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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4hv6 | ||||||
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Title | Structure of MNTR H77A mutant in apo- and mn-bound forms | ||||||
![]() | Transcriptional regulator MntR | ||||||
![]() | TRANSCRIPTION / WINGED HELIX-TURN-HELIX / TRANSCRIPTION REGULATOR / METALLOREGULATOR | ||||||
Function / homology | ![]() intracellular manganese ion homeostasis / manganese ion binding / protein dimerization activity / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Glasfeld, A. / Grauer-Gray, K. / McGuire, A. | ||||||
![]() | ![]() Title: Roles of the A and C sites in the manganese-specific activation of MntR. Authors: McGuire, A.M. / Cuthbert, B.J. / Ma, Z. / Grauer-Gray, K.D. / Brunjes Brophy, M. / Spear, K.A. / Soonsanga, S. / Kliegman, J.I. / Griner, S.L. / Helmann, J.D. / Glasfeld, A. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
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PDB format | ![]() | 98.9 KB | Display | ![]() |
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Others | ![]() |
-Validation report
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Full document | ![]() | 439.3 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 11.5 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 14.6 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 3r60C ![]() 3r61C ![]() 4hv5C ![]() 4hx4C ![]() 4hx7C ![]() 4hx8C ![]() 1on2S C: citing same article ( S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
| ||||||||
2 | ![]()
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 16588.865 Da / Num. of mol.: 2 / Fragment: MNTR (unp residues 2-142) / Mutation: H77A Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() Strain: 168 / Gene: BSU24520, mntR, yqhN / Production host: ![]() ![]() #2: Chemical | #3: Chemical | ChemComp-MG / | #4: Water | ChemComp-HOH / | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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-
Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.04 Å3/Da / Density % sol: 39.83 % |
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Crystal grow | Temperature: 293 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 8.5 Details: 16% ETHOXYETHANOL,4% ETHYLENE GLYCOL, 90 MM MGCL2, 60 MM TRIS HCL, 1 MM MNSO4, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K |
---|---|
Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: ADSC QUANTUM 315r / Detector: CCD / Date: Aug 15, 2007 |
Radiation | Monochromator: SI(111) / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 2.3→44.8 Å / Num. obs: 12767 / % possible obs: 99.4 % / Rmerge(I) obs: 0.081 / Net I/σ(I): 11.2 |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]() Starting model: 1ON2 Resolution: 2.3→44.8 Å / Stereochemistry target values: ML
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 2.3→44.8 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell | Resolution: 2.3→2.42 Å /
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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