- PDB-4ngh: Crystal structure of the HIV-1 neutralizing antibody 4E10 Fab fra... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4ngh
タイトル
Crystal structure of the HIV-1 neutralizing antibody 4E10 Fab fragment in complex with a hydrocarbon-stapled peptide containing the 4e10 epitope on gp41 and a tethered phosphate moiety.
要素
FAB HEAVY CHAIN
FAB LIGHT CHAIN
MODIFIED FRAGMENT OF HIV GLYCOPROTEIN (GP41)
キーワード
IMMUNE SYSTEM / IMMUNOGLOBULIN FOLD / BETA-SANDWICH / 4E10 FAB / ANTIBODY-EPITOPE COMPLEX / GP41 HIV-1 / HYDROCARBON STAPLE
分子量: 23395.850 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) 発現宿主: Cricetulus griseus (モンゴルキヌゲネズミ) 株 (発現宿主): CHO cells
#2: 抗体
FABHEAVYCHAIN
分子量: 23990.027 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) 発現宿主: Cricetulus griseus (モンゴルキヌゲネズミ) 株 (発現宿主): CHO cells
#3: タンパク質・ペプチド
MODIFIEDFRAGMENTOFHIVGLYCOPROTEIN (GP41)
タイプ: Peptide-like / クラス: Unknown / 分子量: 2284.614 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: THIS SEQUENCE INCLUDES A MODIFIED FRAGMENT OF THE HIV ENVELOPE PROTEIN GP41 参照: Stapled peptide (ACE)NWFNITN(DIV)LW(MK8)I(LYV)KKK
THE STAPLED PEPTIDES IN THE STRUCTURE WAS OBTAINED BY INCORPORATION OF (R)-2-(((9H-FLUOREN-9-YL) ...THE STAPLED PEPTIDES IN THE STRUCTURE WAS OBTAINED BY INCORPORATION OF (R)-2-(((9H-FLUOREN-9-YL)METHOXY)CARBONYLAMINO)-2-METHYL-PENT-4-ENOIC ACID AT THE POSITION 678 AND (S)-2-(((9H-FLUOREN-9-YL)METHOXY)CARBONYLAMINO)-2-METHYL-HEPT-6-ENOIC ACID AT THE POSITION 681
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実験情報
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実験
実験
手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1
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試料調製
結晶
マシュー密度: 3.16 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.02 %
結晶化
温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: Reservoir solution:0.2 M MgCl2, 0.1 M MES pH5.5, 40% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K