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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3pr9 | ||||||
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タイトル | Structural analysis of protein folding by the Methanococcus jannaschii chaperone FKBP26 | ||||||
![]() | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase | ||||||
![]() | CHAPERONE / FKBP protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() biosynthetic process / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Martinez-Hackert, E. / Hendrickson, W.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Analysis of Protein Folding by the Long-Chain Archaeal Chaperone FKBP26. 著者: Martinez-Hackert, E. / Hendrickson, W.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 49.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 34.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 420.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 422.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17511.312 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: truncation of C-terminal domain at residue 150 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: MJ0825 / プラスミド: pET24 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.52 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.19 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: ハンギングドロップ法 詳細: 1.7 M NaMalonate (pH 8.0), hanging drop, temperature 298K PH範囲: 100 mM Tris, pH 8.4 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: CCD / 日付: 2000年10月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.95→19.84 Å / Num. obs: 12182 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 91.31 Å2 / Biso mean: 20.3926 Å2 / Biso min: 5.3 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.95→19.84 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.95→2 Å / Total num. of bins used: 20
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