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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2pgh | |||||||||
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タイトル | STRUCTURE DETERMINATION OF AQUOMET PORCINE HEMOGLOBIN AT 2.8 ANGSTROM RESOLUTION | |||||||||
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![]() | OXYGEN TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() hemoglobin alpha binding / haptoglobin binding / haptoglobin-hemoglobin complex / organic acid binding / hemoglobin complex / hydrogen peroxide catabolic process / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / blood microparticle ...hemoglobin alpha binding / haptoglobin binding / haptoglobin-hemoglobin complex / organic acid binding / hemoglobin complex / hydrogen peroxide catabolic process / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / blood microparticle / iron ion binding / heme binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Katz, D.S. / White, S.P. / Huang, W. / Kumar, R. / Christianson, D.W. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure determination of aquomet porcine hemoglobin at 2.8 A resolution. 著者: Katz, D.S. / White, S.P. / Huang, W. / Kumar, R. / Christianson, D.W. #1: ![]() タイトル: Production of Hemoglobin in Transgenic Swine: An Approach to a Blood Substitute 著者: O'Donnell, J.K. / Martin, M.J. / Logan, J.S. / Kumar, R. #2: ![]() 年: 1992 タイトル: The Purification and Comparative Analysis of Hemoglobin from Animal Bloods 著者: Lee, C.J. / Kan, P. / Chen, W.K. #3: ![]() タイトル: Production of Functional Human Hemoglobin in Transgenic Swine 著者: Swanson, M.E. / Martin, M.J. / O'Donnell, J.K. / Hoover, K. / Sago, W. / Huntress, V. / Parsons, C.T. / Pinkert, C.A. / Pilder, S. / Logan, J.S. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 126.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 99.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 686.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 723.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 26.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15064.144 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 16059.345 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #3: 化合物 | ChemComp-HEM / #4: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | THE DEPOSITORS CONCLUDE THAT THEIR CRYSTALS ARE OF AQUOMET FORM BECAUSE: A) PRECAUTIONS SIMILAR TO ...THE DEPOSITORS | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.36 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.79 % | ||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.8 Å / Num. obs: 13290 / Num. measured all: 44042 / Rmerge(I) obs: 0.087 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.8→6.5 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→6.5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.154 / Rfactor Rfree: 0.295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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