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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2wlo | ||||||
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Title | POTASSIUM CHANNEL FROM MAGNETOSPIRILLUM MAGNETOTACTICUM | ||||||
![]() | POTASSIUM CHANNEL | ||||||
![]() | METAL TRANSPORT / MEMBRANE PROTEIN | ||||||
Function / homology | ![]() inward rectifier potassium channel activity / regulation of monoatomic ion transmembrane transport / monoatomic ion channel complex / potassium ion import across plasma membrane / identical protein binding / plasma membrane Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Clarke, O.B. / Caputo, A.T. / Smith, B.J. / Gulbis, J.M. | ||||||
![]() | ![]() Title: Domain Reorientation and Rotation of an Intracellular Assembly Regulate Conduction in Kir Potassium Channels. Authors: Clarke, O.B. / Caputo, A.T. / Hill, A.P. / Vandenberg, J.I. / Smith, B.J. / Gulbis, J.M. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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PDB format | ![]() | 196.3 KB | Display | ![]() |
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Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 449.3 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 466.1 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 23.2 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 30 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 2wlhC ![]() 2wliC ![]() 2wljC ![]() 2wlkC ![]() 2wllC ![]() 2wlmC ![]() 2wlnC ![]() 2x6aC ![]() 2x6bC ![]() 2x6cC C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components on special symmetry positions |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
NCS ensembles :
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Components
#1: Protein | Mass: 33782.766 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() Production host: ![]() ![]() #2: Chemical | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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-
Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 7.36 Å3/Da / Density % sol: 83 % / Description: NONE |
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Crystal grow | Method: vapor diffusion, sitting drop / pH: 7.5 Details: PRECIPITANT: 15 % PEG400 2.5 % PEG 4000 2.5 % PEG 8000 10 % GLYCEROL 90 MM HEPES PH 7.5 PROTEIN KIRBAC 3.1, 8MG/ML 150MM KCL 20MM TRIS PH 8.0 20MM TETRABUTYL AMMONIUM BROMIDE 4MM CYMAL-5 0. ...Details: PRECIPITANT: 15 % PEG400 2.5 % PEG 4000 2.5 % PEG 8000 10 % GLYCEROL 90 MM HEPES PH 7.5 PROTEIN KIRBAC 3.1, 8MG/ML 150MM KCL 20MM TRIS PH 8.0 20MM TETRABUTYL AMMONIUM BROMIDE 4MM CYMAL-5 0.05% TDM PROTEIN AND PRECIPITANT WERE MIXED TOGETHER IN A 1:1 RATIO, AND EQUILIBRATED AGAINST RESERVOIR SOLUTION IN A SITTING-DROP VAPOUR-DIFFUSION SET-UP. |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: ADSC CCD / Detector: CCD / Date: Nov 10, 2008 / Details: MIRRORS |
Radiation | Monochromator: SILICON CRYSTAL / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength: 0.957 Å / Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 4→50 Å / Num. obs: 0 / % possible obs: 98.4 % / Observed criterion σ(I): -3 / Redundancy: 7.2 % / Biso Wilson estimate: 136.35 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.224 / Net I/σ(I): 9.5 |
-
Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: OTHER Starting model: NONE Resolution: 4.036→14.995 Å / SU ML: -0 / σ(F): 1.47 / Phase error: 25.27 / Stereochemistry target values: MLHL
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Solvent computation | Shrinkage radii: 0.9 Å / VDW probe radii: 1.11 Å / Solvent model: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 126.749 Å2 / ksol: 0.285 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters |
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 4.036→14.995 Å
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Refine LS restraints |
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Refine LS restraints NCS |
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LS refinement shell |
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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