PDB-4k2p: The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4k2p

タイトル

The Structure of a Quintuple Mutant of the Tiam1 PH-CC-Ex Domain

要素

T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

キーワード

SIGNALING PROTEIN / PH and coiled coil domain / phosphoinositide binding / protein-protein interaction / Par-3 / tight junctions

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of non-canonical Wnt signaling pathway / regulation of dopaminergic neuron differentiation / Activated NTRK2 signals through CDK5 / regulation of epithelial to mesenchymal transition / cell-cell contact zone / activation of GTPase activity / positive regulation of axonogenesis / regulation of small GTPase mediated signal transduction / Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway / small GTPase-mediated signal transduction ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.98 Å

データ登録者

Joshi, M. / Gakhar, L. / Fuentes, E.J.

引用

ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.F / 年: 2013
タイトル: High-resolution structure of the Tiam1 PHn-CC-Ex domain.
著者: Joshi, M. / Gakhar, L. / Fuentes, E.J.

履歴

登録	2013年4月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年7月10日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年9月11日	Group: Database references
改定 1.2	2023年9月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4k2p.cif.gz	563.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4k2p.ent.gz	473 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4k2p.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4k2p_validation.pdf.gz	464.8 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4k2p_full_validation.pdf.gz	470.5 KB	表示
XML形式データ	4k2p_validation.xml.gz	41.1 KB	表示
CIF形式データ	4k2p_validation.cif.gz	60 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k2/4k2p ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k2/4k2p	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4k2oC 3a8pS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1y82-3 3wx6-d 4jds-4 4ahx-d 3qy2-d 4d6n-2 5h4g-d 3c0w-d 5o6i-1 3a8p-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (5) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (5) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (10) #222 - 2018年6月タンパク質とナノ粒子 (Proteins and Nanoparticles) 類似性 (4) #35 - 2002年11月フェリチンとトランスフェリン (Ferritin and Transferrin) 類似性 (5) #68 - 2005年8月神経栄養因子 (Neurotrophins) 類似性 (1) #43 - 2003年7月 Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase) 類似性 (2) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (2) #88 - 2007年4月クラスリン (Clathrin) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

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「今月の分子」の関連する項目

#195 - 2016年3月
RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases)
類似性 (5)
#245 - 2020年5月
スプライソソーム (Spliceosomes)
類似性 (5)
#148 - 2012年4月
Rasタンパク質 (Ras Protein)
類似性 (10)
#222 - 2018年6月
タンパク質とナノ粒子 (Proteins and Nanoparticles)
類似性 (4)
#35 - 2002年11月
フェリチンとトランスフェリン (Ferritin and Transferrin)
類似性 (5)
#68 - 2005年8月
神経栄養因子 (Neurotrophins)
類似性 (1)
#43 - 2003年7月
Srcチロシンキナーゼ (Src Tyrosine Kinase)
類似性 (2)
#60 - 2004年12月
ユビキチン (Ubiquitin)
類似性 (2)
#88 - 2007年4月
クラスリン (Clathrin)
類似性 (1)

登録構造単位

A: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

B: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

C: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

D: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

ヘテロ分子

125 kDa, 4 ポリマー
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1

A: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.2 kDa, 1 ポリマー
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2

B: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.2 kDa, 1 ポリマー
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3

C: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.2 kDa, 1 ポリマー
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4

D: T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.2 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	80.507, 70.111, 87.753
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.19, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1

NCSドメイン領域: (Selection details: chain 'D' and segid 'A' RESTRAINED TORSIONS: 4462 Histogram of...)

#1: タンパク質	T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1 / TIAM-1 分子量: 31163.852 Da / 分子数: 4 / 断片: PH-CC-Ex domain (UNP residues 429-702) / 変異: K596A, K597A, K598A, M580L, M586L / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: TIAM1 / Plasmid details: contains GB1-rTEV fusion / プラスミド: modified pQE30 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): M15[pREP4] / 参照: UniProt: Q13009
#2: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 749 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 1.99 Å³/Da / 溶媒含有率: 38.09 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, 19% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 4.2.2 / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: NOIR-1 / 検出器: CCD / 日付: 2010年4月7日
放射	モノクロメーター: double crystal Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.98→19.703 Å / Num. obs: 67495 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.9 % / B_iso Wilson estimate: 23.61 Å² / R_merge(I) obs: 0.047 / Net I/σ(I): 14.3
反射シェル	解像度: 1.98→2.09 Å / 冗長度: 2.8 % / R_merge(I) obs: 0.357 / Mean I/σ(I) obs: 2.3 / Num. unique all: 9690 / % possible all: 97.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Blu-Ice		データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.8.2_1309)	精密化
XDS		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3A8P

3a8p

解像度: 1.98→19.703 Å / SU ML: 0.23 / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 27.82 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2359	3300	4.96 %
R_work	0.1917	-	-
obs	0.1938	66467	97.5 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.98→19.703 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7457	0	5	749	8211

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	7674
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.955	10398
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.669	2775
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.038	1157
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1291

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Refine-ID	タイプ	Auth asym-ID
1	1	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
1	2	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	D

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.98-2.0083	0.6045	91	0.6269	1720	X-RAY DIFFRACTION	64
2.0083-2.0382	0.3507	118	0.2943	2630	X-RAY DIFFRACTION	98
2.0382-2.07	0.3105	149	0.2627	2654	X-RAY DIFFRACTION	99
2.07-2.1039	0.2918	120	0.2433	2647	X-RAY DIFFRACTION	99
2.1039-2.1402	0.2748	147	0.2231	2690	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1402-2.179	0.2253	140	0.2215	2673	X-RAY DIFFRACTION	100
2.179-2.2209	0.26	135	0.2141	2678	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2209-2.2662	0.2573	143	0.2328	2612	X-RAY DIFFRACTION	97
2.2662-2.3154	0.2705	154	0.2011	2645	X-RAY DIFFRACTION	99
2.3154-2.3691	0.3127	127	0.2094	2720	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3691-2.4283	0.2472	155	0.2036	2676	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4283-2.4938	0.2516	140	0.1988	2656	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4938-2.567	0.2362	158	0.2018	2654	X-RAY DIFFRACTION	100
2.567-2.6497	0.2365	147	0.1873	2678	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6497-2.7442	0.2537	117	0.2044	2719	X-RAY DIFFRACTION	99
2.7442-2.8537	0.268	133	0.2017	2658	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8537-2.9832	0.2413	135	0.2044	2715	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9832-3.1399	0.2434	160	0.194	2692	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1399-3.3357	0.2324	148	0.1812	2668	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3357-3.5919	0.2331	134	0.1737	2677	X-RAY DIFFRACTION	99
3.5919-3.9507	0.2234	155	0.1544	2611	X-RAY DIFFRACTION	97
3.9507-4.5163	0.1661	142	0.1431	2653	X-RAY DIFFRACTION	98
4.5163-5.6676	0.1554	123	0.1589	2707	X-RAY DIFFRACTION	98
5.6676-19.7037	0.2208	129	0.1723	2734	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.6696	-1.3958	1.1299	4.2454	-0.8708	4.3826	0.2704	-0.0401	-0.4912	0.1614	-0.1891	0.014	0.352	-0.0831	-0.0125	0.1497	-0.0846	-0.0194	0.0988	-0.0079	0.1888	29.0887	6.5833	4.2709
2	7.7104	-0.3202	1.2207	2.7074	-0.4221	5.6168	0.1774	-0.4324	-0.5933	0.2595	0.086	0.0004	0.5203	-0.2405	-0.1848	0.193	-0.0643	-0.0605	0.2017	0.0671	0.2294	21.9152	7.2661	-2.4943
3	4.9025	1.0077	2.8602	2.8529	0.1209	4.1656	-0.0045	0.1443	-0.3458	-0.0955	0.1534	0.0844	0.2543	-0.178	-0.1206	0.1817	0.015	-0.0009	0.1812	-0.0024	0.2166	24.4857	10.9612	-1.6478
4	5.8952	-0.3244	-3.9501	3.0894	2.6805	7.9706	-0.0858	-0.3906	0.2985	0.2375	0.0785	0.0797	-0.4833	-0.8116	-0.0386	0.1961	0.094	-0.0207	0.2481	-0.0349	0.2318	21.0415	22.0123	8.7102
5	8.2045	-2.1835	5.9248	2.8869	-1.8058	5.8548	-0.0553	-1.3932	0.5723	-0.027	-0.0099	-0.13	-0.3021	-0.1042	0.1403	0.2291	-0.0475	0.0428	0.3971	-0.1049	0.2672	41.7059	24.2147	25.6598
6	5.21	-1.1956	4.4858	2.4545	-1.8842	8.0365	-0.188	-0.1898	0.1251	-0.171	0.033	-0.0449	-0.2397	0.1568	0.1997	0.2035	-0.034	-0.0025	0.2138	-0.0373	0.1906	40.21	19.986	16.7721
7	3.3759	-2.4184	3.1226	7.9688	2.1806	6.5557	-0.2951	0.1862	-0.1985	0.1181	0.1973	-0.0635	-0.0099	0.3063	0.1891	0.1712	-0.0359	0.0123	0.2679	0.0451	0.1813	42.1915	10.4917	9.1973
8	4.6544	-0.4098	2.3309	3.1486	-0.4247	4.8772	0.245	-0.0628	-0.2761	-0.0742	-0.0437	0.0402	0.3482	-0.075	-0.1452	0.2159	-0.0122	-0.0145	0.3141	0.0005	0.2091	2.3321	9.5536	32.2827
9	3.3116	0.1368	2.0357	0.5114	-0.2763	2.2584	-0.0765	-0.134	0.1024	0.1035	0.0251	-0.0336	-0.1436	-0.0311	0.0609	0.2052	0.0325	0.0016	0.2058	-0.0403	0.1849	-10.2695	20.0233	15.4697
10	4.9792	-0.4867	-1.5748	2.1453	0.7243	4.5536	0.0746	-0.3344	0.4383	0.2453	0.0732	-0.0554	-0.4782	0.3665	-0.1267	0.2316	-0.0364	-0.0049	0.1773	-0.0221	0.2484	15.6469	-10.1349	13.2222
11	4.8108	2.9244	-2.5298	4.8826	-0.9622	3.5379	0.1227	-0.1972	0.075	-0.0642	-0.0386	-0.4085	-0.4339	0.6037	-0.0922	0.2032	-0.0483	-0.0087	0.2988	-0.0061	0.2465	21.5913	-11.009	13.7291
12	4.3779	-0.1664	-3.1492	4.1712	-0.0037	4.6765	0.0493	0.5257	0.2479	-0.337	0.0447	0.0846	-0.2488	-0.463	-0.0362	0.1541	-0.0147	-0.0076	0.1667	0.0107	0.2546	8.9991	-16.328	9.0812
13	3.3704	-0.4097	1.1255	2.4982	-1.6834	8.6167	-0.2039	-0.7806	-0.1903	0.1791	0.012	-0.177	0.2293	0.6238	0.2189	0.1256	0.0499	0.0203	0.3644	0.0541	0.2689	19.0344	-24.8417	20.9136
14	4.1998	-1.8651	-4.0366	2.3063	0.6657	4.7548	0.1195	-1.0166	-0.1315	-0.1833	-0.0631	-0.0693	0.2721	0.5191	0.0992	0.2356	0.0111	-0.0397	0.314	0.0437	0.25	-1.9256	-26.5683	37.847
15	6.8476	-1.6387	-6.1504	1.8135	2.3633	7.9071	-0.182	-0.278	-0.1908	-0.1033	0.0023	0.0149	-0.0133	0.2354	0.2065	0.1798	0.0118	-0.0209	0.1537	0.0462	0.1946	-0.1912	-22.3471	28.8674
16	8.4699	-1.4732	-0.4166	8.5984	0.7503	6.3906	-0.0169	-0.0304	0.3387	0.0801	0.1069	-0.0604	-0.4401	-0.1553	-0.1089	0.1611	-0.0073	0.0294	0.17	-0.0261	0.1238	-1.9364	-12.9544	21.4834
17	2.9742	-0.4097	-1.8223	2.2028	0.3314	1.1033	0.1391	0.5159	0.2679	-0.0659	0.0207	0.0679	-0.2526	-0.7631	-0.1027	0.2627	0.1097	-0.0098	0.6992	0.0608	0.2528	37.6014	-11.807	44.6575
18	3.2879	-0.2949	3.3697	1.135	1.6307	6.7525	-0.0929	0.2108	0.1475	-0.0165	-0.0475	-0.0318	0.4977	-1.332	0.1048	0.331	-0.1939	0.0699	0.9391	-0.0162	0.3034	34.1727	-24.3455	35.1257
19	5.4466	2.4764	-5.186	2.3834	-1.2857	5.993	0.0597	0.4778	-0.1419	0.1802	-0.0586	-0.0626	0.395	-0.5717	0.1247	0.268	-0.0472	-0.0278	0.3161	-0.015	0.2056	55.0265	-26.619	18.2777
20	4.1306	0.138	-2.8643	0.6173	0.5551	4.9376	-0.0405	0.0784	-0.0858	0.0952	0.1177	-0.0565	0.2266	-0.4274	-0.0534	0.2148	0.0167	-0.0328	0.2636	0.0078	0.2032	54.0015	-19.1872	29.5568

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 433 through 456 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 457 through 477 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 478 through 531 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 532 through 558 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 559 through 593 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 594 through 644 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 645 through 670 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 433 through 531 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 532 through 670 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 433 through 477 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 478 through 504 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 505 through 531 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 532 through 558 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 559 through 593 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 594 through 644 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 645 through 670 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 434 through 531 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 532 through 558 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 559 through 593 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 594 through 670 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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