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- PDB-3twv: Crystal structure of ARC4 from human Tankyrase 2 in complex with ... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 3twv
タイトルCrystal structure of ARC4 from human Tankyrase 2 in complex with peptide from human NUMA1 (chimeric peptide)
要素
  • Tankyrase-2
  • human NUMA1
キーワードSIGNALING PROTEIN/PEPTIDE / ankyrin repeat / protein-protein interaction / substrate recruitment / poly(ADP-ribosyl)ation / SIGNALING PROTEIN-PEPTIDE complex
機能・相同性
機能・相同性情報


XAV939 stabilizes AXIN / positive regulation of telomere capping / NAD+ ADP-ribosyltransferase / negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening / protein auto-ADP-ribosylation / protein localization to chromosome, telomeric region / NAD+-protein-aspartate ADP-ribosyltransferase activity / protein poly-ADP-ribosylation / NAD+-protein-glutamate ADP-ribosyltransferase activity / pericentriolar material ...XAV939 stabilizes AXIN / positive regulation of telomere capping / NAD+ ADP-ribosyltransferase / negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening / protein auto-ADP-ribosylation / protein localization to chromosome, telomeric region / NAD+-protein-aspartate ADP-ribosyltransferase activity / protein poly-ADP-ribosylation / NAD+-protein-glutamate ADP-ribosyltransferase activity / pericentriolar material / NAD+-protein mono-ADP-ribosyltransferase activity / NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 五炭糖残基を移すもの / positive regulation of telomere maintenance via telomerase / nucleotidyltransferase activity / TCF dependent signaling in response to WNT / Degradation of AXIN / Wnt signaling pathway / Regulation of PTEN stability and activity / protein polyubiquitination / positive regulation of canonical Wnt signaling pathway / nuclear envelope / chromosome, telomeric region / Ub-specific processing proteases / Golgi membrane / perinuclear region of cytoplasm / enzyme binding / metal ion binding / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ankyrin repeat / Ankyrin repeat-containing domain / Poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain / Poly(ADP-ribose) polymerase, catalytic domain / PARP catalytic domain profile. / SAM domain (Sterile alpha motif) / SAM domain profile. / Sterile alpha motif. / Sterile alpha motif domain / Sterile alpha motif/pointed domain superfamily ...Ankyrin repeat / Ankyrin repeat-containing domain / Poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain / Poly(ADP-ribose) polymerase, catalytic domain / PARP catalytic domain profile. / SAM domain (Sterile alpha motif) / SAM domain profile. / Sterile alpha motif. / Sterile alpha motif domain / Sterile alpha motif/pointed domain superfamily / Ankyrin repeat / Ankyrin repeats (3 copies) / Ankyrin repeat profile. / Ankyrin repeat region circular profile. / ankyrin repeats / Ankyrin repeat / Ankyrin repeat-containing domain superfamily / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Alpha Horseshoe / Mainly Alpha
類似検索 - ドメイン・相同性
3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL / Poly [ADP-ribose] polymerase tankyrase-2
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 2.301 Å
データ登録者Guettler, S. / Sicheri, F.
引用ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 2011
タイトル: Structural basis and sequence rules for substrate recognition by tankyrase explain the basis for cherubism disease.
著者: Guettler, S. / Larose, J. / Petsalaki, E. / Gish, G. / Scotter, A. / Pawson, T. / Rottapel, R. / Sicheri, F.
履歴
登録2011年9月22日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02011年12月7日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年12月28日Group: Database references
改定 1.22019年7月17日Group: Data collection / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: software / struct_conn
Item: _software.classification / _software.name ..._software.classification / _software.name / _software.version / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 1.32025年3月26日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ref_seq_dif / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Tankyrase-2
B: Tankyrase-2
C: Tankyrase-2
D: Tankyrase-2
E: human NUMA1
F: human NUMA1
G: human NUMA1
H: human NUMA1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)81,03724
ポリマ－78,8818
非ポリマー2,15616
水2,846158
1
A: Tankyrase-2
E: human NUMA1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)20,1874
ポリマ－19,7202
非ポリマー4662
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area15450 Å2
ΔGint-80 kcal/mol
Surface area27170 Å2
手法PISA
2
B: Tankyrase-2
F: human NUMA1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)19,9405
ポリマ－19,7202
非ポリマー2203
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
3
C: Tankyrase-2
G: human NUMA1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)20,7778
ポリマ－19,7202
非ポリマー1,0576
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
4
D: Tankyrase-2
H: human NUMA1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)20,1337
ポリマ－19,7202
非ポリマー4125
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)62.219, 104.978, 129.555
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

-
要素

-
タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質
Tankyrase-2 / TANK2 / Poly [ADP-ribose] polymerase 5B / TNKS-2 / TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose ...TANK2 / Poly [ADP-ribose] polymerase 5B / TNKS-2 / TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase 2 / Tankyrase II / Tankyrase-like protein / Tankyrase-related protein


分子量: 17851.180 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 488-649 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PARP5B, TANK2, TNKL, TNKS2 / プラスミド: pETM-30 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21-CodonPlus(DE3)-RIL / 参照: UniProt: Q9H2K2, NAD+ ADP-ribosyltransferase
#2: タンパク質・ペプチド
human NUMA1


分子量: 1869.069 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: solid-state synthesized peptide / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト)

-
非ポリマー , 4種, 174分子

#3: 化合物 ChemComp-PE8 / 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL / オクタエチレングリコ-ル


分子量: 370.436 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C16H34O9
#4: 化合物
ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO4
#5: 化合物
ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル


分子量: 62.068 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6O2
#6: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 158 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

Has protein modificationY

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実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.67 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6
詳細: 0.1 M MES-NaOH pH 6.0, 2% (v/v) PEG 400, 2.5 M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 24-ID-E / 波長: 0.9792 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2010年7月17日
放射モノクロメーター: Si (220), Si (311) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9792 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.3→50 Å / Num. all: 37961 / Num. obs: 37961 / % possible obs: 99.2 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 2.6 / 冗長度: 4.9 % / Rmerge(I) obs: 0.129 / Net I/σ(I): 11.8
反射 シェル解像度: 2.3→2.38 Å / 冗長度: 4.9 % / Rmerge(I) obs: 0.606 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(phenix.refine: 1.7.1_743)精密化
REFMAC精密化
ADSCQuantumデータ収集
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
REFMAC位相決定
精密化構造決定の手法: フーリエ合成 / 解像度: 2.301→35.477 Å / SU ML: 0.66 / σ(F): 0.42 / 位相誤差: 22.18 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2446 1864 4.94 %
Rwork0.1868 --
obs0.1896 37765 98.36 %
all-37765 -
溶媒の処理減衰半径: 0.73 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 30.5 Å2 / ksol: 0.363 e/Å3
原子変位パラメータ
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--0.5708 Å20 Å20 Å2
2--0.2552 Å2-0 Å2
3---0.3155 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.301→35.477 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数5190 0 108 158 5456
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0075377
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.0477246
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d15.5592003
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.072800
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.005947
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.301-2.36340.34031310.24382540X-RAY DIFFRACTION92
2.3634-2.43290.26991480.21622745X-RAY DIFFRACTION99
2.4329-2.51150.25081570.19942724X-RAY DIFFRACTION99
2.5115-2.60120.27281380.18342774X-RAY DIFFRACTION99
2.6012-2.70530.24011590.18882751X-RAY DIFFRACTION99
2.7053-2.82840.29011460.19842742X-RAY DIFFRACTION99
2.8284-2.97740.26311410.19632750X-RAY DIFFRACTION99
2.9774-3.16390.23281390.18552723X-RAY DIFFRACTION98
3.1639-3.4080.22641300.18032774X-RAY DIFFRACTION98
3.408-3.75060.23221480.16722754X-RAY DIFFRACTION99
3.7506-4.29250.22851400.16292796X-RAY DIFFRACTION99
4.2925-5.4050.19331370.16452854X-RAY DIFFRACTION99
5.405-35.48110.27111500.21832974X-RAY DIFFRACTION99
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
16.6209-1.56782.44016.4857-1.6256.5827-0.2116-0.0330.3486-0.65770.14370.5521-0.3816-0.51430.0830.2782-0.0004-0.120.25890.07330.3048-25.7872-12.45857.6141
27.7784-0.0723-5.342.31270.02383.67540.2662-0.1123-0.2023-0.22180.09520.2822-0.5755-0.1215-0.36780.2252-0.0402-0.00760.17850.01590.2321-19.2159-7.181113.2831
31.48420.82350.76483.672-0.53883.2882-0.02870.0126-0.0195-0.025-0.00790.154-0.0023-0.07380.02840.0458-0.01780.02580.1653-0.00990.1076-16.0509-19.754819.025
43.90132.19421.75786.0055-0.8264.05-0.1331-0.034-0.1433-0.1886-0.0161-0.00991.1710.00260.12080.34810.00250.01620.1770.04980.1055-12.4696-32.722324.808
56.2121-1.6206-4.53267.17641.0593.35180.163-0.41450.46631.19210.0473-0.29840.29120.1164-0.2610.379-0.0686-0.02030.3446-0.06910.2044-10.5463-27.396135.2116
60.594-0.4548-0.20030.76540.54310.43340.048-0.1311-0.29950.09210.28330.35960.6235-0.4114-0.26670.7818-0.0886-0.04640.26530.1460.262-14.1885-39.689332.1099
72.24622.25591.56563.98792.51293.4834-0.32430.09710.03390.60430.4968-1.0394-0.33350.5304-0.11520.2607-0.0384-0.08580.2661-0.07150.2582-46.311-17.165648.4521
86.0382-2.33942.11939.6516-1.4726.35860.23260.03950.50410.3956-0.25280.2207-0.3721-0.3062-0.00220.2711-0.01740.0280.1153-0.10340.2725-52.526-16.607344.0319
92.4404-1.3706-2.09685.1107-0.45985.3566-0.00490.05880.291-0.0150.1182-0.0026-0.33020.0743-0.00270.147-0.0425-0.04110.1141-00.1746-47.2886-22.826637.7988
100.95060.0409-1.46615.76680.11234.2756-0.1619-0.15310.1605-0.0560.09180.24880.1347-0.3023-0.01980.1332-0.0544-0.04630.22280.04610.1078-49.5242-31.671732.9061
114.9225-0.6163-2.84745.09360.30644.3942-0.33910.83320.6219-0.40070.2206-0.0633-0.08570.28130.09640.2432-0.0927-0.03230.2950.0720.17-39.1006-27.418925.2601
124.64170.1349-1.34241.9196-0.04982.3547-0.17620.22430.1993-0.34480.2124-0.12970.04550.0659-0.01030.1626-0.0628-0.00060.18290.02610.112-40.716-36.920224.9114
138.70124.2305-2.42542.7819-2.11441.8823-0.4588-0.1554-1.0715-0.41140.0775-0.44570.50120.51520.33060.3280.01080.10940.2462-0.01260.1804-36.5548-45.732425.5363
142.1977-0.2717-2.65492.98410.9113.91450.0783-0.1854-0.3208-0.5954-0.2863-1.1620.19090.6370.40720.43890.04160.29030.28840.18290.47937.542712.42058.4073
156.13112.2845-3.03064.30822.78658.25020.41120.37810.7723-0.84880.16470.1937-0.5953-0.2832-0.47910.59770.00780.10340.23090.10890.3561-1.850116.64815.5384
163.8824-0.993-0.04165.32394.92165.650.02380.04460.0503-0.3088-0.10970.0632-0.1812-0.0034-0.00330.4690.04920.20360.1739-0.04830.18742.95674.58314.4561
173.40130.2917-1.66552.14370.35845.45610.03660.08350.2207-0.24060.106-0.57010.08330.4872-0.13360.18410.0090.08680.16870.02830.27683.27376.643715.9889
181.29272.20031.64897.41965.05897.90110.23320.04650.0049-1.1115-0.41610.4373-0.5715-0.91220.20180.35820.02250.02010.2840.04210.2171-8.50379.42598.8001
192.4037-0.2083-0.70653.15270.16773.3163-0.06640.0576-0.2568-0.2061-0.1757-0.21920.03110.14710.22190.1826-0.02080.07990.13660.02980.1901-1.45460.299418.4707
200.9044-1.6728-2.04694.65815.06116.5270.14020.12260.3044-0.1396-0.2741.178-0.1234-0.76560.24570.16960.04160.02860.2240.0370.3068-12.95814.623118.7329
217.5036-1.3763.16891.93341.13063.0788-0.2958-0.2065-0.404-0.13610.1138-0.00560.03810.1750.20460.21210.02270.13590.17570.00580.244-2.7193-6.921221.5436
220.95071.86681.33915.4710.69464.5703-0.3974-0.0915-0.14130.16630.01420.0634-0.2937-0.32180.3020.16910.05190.06380.1714-0.0220.1572-10.1995-0.618429.1975
235.49-2.13371.39981.9413-0.09250.5404-0.30370.2674-0.66520.15040.1104-0.22050.29650.3135-0.01360.1930.11790.15490.28340.06330.4139-3.5144-12.13130.4989
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254.87020.15283.73582.9175-1.83776.4406-0.00960.31280.2227-0.6431-0.32210.0616-0.04010.37110.0070.47010.0143-0.21850.1620.02550.1677-27.6725-32.0972-8.5938
266.95972.2216-0.50114.98130.62186.2009-0.2869-0.62120.39720.14930.0963-0.1697-0.40830.24220.09620.24250.0087-0.16060.153-0.05960.2397-30.6541-41.7088-9.1356
271.665-0.11190.60132.99830.32252.6781-0.0048-0.05020.0193-0.0991-0.00970.21010.10170.0358-0.01540.1176-0.0045-0.07510.16120.02080.1467-22.398-43.89112.0269
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精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resseq 490:511)
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resseq 512:521)
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resseq 522:594)
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resseq 595:613)
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resseq 614:628)
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resseq 629:644)
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resseq 488:502)
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resseq 503:521)
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resseq 522:561)
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resseq 562:581)
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resseq 582:594)
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resseq 595:627)
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resseq 628:644)
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resseq 488:502)
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resseq 503:511)
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resseq 512:521)
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resseq 522:538)
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resseq 539:548)
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resseq 549:571)
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resseq 572:580)
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resseq 581:594)
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resseq 595:614)
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'C' and (resseq 615:627)
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'C' and (resseq 628:644)
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'D' and (resseq 489:511)
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'D' and (resseq 512:521)
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'D' and (resseq 522:594)
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'D' and (resseq 595:627)
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'D' and (resseq 628:644)
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'E'
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'F'
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'G'
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'H'

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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