRACTION	17	CHAIN D AND RESID 143:316
18	X-RAY DIFFRACTION	18	CHAIN D AND RESID 317:337
19	X-RAY DIFFRACTION	19	CHAIN D AND RESID 338:367
20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN D AND RESID 368:397

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)