登録情報 データベース : PDB / ID : 3mze 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of penicillin-binding protein 5 from E.coli: cefoxitin acyl-enzyme complex 要素D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase dacA 詳細 キーワード HYDROLASE/ANTIBIOTIC / BETA-LACTAM ANTIBIOTIC / PENICILLIN-BINDING PROTEIN / DD-CARBOXYPEPTIDASE / HYDROLASE / HYDROLASE-ANTIBIOTIC complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / beta-lactamase / beta-lactamase activity / regulation of cell shape ... peptidoglycan metabolic process / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase / serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase activity / penicillin binding / peptidoglycan biosynthetic process / carboxypeptidase activity / cell wall organization / beta-lactamase / beta-lactamase activity / regulation of cell shape / outer membrane-bounded periplasmic space / cell division / protein homodimerization activity / proteolysis / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 Peptidoglycan synthesis regulatory factor (PBP3), Domain 2 / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-Ala-D-Ala carboxypeptidase A, C-terminal / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A, N-terminal / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase ... Peptidoglycan synthesis regulatory factor (PBP3), Domain 2 / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain / D-Ala-D-Ala carboxypeptidase, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-Ala-D-Ala carboxypeptidase A, C-terminal / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain / Penicillin-binding protein, C-terminal domain superfamily / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A, N-terminal / Peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase A / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase / Beta-lactamase / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / Beta-lactamase/transpeptidase-like / Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-1QL / D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacA 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / フーリエ合成 / 解像度 : 2.1 Å 詳細データ登録者 Nicola, G. / Tomberg, J. / Pratt, R.F. / Nicholas, R.A. / Davies, C. 引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2010タイトル : Crystal structures of covalent complexes of beta-lactam antibiotics with Escherichia coli penicillin-binding protein 5: toward an understanding of antibiotic specificity著者 : Nicola, G. / Tomberg, J. / Pratt, R.F. / Nicholas, R.A. / Davies, C. 履歴 登録 2010年5月12日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2011年3月16日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 2.0 2018年9月12日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / entity_src_gen / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 改定 2.1 2019年7月17日 Group : Data collection / Derived calculations / Refinement descriptionカテゴリ : software / struct_connItem : _software.classification / _software.name ... _software.classification / _software.name / _software.version / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag 改定 2.2 2023年9月6日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 2.3 2024年10月16日 Group : Structure summaryカテゴリ : pdbx_entry_details / pdbx_modification_featureItem : _pdbx_entry_details.has_protein_modification
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