登録情報 | データベース: PDB / ID: 4lsy |
---|
タイトル | Crystal structure of copper-bound L66S mutant toxin from Helicobacter pylori |
---|
要素 | Uncharacterized protein, Toxin |
---|
キーワード | TOXIN / Toxin-antitoxin / Copper bound |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
mRNA catabolic process / translational termination / RNA endonuclease activity / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Toxin-antitoxin system, YafQ-like toxin / Bacterial toxin of type II toxin-antitoxin system, YafQ / ParE toxin of type II toxin-antitoxin system, parDE / RelE-like / Toxin-antitoxin system, RelE/ParE toxin family / YaeB-like fold / Toxin-antitoxin system, RelE/ParE toxin domain superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 COPPER (II) ION / CITRATE ANION / Addiction module toxin RelE類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Helicobacter pylori (ピロリ菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.895 Å |
---|
データ登録者 | Lee, B.J. / Im, H. / Pathak, C.C. / Yoon, H.J. |
---|
引用 | ジャーナル: Biochim.Biophys.Acta / 年: 2013 タイトル: Crystal structure of apo and copper bound HP0894 toxin from Helicobacter pylori 26695 and insight into mRNase activity 著者: Pathak, C. / Im, H. / Yang, Y.J. / Yoon, H.J. / Kim, H.M. / Kwon, A.R. / Lee, B.J. |
---|
履歴 | 登録 | 2013年7月23日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
---|
改定 1.0 | 2014年2月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|