登録情報 | データベース: PDB / ID: 3vmw |
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タイトル | Crystal structure of pectate lyase Bsp165PelA from Bacillus sp. N165 in complex with trigalacturonate |
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要素 | Pectate lyase |
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キーワード | LYASE / Polysaccharide Lyase Family 1 / pectate lyase / beta-helix / pectolytic / polygalacturonate |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
pectate lyase activity / polysaccharide catabolic process / extracellular region類似検索 - 分子機能 Pectin lyase family / Pectate lyase / Pectate lyase / Amb_all / Single-stranded right-handed beta-helix, Pectin lyase-like / Pectate Lyase C-like / Pectin lyase fold / Pectin lyase fold/virulence factor / 3 Solenoid / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å |
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データ登録者 | Zheng, Y. / Huang, C.H. / Liu, W. / Ko, T.P. / Xue, Y. / Zhou, C. / Zhang, G. / Guo, R.T. / Ma, Y. |
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引用 | ジャーナル: Biochem.Biophys.Res.Commun. / 年: 2012 タイトル: Crystal structure and substrate-binding mode of a novel pectate lyase from alkaliphilic Bacillus sp. N16-5. 著者: Zheng, Y. / Huang, C.H. / Liu, W. / Ko, T.P. / Xue, Y. / Zhou, C. / Guo, R.T. / Ma, Y. |
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履歴 | 登録 | 2011年12月17日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2012年7月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id ..._atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_seq_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_asym_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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