PDB-2qw7: Carboxysome Subunit, CcmL

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2qw7

タイトル

Carboxysome Subunit, CcmL

要素

Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

キーワード

STRUCTURAL PROTEIN / pentamer

機能・相同性

EutN/Ccml / Bacterial microcompartment vertex (BMV) domain profile. / Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome shell vertex protein CcmL / EutN/Ccml superfamily / Ethanolamine utilisation protein EutN/carboxysome / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Beta Barrel / Mainly Beta / Carboxysome vertex protein CcmL

機能・相同性情報

生物種

Synechocystis sp. (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Tanaka, S. / Sawaya, M.R. / Kerfeld, C.A. / Yeates, T.O.

引用

ジャーナル: Science / 年: 2008
タイトル: Atomic-level models of the bacterial carboxysome shell.
著者: Tanaka, S. / Kerfeld, C.A. / Sawaya, M.R. / Cai, F. / Heinhorst, S. / Cannon, G.C. / Yeates, T.O.

履歴

登録	2007年8月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2008年3月4日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Source and taxonomy / Version format compliance
改定 1.2	2024年2月21日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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関連構造データ

関連構造データ	2rcfC 3bn4C 2qyr PDB 未公開エントリ 2qzm PDB 未公開エントリ C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4jvz-d 4yhc-2 6p1y-1 4n8f-d 5u6e-1 5gnm-3 3nvx-1 1uhe-1 5z9j-4 6hqd-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#114 - 2009年6月ヴォールト (Vaults) 類似性 (6)

登録構造単位

A: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

B: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

C: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

D: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

E: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

F: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

G: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

H: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

I: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

J: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

ヘテロ分子

120 kDa, 10 ポリマー
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1

A: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

B: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

C: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

D: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

E: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
59.9 kDa, 5 ポリマー
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2

F: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

G: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

H: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

I: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

J: Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
59.9 kDa, 5 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	64.428, 107.444, 72.264
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 96.510, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E
6	1	F
7	1	G
8	1	H
9	1	I
10	1	J

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: MET / Beg label comp-ID: MET / End auth comp-ID: LYS / End label comp-ID: LYS / Refine code: 3 / Auth seq-ID: 1 - 95 / Label seq-ID: 1 - 95

Dom-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	A	A
2	B	B
3	C	C
4	D	D
5	E	E
6	F	F
7	G	G
8	H	H
9	I	I
10	J	J

詳細

one biological unit corresponds to a pentamer containing chains A,B,C,D,E. another biologinal unit corresponds to a pentamer containing chains F,G,H,I,J.

#1: タンパク質	Carbon dioxide concentrating mechanism protein ccmL 分子量: 11935.568 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Synechocystis sp. (バクテリア) / 株: PCC 6803 / 遺伝子: ccmL / プラスミド: pET22b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)Gold / 参照: UniProt: P72759
#2: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 90 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.08 Å³/Da / 溶媒含有率: 40.92 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 0.1M bis-Tris, 20% PEG3350, 0.3M NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ALS

/ ビームライン: 8.2.2 / 波長: 0.97944, 0.979617, 0.975593

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2006年9月14日

放射

モノクロメーター: Si 111 CHANNEL / プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	0.97944	1
2	0.979617	1
3	0.975593	1

反射

解像度: 2.4→90 Å / Num. all: 52537 / Num. obs: 52537 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(F): -3 / 冗長度: 3.3 % / R_merge(I) obs: 0.129 / Χ²: 1.046 / Net I/σ(I): 6.4

-
位相決定

位相決定

手法:

多波長異常分散

Phasing MAD

D res high: 2.7 Å / D res low: 19.98 Å / FOM : 0.21 / FOM acentric: 0.212 / FOM centric: 0.14 / 反射: 26439 / Reflection acentric: 25574 / Reflection centric: 865

Phasing MAD set

最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 19.98 Å

ID	R cullis acentric	R cullis centric	Loc acentric	Loc centric	Power acentric	Power centric	Reflection acentric	Reflection centric
1	0.98	0.95	13.7	17.9	0.35	0.27	25464	857
2	0.98	0.96	14	18.7	0.3	0.21	25518	860
3	2.03	1	0.1	0	0	0	25574	865

Phasing MAD set shell

ID	解像度 (Å)	R cullis acentric	R cullis centric	Loc acentric	Loc centric	Power acentric	Power centric	Reflection acentric	Reflection centric
1	11.1-19.98	0.91	0.83	12.6	26.1	0.52	0.32	296	38
1	7.69-11.1	0.93	0.85	13.1	16.3	0.63	0.37	743	63
1	5.88-7.69	0.94	0.9	10.3	18.2	0.64	0.33	1374	84
1	4.76-5.88	0.96	0.92	11.9	15.4	0.53	0.41	2229	102
1	4-4.76	0.98	0.99	13.4	17.7	0.43	0.33	3246	124
1	3.44-4	0.98	0.97	14.5	19.3	0.33	0.22	4511	143
1	3.03-3.44	0.99	1	14.1	16.5	0.31	0.22	5955	167
1	2.7-3.03	0.99	1	14.4	18.8	0.25	0.16	7110	136
2	11.1-19.98	0.97	1.05	10.6	17.4	0.47	0.36	296	38
2	7.69-11.1	0.95	0.94	10.8	16.2	0.6	0.29	743	63
2	5.88-7.69	0.95	0.91	10.4	21.5	0.51	0.22	1374	84
2	4.76-5.88	0.97	0.92	12.2	17.6	0.42	0.29	2229	101
2	4-4.76	0.98	0.98	13.3	19.9	0.36	0.24	3248	124
2	3.44-4	0.99	0.96	14.6	18.7	0.29	0.19	4512	144
2	3.03-3.44	0.99	0.99	14.8	19.7	0.26	0.16	5955	169
2	2.7-3.03	0.99	1	15	17.3	0.22	0.15	7161	137
3	11.1-19.98	1.38	1	0.1	0.1	0	0	296	38
3	7.69-11.1	1.44	1	0.1	0	0	0	743	63
3	5.88-7.69	1.91	1	0.1	0	0	0	1374	84
3	4.76-5.88	1.46	1	0.1	0	0	0	2229	102
3	4-4.76	1.48	1	0.1	0	0	0	3249	124
3	3.44-4	1.68	1	0	0	0	0	4515	144
3	3.03-3.44	2.69	1	0.1	0	0	0	5959	170
3	2.7-3.03	3.54	1	0	0	0	0	7209	140

Phasing MAD set site

ID	Atom type symbol	B iso	Fract x	Fract y	Fract z	Occupancy
1	Se	39.26	1	0.402	0.024	0.065
2	Se	26.098	1.041	0.413	-0.102	0.05
3	Se	12.586	1.154	0.485	-0.125	0.059
4	Se	33.843	1.13	0.57	-0.177	0.039
5	Se	40.104	1.125	0.649	-0.08	0.058
6	Se	18.692	1.004	0.696	-0.043	0.046
7	Se	20.516	0.946	0.67	0.088	0.05
8	Se	27.89	0.831	0.612	0.123	0.045
9	Se	22.275	0.863	0.516	0.156	0.056
10	Se	16.178	0.858	0.436	0.085	0.046
11	Se	27.569	0.503	0.245	0.473	0.053
12	Se	33.195	0.46	0.256	0.601	0.05
13	Se	22.906	0.342	0.329	0.624	0.055
14	Se	31.718	0.365	0.413	0.678	0.047
15	Se	30.869	0.375	0.492	0.58	0.051
16	Se	3.726	0.493	0.538	0.542	0.041
17	Se	31.847	0.551	0.513	0.411	0.057
18	Se	46.065	0.668	0.456	0.378	0.044
19	Se	35.209	0.633	0.359	0.343	0.058
20	Se	22.256	0.64	0.28	0.416	0.047
21	Se	30.533	0.999	0.403	0.025	0.042
22	Se	19.238	1.041	0.413	-0.101	0.038
23	Se	15.497	1.155	0.485	-0.124	0.044
24	Se	31.608	1.132	0.569	-0.177	0.038
25	Se	21.278	1.126	0.65	-0.082	0.034
26	Se	12.545	1.005	0.695	-0.042	0.035
27	Se	14.485	0.947	0.671	0.089	0.042
28	Se	16.5	0.83	0.613	0.122	0.032
29	Se	14.92	0.865	0.517	0.157	0.043
30	Se	12.7	0.858	0.436	0.085	0.032
31	Se	24.204	0.502	0.246	0.473	0.042
32	Se	27.461	0.459	0.256	0.6	0.038
33	Se	24.742	0.345	0.329	0.624	0.048
34	Se	20.489	0.366	0.413	0.678	0.04
35	Se	14.285	0.374	0.493	0.581	0.036
36	Se	11.815	0.496	0.538	0.544	0.041
37	Se	15.531	0.551	0.513	0.412	0.042
38	Se	31.654	0.668	0.456	0.379	0.031
39	Se	19.558	0.634	0.36	0.342	0.044
40	Se	22.835	0.641	0.28	0.415	0.036
41	Se	20.867	0.997	0.4	0.023	0
42	Se	5.058	1.04	0.409	-0.103	0
43	Se	10.85	1.156	0.482	-0.126	0
44	Se	30.049	1.136	0.566	-0.174	0
45	Se	21.79	1.125	0.648	-0.078	0
46	Se	19.759	1.003	0.691	-0.045	0
47	Se	7.555	0.948	0.67	0.087	0
48	Se	34.778	0.83	0.609	0.123	0
49	Se	14.483	0.856	0.515	0.154	0
50	Se	2.486	0.859	0.433	0.085	0
51	Se	19.622	0.503	0.242	0.475	0
52	Se	20.316	0.461	0.251	0.604	0
53	Se	8.813	0.342	0.326	0.626	0
54	Se	24.154	0.363	0.409	0.676	0
55	Se	20.318	0.372	0.491	0.58	0
56	Se	18.324	0.497	0.533	0.547	0
57	Se	3.087	0.551	0.512	0.413	0
58	Se	31.15	0.675	0.455	0.382	0
59	Se	19.598	0.641	0.358	0.346	0
60	Se	7.777	0.64	0.276	0.416	0

Phasing MAD shell

解像度 (Å)	FOM	FOM acentric	FOM centric	反射	Reflection acentric	Reflection centric
11.1-19.98	0.298	0.302	0.271	334	296	38
7.69-11.1	0.336	0.348	0.196	806	743	63
5.88-7.69	0.331	0.338	0.225	1458	1374	84
4.76-5.88	0.277	0.281	0.196	2331	2229	102
4-4.76	0.237	0.241	0.126	3373	3249	124
3.44-4	0.214	0.217	0.129	4659	4515	144
3.03-3.44	0.195	0.199	0.08	6129	5959	170
2.7-3.03	0.143	0.144	0.083	7349	7209	140

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類	NB
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散 / 解像度: 2.4→19.9 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.944 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.917 / SU B: 25.057 / SU ML: 0.288 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.398 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.296	1511	5 %	RANDOM
R_work	0.24	-	-	-
obs	0.243	30053	78.92 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 22.143 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.03 Å²	0 Å²	-0.02 Å²
2-	-	0.03 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.01 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→19.9 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7155	0	24	90	7269

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.018	0.022	7328
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.005	0.02	4962
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	2.404	1.993	9898
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	2.353	3	12173
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	4.014	5	960
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	39.342	24.191	272
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	18.684	15	1309
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	14.569	15	59
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.136	0.2	1198
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.007	0.02	8038
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.003	0.02	1339
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.224	0.3	1334
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.243	0.3	5271
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.18	0.5	3276
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.107	0.5	4465
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.262	0.5	450
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other	0.119	0.5	8
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.287	0.3	22
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.283	0.3	88
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.286	0.5	5
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	2.713	2	5986
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.244	2	1999
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	3.532	3	7595
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	3.756	2	2935
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	4.945	3	2296

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	549	TIGHT POSITIONAL	0.08	0.05
2	B	549	TIGHT POSITIONAL	0.07	0.05
3	C	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
4	D	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
5	E	549	TIGHT POSITIONAL	0.07	0.05
6	F	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
7	G	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
8	H	549	TIGHT POSITIONAL	0.08	0.05
9	I	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
10	J	549	TIGHT POSITIONAL	0.06	0.05
1	A	597	LOOSE POSITIONAL	0.75	5
2	B	597	LOOSE POSITIONAL	0.79	5
3	C	597	LOOSE POSITIONAL	0.84	5
4	D	597	LOOSE POSITIONAL	0.82	5
5	E	597	LOOSE POSITIONAL	0.88	5
6	F	597	LOOSE POSITIONAL	1.04	5
7	G	597	LOOSE POSITIONAL	0.82	5
8	H	597	LOOSE POSITIONAL	1.02	5
9	I	597	LOOSE POSITIONAL	0.9	5
10	J	597	LOOSE POSITIONAL	0.76	5
1	A	549	TIGHT THERMAL	0.27	0.5
2	B	549	TIGHT THERMAL	0.25	0.5
3	C	549	TIGHT THERMAL	0.17	0.5
4	D	549	TIGHT THERMAL	0.2	0.5
5	E	549	TIGHT THERMAL	0.22	0.5
6	F	549	TIGHT THERMAL	0.18	0.5
7	G	549	TIGHT THERMAL	0.18	0.5
8	H	549	TIGHT THERMAL	0.22	0.5
9	I	549	TIGHT THERMAL	0.19	0.5
10	J	549	TIGHT THERMAL	0.46	0.5
1	A	597	LOOSE THERMAL	3.79	10
2	B	597	LOOSE THERMAL	3.55	10
3	C	597	LOOSE THERMAL	3.35	10
4	D	597	LOOSE THERMAL	3.38	10
5	E	597	LOOSE THERMAL	3.68	10
6	F	597	LOOSE THERMAL	3.52	10
7	G	597	LOOSE THERMAL	3.54	10
8	H	597	LOOSE THERMAL	3.37	10
9	I	597	LOOSE THERMAL	3.37	10
10	J	597	LOOSE THERMAL	3.3	10

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.464 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.719	29	-
R_work	0.297	554	-
all	-	583	-
obs	-	-	21.15 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.3084	-0.0054	-0.4565	3.2253	0.0676	1.2991	0.158	-0.0235	0.174	-0.1529	0.0624	-0.1852	-0.0456	-0.039	-0.2204	-0.1847	0.0166	-0.1427	-0.0287	0.0025	-0.2441	68.065	58.0088	3.7642
2	1.275	-0.0756	-0.4379	2.5899	0.2639	1.2607	-0.1214	0.0067	-0.1536	-0.0965	0.0587	-0.1372	0.1014	-0.0556	0.0627	-0.0934	0.0117	-0.0141	-0.0581	0.012	-0.1266	32.0339	95.0465	39.7481

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	1 - 96	1 - 96
2	X-RAY DIFFRACTION	1	B	B	1 - 96	1 - 96
3	X-RAY DIFFRACTION	1	C	C	1 - 95	1 - 95
4	X-RAY DIFFRACTION	1	D	D	1 - 96	1 - 96
5	X-RAY DIFFRACTION	1	E	E	1 - 96	1 - 96
6	X-RAY DIFFRACTION	2	F	F	1 - 96	1 - 96
7	X-RAY DIFFRACTION	2	G	G	1 - 96	1 - 96
8	X-RAY DIFFRACTION	2	H	H	1 - 96	1 - 96
9	X-RAY DIFFRACTION	2	I	I	1 - 96	1 - 96
10	X-RAY DIFFRACTION	2	J	J	1 - 96	1 - 96

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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