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Yorodumi- PDB-3cfj: Crystal structure of catalytic elimination antibody 34E4, orthorh... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3cfj | ||||||
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Title | Crystal structure of catalytic elimination antibody 34E4, orthorhombic crystal form | ||||||
Components |
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Keywords | IMMUNE SYSTEM / IMMUNOGLOBULIN / CATALYTIC ANTIBODY / CHIMERIC FAB / APO FORM / PROTON TRANSFER / CONFORMATIONAL CHANGE / Immunoglobulin domain / Immunoglobulin V region | ||||||
Function / homology | Function and homology information immunoglobulin complex, circulating / immunoglobulin receptor binding / complement activation, classical pathway / antigen binding / antibacterial humoral response / blood microparticle / immune response / extracellular space / extracellular exosome / metal ion binding / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Mus musculus (house mouse) Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.6 Å | ||||||
Authors | Debler, E.W. / Wilson, I.A. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2008 Title: Conformational isomerism can limit antibody catalysis. Authors: Debler, E.W. / Muller, R. / Hilvert, D. / Wilson, I.A. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3cfj.cif.gz | 347.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3cfj.ent.gz | 282.5 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3cfj.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3cfj_validation.pdf.gz | 507.2 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 3cfj_full_validation.pdf.gz | 527.8 KB | Display | |
Data in XML | 3cfj_validation.xml.gz | 65.6 KB | Display | |
Data in CIF | 3cfj_validation.cif.gz | 92.3 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cf/3cfj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cf/3cfj | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3cfkC 1y0lS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1 / Refine code: 3
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