登録情報 データベース : PDB / ID : 4a36 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of duck RIG-I helicase domain bound to 19-mer dsRNA and ATP transition state analogue 要素5'-R(*GP*CP*AP*UP*GP*CP*GP*AP*CP*CP*UP*CP*UP*GP *UP*UP*UP*GP*A)-3'5'-R(*UP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*GP*AP*GP*GP*UP*CP*GP *CP*AP*UP*GP*C)-3'RETINOIC ACID INDUCIBLE PROTEIN I 詳細キーワード RNA BINDING PROTEIN/RNA / RNA BINDING PROTEIN-RNA COMPLEX / SUPERFAMILY 2 RNA HELICASE / ATP AND DSRNA BINDING / ANTIVIRAL SIGNALLING PATHWAY機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
antiviral innate immune response / double-stranded RNA binding / RNA helicase activity / single-stranded RNA binding / hydrolase activity / RNA helicase / RNA binding / zinc ion binding / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 - #30 / phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 / RIG-I, CARD domain repeat 2 / RIG-I-like receptor, C-terminal / : / RIG-I receptor C-terminal domain / RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain / RIG-I-like receptor, C-terminal domain superfamily / C-terminal domain of RIG-I / RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile. ... phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 - #30 / phosphoenolpyruvate carboxylase, domain 3 / RIG-I, CARD domain repeat 2 / RIG-I-like receptor, C-terminal / : / RIG-I receptor C-terminal domain / RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain / RIG-I-like receptor, C-terminal domain superfamily / C-terminal domain of RIG-I / RIG-I-like receptor (RLR) C-terminal regulatory (CTR) domain profile. / Caspase recruitment domain / Caspase recruitment domain / Death-like domain superfamily / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain / Helicase conserved C-terminal domain / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases / Up-down Bundle / Rossmann fold / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ALUMINUM FLUORIDE / RNA / RNA (> 10) / RNA helicase 類似検索 - 構成要素生物種 ANAS PLATYRHYNCHOS (アヒル)SYNTHETIC CONSTRUCT (人工物) 手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 3.7 Å 詳細データ登録者 Kowalinski, E. / Lunardi, T. / McCarthy, A.A. / Cusack, S. 引用ジャーナル : Cell(Cambridge,Mass.) / 年 : 2011タイトル : Structural Basis for the Activation of Innate Immune Pattern Recognition Receptor Rig-I by Viral RNA.著者 : Kowalinski, E. / Lunardi, T. / Mccarthy, A.A. / Louber, J. / Brunel, J. / Grigorov, B. / Gerlier, D. / Cusack, S. 履歴 登録 2011年9月30日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2011年10月19日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年10月26日 Group : Database references改定 1.2 2015年5月20日 Group : Source and taxonomy改定 1.3 2019年4月3日 Group : Data collection / Other / Source and taxonomyカテゴリ : entity_src_gen / pdbx_database_proc / pdbx_database_statusItem : _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line / _pdbx_database_status.recvd_author_approval改定 1.4 2023年12月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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