登録情報 | データベース: PDB / ID: 4liu |
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タイトル | Structure of YcfD, a Ribosomal oxygenase from Escherichia coli. |
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要素 | 50S ribosomal protein L16 arginine hydroxylase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / JmjC Domain / Dioxygenase / Hydroxylation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
[50S ribosomal protein L16]-arginine 3-hydroxylase / histone H3K36 demethylase activity / histone H3K4 demethylase activity / 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity / post-translational protein modification / ferrous iron binding / protein homodimerization activity類似検索 - 分子機能 50S ribosomal protein L16 arginine hydroxylase; Chain A, Domain 2 / ROXA-like, winged helix / ROXA-like winged helix / JmjC domain-containing / JmjC domain / Malonyl-Coenzyme A Acyl Carrier Protein; domain 2 / Cupin / A domain family that is part of the cupin metalloenzyme superfamily. / JmjC domain / JmjC domain profile. ...50S ribosomal protein L16 arginine hydroxylase; Chain A, Domain 2 / ROXA-like, winged helix / ROXA-like winged helix / JmjC domain-containing / JmjC domain / Malonyl-Coenzyme A Acyl Carrier Protein; domain 2 / Cupin / A domain family that is part of the cupin metalloenzyme superfamily. / JmjC domain / JmjC domain profile. / Jelly Rolls / Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHATE ION / Ribosomal protein uL16 3-hydroxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.7 Å |
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データ登録者 | Brissett, N.C. / Doherty, A.J. / Fox, G.C. |
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2014 タイトル: Ribosomal oxygenases are structurally conserved from prokaryotes to humans. 著者: Chowdhury, R. / Sekirnik, R. / Brissett, N.C. / Krojer, T. / Ho, C.H. / Ng, S.S. / Clifton, I.J. / Ge, W. / Kershaw, N.J. / Fox, G.C. / Muniz, J.R. / Vollmar, M. / Phillips, C. / Pilka, E.S. ...著者: Chowdhury, R. / Sekirnik, R. / Brissett, N.C. / Krojer, T. / Ho, C.H. / Ng, S.S. / Clifton, I.J. / Ge, W. / Kershaw, N.J. / Fox, G.C. / Muniz, J.R. / Vollmar, M. / Phillips, C. / Pilka, E.S. / Kavanagh, K.L. / von Delft, F. / Oppermann, U. / McDonough, M.A. / Doherty, A.J. / Schofield, C.J. |
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履歴 | 登録 | 2013年7月3日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年5月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年6月25日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2014年7月9日 | Group: Database references |
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