PDB-3q1e: Crystal structure of Y116T/I16A double mutant of 5-hydroxyisourat...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3q1e

タイトル

Crystal structure of Y116T/I16A double mutant of 5-hydroxyisourate hydrolase in complex with T4

要素

5-hydroxyisourate hydrolase

キーワード

HYDROLASE / HIUASE / TRANSTHYRETIN / TRP / THYROID HORMONES / MOLECULAR EVOLUTION / PURINE METABOLISM / Greek key beta-barrel / Point Mutation / peroxisome

機能・相同性

機能・相同性情報

hydroxyisourate hydrolase / hydroxyisourate hydrolase activity / urate catabolic process / hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides / purine nucleobase metabolic process / peroxisome
類似検索 - 分子機能

生物種

Danio rerio (ゼブラフィッシュ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.95 Å

データ登録者

Cendron, L. / Ramazzina, I. / Percudani, R. / Zanotti, G. / Berni, R.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2011
タイトル: Probing the evolution of hydroxyisourate hydrolase into transthyretin through active-site redesign.
著者: Cendron, L. / Ramazzina, I. / Percudani, R. / Rasore, C. / Zanotti, G. / Berni, R.

履歴

登録	2010年12月17日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2011年5月4日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2020年1月1日	Group: Database references / カテゴリ: citation / struct_ref_seq_dif Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _struct_ref_seq_dif.details
改定 1.3	2023年11月1日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2023年11月15日	Group: Advisory / Data collection カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 ..._chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3q1e.cif.gz	105.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3q1e.ent.gz	81.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3q1e.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/3q1e ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/q1/3q1e	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3iwuSC 3iwvC 2h1x 2h6u C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	2h1x-d 3efe-d 3iwv-d 3iwu-1 2h6u-1 5ttr-1 2h6u-2 4grh-d 3mx3-2 3iwu-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#189 - 2015年9月アミロイド (Amyloids) 類似性 (7) #37 - 2003年1月血清アルブミン (Serum Albumin) 類似性 (7)

登録構造単位

A: 5-hydroxyisourate hydrolase

B: 5-hydroxyisourate hydrolase

C: 5-hydroxyisourate hydrolase

D: 5-hydroxyisourate hydrolase

ヘテロ分子

54.2 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	45.771, 103.462, 53.490
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 109.47, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 5

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	SER	SER	ASP	ASP	A	A	7 - 33	7 - 33
2	1	SER	SER	ASP	ASP	B	B	7 - 33	7 - 33
3	1	SER	SER	ASP	ASP	C	C	7 - 33	7 - 33
4	1	SER	SER	ASP	ASP	D	D	7 - 33	7 - 33
1	2	THR	THR	PRO	PRO	A	A	44 - 54	44 - 54
2	2	THR	THR	PRO	PRO	B	B	44 - 54	44 - 54
3	2	THR	THR	PRO	PRO	C	C	44 - 54	44 - 54
4	2	THR	THR	PRO	PRO	D	D	44 - 54	44 - 54
1	3	PHE	PHE	THR	THR	A	A	62 - 115	62 - 115
2	3	PHE	PHE	THR	THR	B	B	62 - 115	62 - 115
3	3	PHE	PHE	THR	THR	C	C	62 - 115	62 - 115
4	3	PHE	PHE	THR	THR	D	D	62 - 115	62 - 115

#1: タンパク質	5-hydroxyisourate hydrolase / HIU hydrolase / HIUHase / Transthyretin-related protein 分子量: 13171.975 Da / 分子数: 4 / 断片: residues in UNP 20-138 / 変異: Y116T, I16A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Danio rerio (ゼブラフィッシュ) 遺伝子: urah / プラスミド: PET28B-HIUASE / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q06S87, hydroxyisourate hydrolase
#2: 化合物	ChemComp-T44 / 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE / チロキシン分子量: 776.870 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₅H₁₁I₄NO₄ / コメント: ホルモン*YM
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 55 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.27 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.73 %
結晶化	温度: 278 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 7.5 詳細: 0.1M HEPES, 20% PEG 10000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 278K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-2 / 波長: 0.873 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年6月21日 / 詳細: SI(111) and Pt coated mirrors in KB geometry
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.873 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.95→51.73 Å / Num. all: 33889 / Num. obs: 33889 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.5 % / R_merge(I) obs: 0.054 / Net I/σ(I): 9.5
反射シェル	解像度: 1.95→2.06 Å / 冗長度: 2.3 % / R_merge(I) obs: 0.458 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / Num. unique all: 4721 / % possible all: 94.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
ADSC	Quantum	データ収集
MLPHARE		位相決定
REFMAC	5.5.0072	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3IWU

3iwu

解像度: 1.95→51.73 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.947 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.923 / SU B: 13.498 / SU ML: 0.173 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(I): 0 / ESU R Free: 0.182 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.27116	1717	5.1 %	RANDOM
R_work	0.22227	-	-	-
all	0.22489	33863	-	-
obs	0.22489	33863	98.97 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 43.866 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	4.77 Å²	0 Å²	2.88 Å²
2-	-	-1.58 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.26 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.95→51.73 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3579	0	10	55	3644

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.021	0.022	3675
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.907	1.945	5022
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.697	5	453
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	32.252	22.895	152
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.768	15	561
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	24.084	15	20
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.129	0.2	578
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.009	0.021	2788
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.903	1.5	2273
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.477	2	3705
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.554	3	1402
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.761	4.5	1317
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
A	368	medium positional	0.17	0.5
B	368	medium positional	0.16	0.5
C	368	medium positional	0.19	0.5
D	368	medium positional	0.19	0.5
A	359	loose positional	0.47	5
B	359	loose positional	0.48	5
C	359	loose positional	0.42	5
D	359	loose positional	0.45	5
A	368	medium thermal	1.09	2
B	368	medium thermal	0.98	2
C	368	medium thermal	1.2	2
D	368	medium thermal	0.99	2
A	359	loose thermal	1.45	10
B	359	loose thermal	1.46	10
C	359	loose thermal	1.64	10
D	359	loose thermal	1.42	10

LS精密化シェル

解像度: 1.95→2.001 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.373	100	-
R_work	0.317	2155	-
obs	-	-	89.13 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.4525	0.3445	-0.0895	1.8408	-0.2756	1.3147	-0.1585	0.2301	-0.0369	-0.2386	0.1443	0.0802	0.082	-0.0958	0.0142	0.2144	0.008	-0.0288	0.1892	0.0079	0.1536	0.2705	12.0479	12.8446
2	4.6961	1.6194	5.3108	1.9626	0.634	7.257	-0.1174	-0.1405	0.0585	-0.0272	-0.0107	-0.1315	-0.4478	-0.2334	0.1281	0.3697	0.0114	0.0628	0.1635	0.0178	0.2262	13.243	25.377	24.1176
3	3.3801	1.4738	0.7232	6.4604	2.1265	2.8717	-0.0655	0.1734	-0.0951	-0.1983	0.0687	0.0005	-0.0395	0.1243	-0.0032	0.2566	0.007	0.0029	0.2347	0.0231	0.2027	2.4116	15.9684	8.2808
4	8.0665	-0.1916	-0.2496	1.5512	-1.3867	4.8466	-0.1129	0.447	-0.0227	-0.4517	-0.0751	-0.4359	-0.3264	0.2353	0.188	0.3532	-0.0442	0.0902	0.09	0.0036	0.2423	16.3907	19.7885	16.5973
5	1.6599	-0.0794	0.046	1.495	0.1755	1.7696	0.0882	0.0861	0.0864	-0.1152	-0.0311	-0.0392	-0.1105	0.0036	-0.0571	0.2335	0.0018	-0.016	0.1702	0.01	0.188	2.0686	14.0644	20.0431
6	1.2518	-0.2488	0.9701	3.1368	-0.3268	1.9702	-0.0361	0.2298	-0.16	-0.2656	0.0103	-0.1591	0.0406	0.0864	0.0258	0.2341	-0.0074	-0.0348	0.1765	-0.0091	0.1823	0.5098	6.758	20.4613
7	8.9912	-3.9222	-5.1713	4.7474	1.4168	3.2312	-0.2422	-0.1932	-0.1999	0.1682	0.1747	0.2861	0.2089	0.094	0.0675	0.2493	0.001	-0.035	0.2037	0.0174	0.1746	-0.608	2.7312	38.6138
8	1.2385	-1.258	-0.1477	5.0571	-0.6008	1.2989	-0.0316	-0.0187	0.1411	0.1276	0.0018	-0.1	0.0133	-0.0452	0.0298	0.1933	0.0105	-0.0497	0.2239	0.0197	0.1772	2.1079	15.2187	39.2221
9	8.3451	1.1711	-0.6496	2.7669	-0.6696	4.1117	-0.0562	-0.0314	-0.2296	0.0914	0.059	0.0469	0.1444	-0.0144	-0.0028	0.2337	0.0086	-0.0105	0.22	0.0161	0.195	3.3926	1.4173	43.9613
10	2.4811	0.2925	-1.0495	1.8581	-1.6189	4.1814	0.0247	-0.236	-0.062	0.5013	0.0588	0.2631	-0.1642	-0.1789	-0.0835	0.2138	-0.0007	-0.0017	0.1777	0.0033	0.1919	-7.61	15.489	42.0444
11	1.6949	-0.3322	-0.4479	2.1721	-0.2252	1.8713	-0.0556	-0.1108	-0.1047	0.0868	0.0359	-0.0534	0.0111	0.1209	0.0197	0.2302	-0.0162	-0.0515	0.2041	0.0028	0.185	3.9375	9.3722	33.8368
12	5.818	-0.6259	-1.2794	3.3425	0.2616	3.6618	-0.1337	-0.0924	-0.2337	0.1805	0.0783	0.0953	0.1712	-0.1305	0.0554	0.2102	-0.0062	-0.0325	0.1798	0.0142	0.1764	2.4445	3.7808	29.4059
13	2.8983	0.6259	0.3046	1.3814	-1.3736	1.7058	-0.0012	0.114	0.203	-0.032	-0.0951	-0.039	-0.0089	0.1767	0.0962	0.2288	-0.0453	0.0135	0.1946	-0.0234	0.2337	6.9645	-4.4079	9.0198
14	0.9257	-0.5243	-0.3564	1.7828	0.1798	2.8692	0.1629	-0.0744	-0.1656	-0.0957	-0.0882	0.0267	0.194	-0.0391	-0.0747	0.1823	0.0354	0.0222	0.2245	0.0187	0.206	2.9433	-15.1319	8.7755
15	1.346	0.54	0.1813	0.9233	-0.2355	2.5473	0.0249	0.0352	0.0021	-0.2555	-0.0383	-0.0627	-0.0668	0.1024	0.0134	0.1531	0.0208	0.018	0.1976	-0.017	0.215	6.4867	-11.9398	3.8063
16	3.2734	1.3353	0.4095	2.3686	-2.8337	5.2955	-0.1148	0.3755	0.2076	-0.2288	0.0972	0.0969	0.0505	-0.0168	0.0176	0.2382	0.048	-0.0093	0.2299	-0.0026	0.2074	-4.3032	-13.1481	1.452
17	1.0822	0.0966	-0.7593	1.6363	-0.0457	1.8815	-0.0357	0.0278	0.027	-0.0461	-0.0059	-0.0345	0.0327	0.1659	0.0416	0.1582	-0.006	0.008	0.1902	-0.0135	0.2129	3.935	-11.1598	14.1975
18	4.2041	-0.6963	1.2753	2.9401	0.2009	4.5675	-0.1077	0.1469	0.181	-0.0661	-0.0119	-0.0522	-0.2496	0.1769	0.1196	0.1465	-0.0217	0.014	0.2051	-0.0174	0.2363	3.57	-5.3373	19.1812
19	1.8306	-0.7269	0.4612	0.9226	-1.9127	5.1916	-0.0254	-0.1399	-0.0288	0.0948	0.0036	0.0594	-0.0028	-0.0207	0.0218	0.2377	-0.0171	0.0528	0.204	-0.0366	0.2166	-8.5898	-11.0079	34.4125
20	2.3629	-2.1099	-0.6492	3.8526	0.5689	1.6596	0.072	0.0382	-0.1554	-0.0048	-0.0647	-0.0131	0.219	-0.0337	-0.0073	0.141	-0.0135	0.0223	0.2141	0.0086	0.2517	-7.3009	-20.3454	25.5768
21	3.4933	-1.9235	-0.3477	8.0685	-0.1731	3.4091	-0.0397	-0.157	0.0742	0.2041	0.0108	0.0188	-0.092	-0.0515	0.0289	0.1887	-0.0067	0.0208	0.2408	0.0049	0.2183	-14.7966	-12.0947	33.2357
22	3.1045	0.7146	1.4234	1.0722	1.4136	1.9529	-0.0859	-0.544	-0.3488	0.2931	-0.0263	0.1639	0.3384	-0.1115	0.1122	0.2283	0.073	0.112	0.2107	0.0348	0.2428	-2.7356	-23.8265	33.4029
23	1.3367	-0.1429	-0.2808	1.7083	0.1915	2.1436	-0.0322	-0.0935	-0.0558	0.0913	0.0304	0.1262	0.0431	-0.1558	0.0018	0.147	-0.0174	0.0167	0.1935	-0.0178	0.2267	-6.9434	-12.4204	24.0292
24	4.5798	-0.8132	0.6735	4.2292	-0.7525	3.7012	-0.0667	-0.3037	-0.0457	0.1821	0.0822	0.064	-0.1875	-0.0447	-0.0155	0.1218	-0.0111	0.0112	0.1774	-0.0256	0.2219	-4.1944	-5.2487	23.3441

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	7 - 29
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	30 - 43
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	44 - 56
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	57 - 69
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	70 - 104
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	105 - 119
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	6 - 17
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	18 - 45
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	46 - 54
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	55 - 69
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	70 - 103
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	104 - 119
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	6 - 17
14	X-RAY DIFFRACTION	14	C	18 - 38
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	39 - 59
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	60 - 69
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	70 - 106
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	107 - 119
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	4 - 17
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	18 - 43
21	X-RAY DIFFRACTION	21	D	44 - 55
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	56 - 69
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	70 - 106
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	107 - 119

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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