登録情報 | データベース: PDB / ID: 3b9g |
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タイトル | Crystal structure of loop deletion mutant of Trypanosoma vivax nucleoside hydrolase (3GTvNH) in complex with ImmH |
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要素 | IAG-nucleoside hydrolase |
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キーワード | HYDROLASE / Rossmann fold / Flexible loop deletion / Transition state complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds / nucleobase-containing compound metabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Inosine-uridine Nucleoside N-ribohydrolase; Chain A / Ribonucleoside hydrolase-like / Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase / Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase domain / Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase / Ribonucleoside hydrolase-like / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_eukaryote.gif) Trypanosoma vivax (トリパノソーマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.4 Å |
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データ登録者 | Vandemeulebroucke, A. / De Vos, S. / Van Holsbeke, E. / Steyaert, J. / Versees, W. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2008 タイトル: A Flexible Loop as a Functional Element in the Catalytic Mechanism of Nucleoside Hydrolase from Trypanosoma vivax. 著者: Vandemeulebroucke, A. / De Vos, S. / Van Holsbeke, E. / Steyaert, J. / Versees, W. |
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履歴 | 登録 | 2007年11月5日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年4月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年8月23日 | Group: Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / software |
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改定 1.3 | 2022年10月5日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / database_2 ...chem_comp / database_2 / diffrn_source / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.4 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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Remark 999 | deleted loop C245-Y257 replaced by linker G245-G247 |
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