PDB-4dqf: Crystal Structure of (G16A/L38A) HIV-1 Protease in Complex with DRV

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4dqf

タイトル

Crystal Structure of (G16A/L38A) HIV-1 Protease in Complex with DRV

要素

Aspartyl protease

キーワード

HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / HIV-1 protease / drug resistance / drug design / Protease inhibitors / AIDS / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

HIV-1 retropepsin / symbiont-mediated activation of host apoptosis / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...
類似検索 - 分子機能

Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. / Integrase-like, N-terminal / Integrase DNA binding domain / Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral / Integrase, N-terminal zinc-binding domain ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Schiffer, C.A. / Mittal, S.

引用

ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2012
タイトル: Hydrophobic core flexibility modulates enzyme activity in HIV-1 protease.
著者: Mittal, S. / Cai, Y. / Nalam, M.N. / Bolon, D.N. / Schiffer, C.A.

履歴

登録	2012年2月15日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年3月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年5月2日	Group: Database references
改定 1.2	2017年11月15日	Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version
改定 1.3	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_site Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4dqf.cif.gz	90.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4dqf.ent.gz	70.7 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	4dqf_full_validation.pdf.gz	816.3 KB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dq/4dqf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dq/4dqf	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4dqbC 4dqcC 4dqeC 4dqgC 4dqhC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3em3-d 1mt9-d 3sa4-d 3saa-d 3lzs-d 4u8w-d 6dh0-d 1b2u-2 3sa8-d 1t7i-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#6 - 2000年6月 HIV-1タンパク質分解酵素 (HIV-1 Protease) 類似性 (2) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Aspartyl protease

B: Aspartyl protease

ヘテロ分子

22.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	51.978, 57.379, 60.678
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Aspartyl protease 分子量: 10739.647 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) 遺伝子: gag-pol / プラスミド: pXC35 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP56 / 参照: UniProt: P12499*PLUS

-
非ポリマー , 5種, 74分子

#2: 化合物	ChemComp-017 / (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE / Darunavir / TMC114 / UIC-94017 / ダルナビル分子量: 547.664 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₃₇N₃O₇S / コメント: 薬剤, 抗レトロウイルス剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 69 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.11 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.6 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.2 詳細: 126mM Phosphate buffer, 63mM Sodium Citrate, 24-29% Ammonium Sulfate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 14-BM-C / 波長: 0.9 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2009年3月3日

放射

モノクロメーター: Bent Ge(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 14871 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 7 % / R_merge(I) obs: 0.071 / Net I/σ(I): 11.1

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
1.9-1.97	6.9	0.425	1	100
1.97-2.05	6.9	0.315	1	100
2.05-2.14	6.9	0.257	1	100
2.14-2.25	7	0.199	1	100
2.25-2.39	7	0.166	1	100
2.39-2.58	7.1	0.13	1	100
2.58-2.84	7.1	0.097	1	100
2.84-3.25	7	0.064	1	100
3.25-4.09	7	0.044	1	100
4.09-50	6.7	0.039	1	99.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.1	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.9→41.69 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.956 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.932 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 6.615 / SU ML: 0.1 / SU R Cruickshank DPI: 0.1565 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.16 / ESU R Free: 0.153 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.23591	753	5.1 %	RANDOM
R_work	0.18381	-	-	-
obs	0.18628	14074	99.82 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 25.39 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.3 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.36 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.66 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→41.69 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	1435	0	58	69	1562

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.01	0.019	1533
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	995
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.477	2.007	2097
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.884	3	2451
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.015	5	197
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	42.005	24.468	47
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.355	15	231
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.448	15	7
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.082	0.2	262
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.021	1664
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	286
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.899→1.948 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.252	57	-
R_work	0.193	890	-
obs	-	-	98.75 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.4923	-1.3227	2.3299	0.3972	-0.5973	3.0144	-0.0321	-0.05	0.1633	-0.0149	-0.0238	-0.0345	-0.1323	-0.0951	0.0559	0.1257	0.0205	-0.0359	0.0943	-0.0117	0.1257	-5.8046	14.755	-22.9934
2	13.7104	1.4036	-0.1491	0.1487	-0.0117	0.0044	0.0135	-0.0679	0.3155	0.022	-0.0097	0.0505	0.0139	0.0104	-0.0038	0.1084	0.0205	0.0304	0.0736	0.0225	0.1409	-10.4849	10.4116	-15.3889
3	0.1559	-0.9923	-1.2331	6.3967	7.9666	9.9263	-0.0532	0.0572	-0.0305	0.1962	-0.3741	0.3396	0.2531	-0.4219	0.4274	0.0258	0.0174	0.0654	0.072	0.0217	0.2742	-25.9394	5.6394	-16.2257
4	8.2792	-1.0364	-1.1742	0.518	-0.2367	0.5485	-0.2129	-0.0408	0.1605	0.0441	0.042	-0.1857	0.0325	-0.0044	0.1708	0.0811	0.0071	0.0369	0.0674	-0.0161	0.1068	-16.747	6.7156	-15.1701
5	2.7269	3.6562	1.4173	5.2893	0.9797	2.9408	0.006	-0.0489	-0.0825	-0.0299	-0.0651	-0.135	0.0581	-0.0095	0.0592	0.0647	0.0084	-0.0016	0.0816	-0.0084	0.1067	-8.8174	-2.1102	-20.312
6	1.4478	1.263	1.2193	4.8449	0.2845	1.1897	0.04	-0.2662	0.1128	0.5684	-0.1145	0.319	-0.0978	-0.244	0.0745	0.134	-0.004	0.025	0.1356	0.0105	0.1404	-18.1902	-0.9861	-12.4087
7	2.9902	-1.2584	-2.5757	3.9139	4.8047	6.3105	-0.1894	-0.0996	-0.3263	-0.3179	-0.3264	0.4104	-0.3075	-0.2347	0.5158	0.1806	0.013	-0.0022	0.1915	0.0478	0.2259	-28.0076	-9.3369	-12.2988
8	20.1723	0.8588	6.7338	0.455	0.9266	7.5808	0.1911	-0.0955	-0.0113	-0.0994	0.0792	0.2381	0.1351	-0.2386	-0.2703	0.1033	-0.0248	-0.0813	0.0705	0.0798	0.2441	-16.7416	-14.0929	-13.1461
9	1.9244	2.2714	1.1314	2.9662	1.1934	0.7401	0.0635	0.0193	-0.027	0.1182	0.0223	0.1391	-0.0134	0.0231	-0.0858	0.082	-0.015	0.0132	0.0821	0.0021	0.1087	-9.0352	-9.4297	-9.3441
10	9.7063	-5.7678	8.1253	3.5314	-4.6423	7.1446	0.0883	-0.1762	-0.2498	0.0401	-0.0404	0.2765	0.3229	-0.3711	-0.0479	0.179	-0.1649	0.0528	0.1929	-0.0402	0.3172	-22.867	-9.2371	-14.9502
11	1.7052	2.8518	0.271	6.4969	-1.074	2.9627	0.0737	-0.0013	-0.1109	-0.0219	0.1534	0.2877	-0.0295	-0.0172	-0.2272	0.0946	0.0041	-0.0408	0.1307	0.0432	0.1762	-24.1198	0.9264	-22.8768
12	2.8869	1.3118	1.4418	4.182	-0.1508	4.156	-0.0532	0.1752	0.0537	-0.4752	0.1242	0.3308	0.049	-0.1077	-0.071	0.0691	-0.0017	-0.0105	0.1351	0.0136	0.1028	-21.4424	3.169	-25.5843
13	1.029	-0.1192	1.7372	3.2325	-2.3889	4.5001	0.0176	-0.0695	-0.114	0.1396	0.2244	0.2708	-0.1345	-0.2006	-0.242	0.0877	-0.0114	0.0091	0.1315	0.048	0.1896	-17.4179	-4.7298	-11.3261
14	1.709	-0.5865	-0.6209	1.2744	0.8997	4.5512	0.1211	0.0044	-0.0048	0.2146	0.0645	0.1266	-0.0196	0.1013	-0.1855	0.1177	-0.0025	0.0352	0.094	0.016	0.1163	-13.1333	2.1264	-12.6348
15	2.7757	-1.3467	1.7871	0.9226	-0.9932	1.212	0.0065	0.1816	0.0204	0.0084	-0.0258	-0.0248	0.0101	0.0716	0.0192	0.0982	-0.0131	-0.0207	0.1383	-0.0212	0.1181	-12.705	-1.3509	-24.9199
16	11.1603	2.7697	0.6718	1.2016	-0.2154	0.8346	0.0024	0.2992	-0.2012	-0.0803	0.0389	0.016	0.0054	-0.0154	-0.0413	0.0701	-0.0091	-0.0278	0.1191	-0.0148	0.063	-7.696	5.673	-29.2913
17	6.1922	5.2902	-2.8192	4.8065	-3.2153	3.5595	-0.1135	0.0973	-0.3719	-0.1245	0.0586	-0.2749	0.1235	-0.0114	0.0549	0.0883	0.0177	-0.0194	0.1192	-0.0551	0.1098	-5.3197	1.6756	-32.0283
18	23.3611	2.0505	0.8985	1.2061	0.0522	0.0354	0.2252	-0.2422	-0.3686	-0.1552	-0.1882	0.1329	0.0136	-0.0051	-0.037	0.0897	-0.0173	-0.0125	0.115	-0.0241	0.0678	-0.2926	-4.1027	-25.8604
19	13.0874	-2.6019	2.8084	5.69	3.6301	5.9554	0.0654	0.2094	-0.148	-0.0035	0.1132	-0.2232	-0.5325	0.1735	-0.1786	0.1593	-0.0071	-0.0059	0.0433	-0.0082	0.0722	15.4691	-0.5293	-23.0282
20	9.0199	-3.3322	-0.1326	3.2019	-0.8163	0.3834	0.0233	0.1301	-0.0268	-0.0312	-0.0561	-0.0666	0.0018	-0.0098	0.0328	0.0826	0.0029	0.0057	0.0949	-0.0249	0.0375	6.7307	-3.6978	-22.9225
21	1.0614	-0.7371	-0.8054	2.4212	0.7866	0.6391	0.0119	-0.0635	0.0841	0.1201	0.0457	-0.0618	0.015	0.0387	-0.0576	0.1036	-0.0052	0.0018	0.1087	-0.0174	0.0621	-1.8269	4.5422	-15.3875
22	2.2685	-4.424	-0.2031	9.6052	-0.4126	0.691	0.0156	-0.0345	0.065	-0.1509	-0.069	-0.2069	0.1306	0.127	0.0534	0.1363	0.0289	-0.0392	0.1171	-0.0144	0.0947	7.4929	-2.0574	-13.9973
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24	21.5726	1.2397	0.0622	1.1335	-1.8802	3.3422	0.0513	-0.4949	0.0748	0.0671	-0.1394	-0.0402	-0.1021	0.2073	0.0881	0.1627	-0.0064	-0.0291	0.0846	-0.0296	0.0751	9.5416	0.8843	-2.6416
25	7.7531	5.8008	2.0031	4.4456	1.5319	0.528	0.0815	-0.0908	0.1237	0.2359	-0.0818	0.0487	0.076	-0.0214	0.0003	0.2593	-0.0107	-0.051	0.1127	-0.0006	0.0562	-3.3644	-2.965	-4.8222
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28	4.6945	1.8557	4.2703	11.575	0.6147	3.9914	-0.1923	0.3981	-0.1327	-0.3237	0.2846	-0.1899	-0.1633	0.3479	-0.0923	0.1085	-0.0137	0.0248	0.1257	-0.0089	0.0944	10.985	6.3107	-26.6695
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30	1.2925	-0.923	-0.6851	4.035	1.0508	4.3323	-0.0598	-0.046	0.0013	0.1645	0.0314	0.2601	0.128	0.0164	0.0284	0.067	0.0025	0.0036	0.0823	0.0135	0.0565	2.383	-2.7825	-17.1284
31	1.003	-0.5099	0.1224	1.63	1.0471	0.9145	-0.0637	0.0359	0.0718	0.0701	0.0392	-0.0183	0.0105	0.0564	0.0246	0.103	-0.0075	-0.0106	0.0909	0.0028	0.0822	3.176	9.9919	-19.6143
32	5.9487	0.9332	-0.2045	0.1965	0.2476	1.8966	-0.2462	-0.0569	0.1718	-0.0494	0.0214	0.0753	-0.1388	-0.035	0.2248	0.1056	0.0201	-0.0229	0.1207	0.021	0.0933	-8.0089	10.4247	-27.1906

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 6
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	7 - 12
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	13 - 18
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	19 - 24
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	25 - 30
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	31 - 36
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	37 - 42
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	43 - 46
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	47 - 56
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	57 - 60
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	61 - 66
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	67 - 74
13	X-RAY DIFFRACTION	13	A	75 - 80
14	X-RAY DIFFRACTION	14	A	81 - 85
15	X-RAY DIFFRACTION	15	A	86 - 91
16	X-RAY DIFFRACTION	16	A	92 - 99
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	1 - 6
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	7 - 12
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	13 - 18
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	19 - 24
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	25 - 30
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	31 - 35
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	36 - 41
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	42 - 47
25	X-RAY DIFFRACTION	25	B	48 - 54
26	X-RAY DIFFRACTION	26	B	55 - 59
27	X-RAY DIFFRACTION	27	B	60 - 64
28	X-RAY DIFFRACTION	28	B	65 - 70
29	X-RAY DIFFRACTION	29	B	71 - 80
30	X-RAY DIFFRACTION	30	B	81 - 86
31	X-RAY DIFFRACTION	31	B	87 - 94
32	X-RAY DIFFRACTION	32	B	95 - 99

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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