登録情報 データベース : PDB / ID : 3u2w 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of Human Glycogenin-1 (GYG1) complexed with manganese and glucose or a glucal species 要素Glycogenin-1 詳細 キーワード TRANSFERASE / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC / glycosyltransferase / glycogen biosynthesis / glycosylation / glucal機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Glycogen storage disease type XV (GYG1) / Glycogen storage disease type 0 (muscle GYS1) / Glycogen storage disease type II (GAA) / glycogenin glucosyltransferase / glycogenin glucosyltransferase activity / : / glycogen biosynthetic process / Glycogen breakdown (glycogenolysis) / glycosyltransferase activity / Myoclonic epilepsy of Lafora ... Glycogen storage disease type XV (GYG1) / Glycogen storage disease type 0 (muscle GYS1) / Glycogen storage disease type II (GAA) / glycogenin glucosyltransferase / glycogenin glucosyltransferase activity / : / glycogen biosynthetic process / Glycogen breakdown (glycogenolysis) / glycosyltransferase activity / Myoclonic epilepsy of Lafora / Glycogen synthesis / lysosomal lumen / manganese ion binding / secretory granule lumen / ficolin-1-rich granule lumen / Neutrophil degranulation / protein homodimerization activity / extracellular region / membrane / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 : / Glycosyl transferase, family 8 / Glycosyl transferase family 8 / Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A / Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A / Nucleotide-diphospho-sugar transferases / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 alpha-D-glucopyranose / 1,5-anhydro-D-arabino-hex-1-enitol / : / URIDINE-5'-DIPHOSPHATE / Glycogenin-1 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 1.68 Å 詳細データ登録者 Chaikuad, A. / Froese, D.S. / Krysztofinska, E. / von Delft, F. / Weigelt, J. / Arrowsmith, C.H. / Edwards, A.M. / Bountra, C. / Oppermann, U. / Yue, W.W. / Structural Genomics Consortium (SGC) 引用ジャーナル : Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年 : 2011タイトル : Conformational plasticity of glycogenin and its maltosaccharide substrate during glycogen biogenesis.著者 : Chaikuad, A. / Froese, D.S. / Berridge, G. / von Delft, F. / Oppermann, U. / Yue, W.W. 履歴 登録 2011年10月4日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2011年11月2日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年12月28日 Group : Database references改定 1.2 2012年1月11日 Group : Database references改定 1.3 2020年7月29日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : chem_comp / entity ... chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.name / _chem_comp.type ... _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 1.4 2023年9月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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