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- PDB-3hi1: Structure of HIV-1 gp120 (core with V3) in Complex with CD4-Bindi... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 3hi1
タイトルStructure of HIV-1 gp120 (core with V3) in Complex with CD4-Binding-Site Antibody F105
要素
  • F105 Heavy Chain
  • F105 Light Chain
  • Glycoprotein 120
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN/Immune System / HIV / GP120 / CD4 BINDING SITE ANTIBODY / F105 / IMMUNE EVASION / AIDS / Apoptosis / Cell membrane / Cleavage on pair of basic residues / Disulfide bond / Envelope protein / Fusion protein / Glycoprotein / Host-virus interaction / Lipoprotein / Membrane / Palmitate / Transmembrane / Viral immunoevasion / Virion / STRUCTURAL PROTEIN-Immune System COMPLEX
機能・相同性
機能・相同性情報


Dectin-2 family / positive regulation of plasma membrane raft polarization / positive regulation of receptor clustering / positive regulation of establishment of T cell polarity / host cell endosome membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / viral protein processing / fusion of virus membrane with host plasma membrane / virus-mediated perturbation of host defense response / fusion of virus membrane with host endosome membrane ...Dectin-2 family / positive regulation of plasma membrane raft polarization / positive regulation of receptor clustering / positive regulation of establishment of T cell polarity / host cell endosome membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / viral protein processing / fusion of virus membrane with host plasma membrane / virus-mediated perturbation of host defense response / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / apoptotic process / host cell plasma membrane / structural molecule activity / virion membrane / extracellular region / membrane
類似検索 - 分子機能
HIV Envelope Protein Gp120; Chain G / Human immunodeficiency virus 1, Gp160, envelope glycoprotein / : / Envelope glycoprotein Gp160 / Retroviral envelope protein / Retroviral envelope protein GP41-like / Gp120 core superfamily / Envelope glycoprotein GP120 / Human immunodeficiency virus 1, envelope glycoprotein Gp120 / Beta Complex ...HIV Envelope Protein Gp120; Chain G / Human immunodeficiency virus 1, Gp160, envelope glycoprotein / : / Envelope glycoprotein Gp160 / Retroviral envelope protein / Retroviral envelope protein GP41-like / Gp120 core superfamily / Envelope glycoprotein GP120 / Human immunodeficiency virus 1, envelope glycoprotein Gp120 / Beta Complex / Immunoglobulin V-Type / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin V-set domain / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site / Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature. / Immunoglobulin C-Type / Immunoglobulin C1-set / Immunoglobulin C1-set domain / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Envelope glycoprotein gp160 / IGK@ protein
類似検索 - 構成要素
生物種Human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.9 Å
データ登録者Kwon, Y.D. / Chen, L. / Zhou, T. / Wu, X. / O'Dell, S. / Cavacini, L. / Hessell, A.J. / Pancera, M. / Tang, M. / Xu, L. ...Kwon, Y.D. / Chen, L. / Zhou, T. / Wu, X. / O'Dell, S. / Cavacini, L. / Hessell, A.J. / Pancera, M. / Tang, M. / Xu, L. / Yang, Z. / Zhang, M.-Y. / Arthos, J. / Burton, D.R. / Dimitrov, D. / Nabel, G.J. / Posner, M. / Sodroski, J. / Wyatt, R. / Mascola, J.R. / Kwong, P.D.
引用ジャーナル: Science / 年: 2009
タイトル: Structural basis of immune evasion at the site of CD4 attachment on HIV-1 gp120.
著者: Chen, L. / Do Kwon, Y. / Zhou, T. / Wu, X. / O'Dell, S. / Cavacini, L. / Hessell, A.J. / Pancera, M. / Tang, M. / Xu, L. / Yang, Z.Y. / Zhang, M.Y. / Arthos, J. / Burton, D.R. / Dimitrov, D.S. ...著者: Chen, L. / Do Kwon, Y. / Zhou, T. / Wu, X. / O'Dell, S. / Cavacini, L. / Hessell, A.J. / Pancera, M. / Tang, M. / Xu, L. / Yang, Z.Y. / Zhang, M.Y. / Arthos, J. / Burton, D.R. / Dimitrov, D.S. / Nabel, G.J. / Posner, M.R. / Sodroski, J. / Wyatt, R. / Mascola, J.R. / Kwong, P.D.
履歴
登録2009年5月18日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02009年11月17日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12011年7月13日Group: Non-polymer description / Version format compliance
改定 1.22017年8月23日Group: Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / software
改定 1.32020年7月29日Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / database_PDB_caveat ...chem_comp / database_PDB_caveat / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen
Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_ref_seq_dif.details
解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.42023年9月6日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim
Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
G: Glycoprotein 120
L: F105 Light Chain
H: F105 Heavy Chain
J: Glycoprotein 120
A: F105 Light Chain
B: F105 Heavy Chain
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)172,57833
ポリマ－166,6056
非ポリマー5,97327
水1,40578
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area22590 Å2
ΔGint-1 kcal/mol
Surface area66980 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)412.403, 412.403, 83.206
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number155
Space group name H-MH32
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID詳細
11G
21J
12H
22B
13L
23A

NCSドメイン領域:

Refine code: 1

Dom-IDComponent-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
111THRTHRVALVALGA90 - 2551 - 93
211THRTHRVALVALJD90 - 2551 - 93
121SERSERILEILEGA256 - 29494 - 132
221SERSERILEILEJD256 - 29494 - 132
131ASNASNLEULEUGA332 - 390169 - 227
231ASNASNLEULEUJD332 - 390169 - 227
141ILEILEGLUGLUGA449 - 492278 - 321
241ILEILEGLUGLUJD449 - 492278 - 321
112GLNGLNSERSERHC1 - 1131 - 123
212GLNGLNSERSERBF1 - 1131 - 123
122ALAALASERSERHC114 - 215124 - 225
222ALAALASERSERBF114 - 215124 - 225
113GLUGLUTHRTHRLB1 - 1091 - 110
213GLUGLUTHRTHRAE1 - 1091 - 110
123VALVALCYSCYSLB110 - 214111 - 215
223VALVALCYSCYSAE110 - 214111 - 215

NCSアンサンブル:
ID
1
2
3

-
要素

#1: タンパク質 Glycoprotein 120 / gp120 / SU


分子量: 35962.930 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
株: YU-2 / 遺伝子: env / プラスミド: PSHUTTLE-CMV / Cell (発現宿主): KIDNEY EMBRYONIC CELL LINE 293 / 発現宿主: ADENOVIRUS (ウイルス) / 株 (発現宿主): AD5 / 参照: UniProt: P35961
#2: 抗体 F105 Light Chain


分子量: 23495.043 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
詳細: PRODUCED BY FUSION OF ANTIBODY-PRODUCING EPSTEIN BARR VIURS-TRANSFORMED CELLS WITH THE HMMA2.11TG/O CELL LINE
由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6PIL8*PLUS
#3: 抗体 F105 Heavy Chain


分子量: 23844.768 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然
詳細: PRODUCED BY FUSION OF ANTIBODY-PRODUCING EPSTEIN BARR VIURS-TRANSFORMED CELLS WITH THE HMMA2.11TG/O CELL LINE
由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#4: 糖...
ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン


タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 27 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C8H15NO6
識別子タイププログラム
DGlcpNAcbCONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamineCOMMON NAMEGMML 1.0
b-D-GlcpNAcIUPAC CARBOHYDRATE SYMBOLPDB-CARE 1.0
GlcNAcSNFG CARBOHYDRATE SYMBOLGMML 1.0
#5: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 78 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 4.08 Å3/Da / 溶媒含有率: 69.89 %
結晶化温度: 293 K / pH: 7.5
詳細: 16% PEG 6000, 8% 2-PROPANOL, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES, PH 7.5, temperature 293K

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1
検出器タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2005年8月11日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.9→50 Å / Num. obs: 48590 / 冗長度: 4.4 % / Rmerge(I) obs: 0.123 / Rsym value: 0.085 / Net I/σ(I): 13.1
反射 シェル解像度: 2.9→2.98 Å / 冗長度: 1.5 % / Rmerge(I) obs: 0.456 / Mean I/σ(I) obs: 1.21 / Rsym value: 0.413

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
AMoRE位相決定
REFMAC5.2.0019精密化
DENZOデータ削減
SCALEPACKデータスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: PDB ENTRIES 1BBD, 1BBJ

1bbd

1bbj


解像度: 2.9→43.48 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.939 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.905 / SU B: 39.865 / SU ML: 0.328 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.412 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.243 2247 5 %RANDOM
Rwork0.202 ---
obs0.204 42563 75.5 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 119.9 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1-1.02 Å20.51 Å20 Å2
2--1.02 Å20 Å2
3----1.53 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.9→43.48 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数11214 0 378 78 11670
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0090.02211885
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.1541.98816179
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg6.08551448
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg31.95824.619472
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg15.623151904
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg17.8511552
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0670.21864
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0030.028738
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined0.2590.35339
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined0.3360.58314
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined0.1980.5696
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined0.2510.357
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined0.2150.56
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it1.37127342
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it2.445311780
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it0.7125030
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it1.21334399
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded
Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-IDAuth asym-ID数タイプRms dev position (Å)Weight position
1G1835tight positional0.020.05
2H1680tight positional0.030.05
3L1651tight positional0.030.05
1G1835tight thermal0.190.5
2H1680tight thermal0.060.5
3L1651tight thermal0.040.5
LS精密化 シェル解像度: 2.9→2.98 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.346 24 -
Rwork0.386 550 -
obs--13.17 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
13.4047-1.42410.97493.14190.41091.480.1289-0.16250.021-0.08530.0378-0.4345-0.30940.6019-0.1667-0.5734-0.130.0659-0.20650.0258-0.873257.25127.313-38.547
24.01041.60181.55752.3046-0.58061.47370.2177-0.55070.15260.517-0.1257-0.3541-0.35050.3974-0.092-0.4243-0.26520.06380.4614-0.306-0.355779.15528.189-31.572
31.5716-3.0255-1.01427.17037.912727.04950.56480.3710.2197-0.3207-0.2017-0.2825-1.0771-2.0154-0.3631-0.7853-0.0441-0.0333-0.27390.0429-0.84248.89928.574-41.644
41.40373.0659-3.03046.9676-8.685622.29690.3397-0.41380.50540.8351-0.181-0.1776-1.23073.1143-0.1587-0.5192-0.4131-0.03820.6401-0.3991-0.249987.42930.021-28.475
55.9338-1.2422-0.32063.2057-0.84925.85910.5081-0.41170.59460.4312-0.0651-0.187-0.98150.4383-0.443-0.3617-0.18180.2028-0.56940.0168-0.650348.39843.802-24.897
63.78542.0502-0.13723.03410.03194.86640.5526-0.31760.3063-0.1884-0.3168-0.0809-0.93870.0921-0.2357-0.3533-0.36230.2362-0.0111-0.3127-0.056686.75545.046-45.292
72.31832.5081-0.36363.1091-1.01921.184-0.10660.02920.1684-0.13640.127-0.1324-0.1520.277-0.0204-0.54680.028-0.0064-0.46640.0018-0.829736.39517.406-13.361
80.2823-0.0131-0.19523.63962.47555.0218-0.1327-0.08760.12830.36320.1910.3032-0.49420.1576-0.0583-0.51110.1006-0.0063-0.510.0171-0.754919.60521.28814.083
95.4992-1.1475-3.68843.44030.65125.7641-0.5141-1.1172-0.9532-0.0843-0.4004-0.23910.40570.77890.9145-0.5254-0.1070.28760.12410.18150.196599.79118.823-56.704
104.21420.5375-1.024.11-5.058313.0706-0.5401-0.0033-1.00150.1739-0.1655-0.2962-1.06750.51860.7056-0.2743-0.19680.2685-0.2571-0.1550.1971117.36122.98-83.482
111.57830.3062-0.74841.1344-0.58847.6763-0.0362-0.1033-0.19810.0661-0.0894-0.1648-0.27391.00240.1256-0.7299-0.0592-0.0888-0.2117-0.0058-0.712352.33419.1781.692
126.49862.11490.77922.530.23912.7122-0.0271-0.32890.08440.5070.09480.11420.17990.0081-0.0677-0.45790.05370.0367-0.5574-0.0009-1.011823.91611.95925.946
132.7637-0.9653-3.09620.50941.802712.9083-0.23620.8068-0.8039-0.1661-0.660.11410.1421-1.5990.8962-0.6379-0.15880.12740.2826-0.380.101684.2820.794-72.09
1410.4774-4.2184-2.32861.81740.09166.5312-0.58760.4144-1.2384-0.3935-0.25870.10150.3002-0.26590.8462-0.3828-0.31650.4553-0.1523-0.4410.4289113.26513.999-95.848
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1G90 - 255
2X-RAY DIFFRACTION2J90 - 255
3X-RAY DIFFRACTION3G475 - 492
4X-RAY DIFFRACTION4J475 - 492
5X-RAY DIFFRACTION5G256 - 474
6X-RAY DIFFRACTION6J256 - 474
7X-RAY DIFFRACTION7H1 - 113
8X-RAY DIFFRACTION8H114 - 215
9X-RAY DIFFRACTION9B1 - 113
10X-RAY DIFFRACTION10B114 - 215
11X-RAY DIFFRACTION11L1 - 109
12X-RAY DIFFRACTION12L110 - 214
13X-RAY DIFFRACTION13A1 - 109
14X-RAY DIFFRACTION14A110 - 214

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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