PDB-5j0b: Structure of the immune receptor CD33 in complex with 6'-sialyllactose

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5j0b

タイトル

Structure of the immune receptor CD33 in complex with 6'-sialyllactose

要素

Myeloid cell surface antigen CD33

キーワード

IMMUNE SYSTEM / IMMUNE RECEPTOR / SIGLEC / IG-LIKE / SIALIC-ACID BINDING

機能・相同性

機能・相同性情報

immune response-inhibiting signal transduction / protein tyrosine phosphatase activator activity / negative regulation of monocyte activation / sialic acid binding / Fc-gamma receptor signaling pathway / negative regulation of interleukin-8 production / negative regulation of interleukin-1 beta production / tertiary granule membrane / negative regulation of tumor necrosis factor production / specific granule membrane ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.48 Å

データ登録者

Dodd, R.B.

資金援助

英国, 1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: STRUCTURE OF LIGAND BOUND CD33 RECEPTOR ASSOCIATED WITH ALZHEIMER'S DISEASE
著者: Dodd, R.B. / Meadows, W. / Qamar, S. / Johnson, C.M. / Kronenberg-Versteeg, D. / St George-Hyslop, P.

履歴

登録	2016年3月28日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年4月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_oper_list / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 2.2	2024年10月16日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5j0b.cif.gz	501.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5j0b.ent.gz	426.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5j0b.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5j0b_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5j0b_full_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示
XML形式データ	5j0b_validation.xml.gz	31.2 KB	表示
CIF形式データ	5j0b_validation.cif.gz	41.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j0/5j0b ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j0/5j0b	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5j06C 5ihbS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5ihb-1 5j06-1 2kdf-d 6ana-d 2hqh-d 4gc8-d 6p6y-d 1t6s-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#186 - 2015年6月終末糖化産物受容体 (Receptor for Advanced Glycation End Products) 類似性 (2) #267 - 2022年3月血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF) 類似性 (2) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (2) #132 - 2010年12月アデノウイルス (Adenovirus) 類似性 (2) #169 - 2014年1月 HIV外被糖タンパク質 (HIV Envelope Glycoprotein) 類似性 (2)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#186 - 2015年6月
終末糖化産物受容体 (Receptor for Advanced Glycation End Products)
類似性 (2)
#267 - 2022年3月
血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF)
類似性 (2)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (2)
#132 - 2010年12月
アデノウイルス (Adenovirus)
類似性 (2)
#169 - 2014年1月
HIV外被糖タンパク質 (HIV Envelope Glycoprotein)
類似性 (2)

登録構造単位

A: Myeloid cell surface antigen CD33

B: Myeloid cell surface antigen CD33

C: Myeloid cell surface antigen CD33

D: Myeloid cell surface antigen CD33

ヘテロ分子

105 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Myeloid cell surface antigen CD33

D: Myeloid cell surface antigen CD33

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
51.9 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: Myeloid cell surface antigen CD33

ヘテロ分子

B: Myeloid cell surface antigen CD33

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
52.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	64.490, 123.680, 141.600
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質

Myeloid cell surface antigen CD33 / Sialic acid-binding Ig-like lectin 3 / Siglec-3 / gp67

分子量: 25052.139 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 21-232 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: CD33, SIGLEC3 / プラスミド: pHLSec / 細胞株 (発現宿主): HEK 293-F / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P20138

#2: 多糖

N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-beta-D-galactopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 471.411 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca2-6DGalpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,2,1/[a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2/a6-b2	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Galp]{[(6+2)][a-D-Neup5Ac]{}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#4: 化合物

ChemComp-PG0 / 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL / PEG 6000

分子量: 120.147 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₅H₁₂O₃ / コメント: 沈殿剤*YM

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 25 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.8 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.1 %
結晶化	温度: 295.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 2% PEG 20,000, 4% PEG MME 500, 100 MM BICINE/TRIS BASE PH 8.5, 1XMORPHEUS AMINO ACIDS. CRYSTALS SOAKED IN 20 MM 6'-SIALYLLACTOSE IN MOTHER LIQUOR FOR 10 DAYS.

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Diamond / ビームライン: I04-1 / 波長: 0.92 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年5月8日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.92 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.48→42.57 Å / Num. obs: 39754 / % possible obs: 97.18 % / Observed criterion σ(F): 1.34 / 冗長度: 3.9 % / B_iso Wilson estimate: 62.56 Å² / CC_1/2: 0.989 / R_merge(I) obs: 0.099 / Net I/σ(I): 8.05
反射シェル	解像度: 2.48→2.569 Å / 冗長度: 4.1 % / R_merge(I) obs: 0.9263 / Mean I/σ(I) obs: 1.28 / % possible all: 98

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(dev_2313: ???)	精密化
xia2		データ削減
XSCALE		データスケーリング
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 5IHB

5ihb

解像度: 2.48→42.57 Å / SU ML: 0.41 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 32.76

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2513	1909	4.8 %	RANDOM
R_work	0.2294	-	-	-
obs	0.2305	39740	97.18 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 79.79 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.48→42.57 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6636	0	280	25	6941

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	7118
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.586	9725
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	8.813	4210
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.045	1126
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	1240

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.48-2.5421	0.4365	106	0.424	2675	X-RAY DIFFRACTION	98
2.5421-2.6108	0.4363	124	0.4035	2704	X-RAY DIFFRACTION	98
2.6108-2.6876	0.3722	145	0.3644	2711	X-RAY DIFFRACTION	98
2.6876-2.7743	0.352	125	0.3176	2692	X-RAY DIFFRACTION	99
2.7743-2.8735	0.3571	144	0.3133	2683	X-RAY DIFFRACTION	98
2.8735-2.9885	0.3295	145	0.3032	2666	X-RAY DIFFRACTION	97
2.9885-3.1245	0.3222	146	0.3108	2644	X-RAY DIFFRACTION	97
3.1245-3.2891	0.3696	141	0.2824	2650	X-RAY DIFFRACTION	96
3.2891-3.4951	0.3028	149	0.2612	2645	X-RAY DIFFRACTION	96
3.4951-3.7648	0.2446	128	0.2442	2697	X-RAY DIFFRACTION	96
3.7648-4.1434	0.2203	126	0.2066	2720	X-RAY DIFFRACTION	97
4.1434-4.7423	0.1633	126	0.1569	2752	X-RAY DIFFRACTION	98
4.7423-5.9722	0.1776	141	0.1767	2811	X-RAY DIFFRACTION	99
5.9722-42.5763	0.2358	163	0.1975	2781	X-RAY DIFFRACTION	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.9981	0.3011	0.3774	2.7357	1.4513	3.1346	0.2107	0.4329	-0.0934	-0.1653	-0.0313	0.1132	-0.2965	-0.0869	-0.2727	0.4617	0.0781	0.0076	0.6231	0.0474	0.5051	15.1573	38.8156	-17.1258
2	3.9174	-1.5466	-2.0107	3.5446	0.3936	5.8701	0.0056	-0.1903	0.177	0.1652	0.099	-0.1696	0.3541	0.9752	-0.2326	0.4936	0.0528	-0.0144	0.622	-0.0497	0.5574	21.3241	34.233	-9.8308
3	2.5392	0.4778	-0.0142	1.9035	0.4548	1.7054	0.073	0.2842	0.3057	-0.1395	-0.0725	-0.0512	-0.4539	0.168	0.0378	0.3703	0.046	-0.0038	0.5062	-0.0884	0.5624	14.4517	38.7767	-7.6412
4	3.5371	-0.5398	-1.1529	3.5121	-0.5477	3.5662	0.1511	-0.3643	-0.0902	0.2427	0.0962	0.0976	-0.4257	-0.4921	-0.2519	0.5975	-0.1072	-0.041	0.7598	-0.0067	0.5695	10.6275	19.505	19.1287
5	2.2834	2.8408	2.3106	4.6209	3.0792	2.3657	0.0009	0.0469	-0.1738	-0.0968	0.0368	-0.1004	0.1559	0.1573	0.0397	0.5992	-0.1051	-0.0661	0.4104	0.0768	0.6649	10.5373	-3.7584	-3.5616
6	5.0089	-0.7479	1.0185	5.5936	-0.3236	6.3783	0.025	-1.1556	0.5273	1.7223	-0.5413	0.6517	-0.7933	-1.498	0.4427	0.8782	-0.1632	0.0229	0.8683	-0.1874	1.0032	-2.4993	-2.02	0.1691
7	3.7349	0.099	0.0182	2.7951	-0.2545	3.0577	-0.1624	-1.1845	-0.0924	0.7201	-0.2382	0.1294	-0.1162	-0.5571	0.1865	0.6689	-0.1698	-0.0632	0.5432	0.0228	0.7111	3.4195	-10.167	-2.7535
8	1.8458	1.9384	1.1753	4.2011	2.7608	2.4419	-0.0714	0.1659	0.5055	-0.2695	-0.3501	0.6021	-0.4495	-0.0916	0.338	0.6971	-0.0597	-0.0874	0.5783	0.1055	0.7047	2.7688	-8.6422	-11.8974
9	4.1192	0.7428	0.5037	2.7302	-0.5453	2.88	0.0995	0.3551	-0.618	0.2548	0.1661	-0.4397	0.6036	0.2168	-0.2659	0.6467	-0.0168	-0.018	0.5091	-0.0871	0.5764	-5.2736	-38.9182	-21.7181
10	4.6295	0.2675	-0.4232	4.4689	0.3425	3.6209	-0.1235	0.7963	0.1128	-0.0162	-0.0801	0.4086	-0.1914	-0.4985	0.1196	0.7632	-0.0414	0.0536	0.9309	-0.0451	0.6133	-6.2695	-33.3082	-27.6726
11	3.5315	-1.528	-0.1116	3.5316	-0.1424	3.3653	0.0698	0.417	-0.1292	-0.0997	0.0024	-0.5904	0.407	0.9084	-0.0577	0.4739	0.1265	-0.0194	0.6598	-0.0007	0.583	18.6364	-37.686	-14.9319
12	2.2996	-0.5489	0.0318	2.1346	0.1603	5.4822	-0.1129	0.4472	0.0422	0.0092	0.0288	-0.278	0.1392	0.6811	0.0921	0.5079	0.0059	-0.0352	0.698	0.0316	0.6667	15.1273	-32.5992	-9.891
13	5.2905	-0.6084	1.5128	6.3147	0.191	5.1298	-0.1096	-0.5997	0.0536	0.0336	-0.1738	0.4948	-0.2391	-0.8817	0.2297	0.5062	0.1029	-0.0625	0.6397	-0.0566	0.5752	10.7788	-25.3956	21.5259
14	3.4366	1.3573	-1.1729	3.281	0.336	3.459	-0.3443	1.0748	-0.2004	-1.1048	0.2637	-0.6394	0.1206	0.5002	0.0572	0.9152	-0.1323	0.135	0.779	-0.1099	0.7726	38.3471	8.7578	-17.2331
15	6.6969	1.0111	-2.7757	1.7553	-0.6577	5.4298	-0.0488	0.9569	0.2414	-1.1229	0.1687	-0.4373	-0.1212	-0.0969	-0.0756	1.0558	-0.0084	0.1745	0.6217	-0.0184	0.9849	35.9836	13.4275	-12.7362
16	3.2792	0.858	-0.8834	2.3873	-0.5405	1.4262	-0.0047	-0.212	-0.382	-0.4686	0.0061	-0.338	0.0673	0.2537	-0.069	0.5119	-0.0669	-0.0218	0.4422	0.0452	0.62	31.6482	13.88	5.6946
17	3.8904	0.5867	2.1422	1.8012	1.6647	8.7468	0.2564	-1.296	-0.4102	0.6375	-0.2953	0.1076	0.785	-0.8858	0.1577	0.5811	-0.1494	0.0024	0.7433	0.1407	0.6076	23.8586	14.8208	23.1649

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 20 through 68 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 69 through 113 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 114 through 149 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 150 through 232 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 19 through 62 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 63 through 82 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 83 through 102 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 103 through 149 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 150 through 216 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 217 through 232 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 20 through 92 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 93 through 149 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 150 through 231 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 23 through 82 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 83 through 102 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 103 through 200 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 201 through 231 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)