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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3gtf | ||||||
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タイトル | D71G/E101G/V235L mutant in organophosphorus hydrolase from Deinococcus radiodurans | ||||||
![]() | Organophosphorus hydrolase | ||||||
![]() | HYDROLASE / mutant / alpha-beta barrel / amidohydrolase | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hawwa, R. / Larsen, S. / Ratia, K. / Mesecar, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure-based and random mutagenesis approaches increase the organophosphate-degrading activity of a phosphotriesterase homologue from Deinococcus radiodurans. 著者: Hawwa, R. / Larsen, S.D. / Ratia, K. / Mesecar, A.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 82.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 64.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 437.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 445.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 30.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36185.582 Da / 分子数: 1 / 変異: D71G, E101G, V235L / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: DR_0930 / 発現宿主: ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.39 % |
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結晶化 | 温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: 2.8 M Na-acetate*3H20, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 日付: 2007年2月14日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.98→20 Å / Num. obs: 30232 / % possible obs: 96.9 % |
反射 シェル | 解像度: 1.98→2.1 Å / % possible all: 89.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.98→20 Å
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拘束条件 |
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