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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mfl | ||||||
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タイトル | Domain 2 of E. coli ribosomal protein S1 | ||||||
要素 | 30S ribosomal protein S1 | ||||||
キーワード | RIBOSOMAL PROTEIN / S1 / ribosome binding / translation initiation / RNA binding | ||||||
機能・相同性 | : 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
データ登録者 | Giraud, P. / Crechet, J. / Bontems, F. / Uzan, M. / Sizun, C. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biomol.Nmr Assign. / 年: 2015 タイトル: Resonance assignment of the ribosome binding domain of E. coli ribosomal protein S1. 著者: Giraud, P. / Crechet, J.B. / Uzan, M. / Bontems, F. / Sizun, C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2mfl.cif.gz | 351.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2mfl.ent.gz | 290.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2mfl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2mfl_validation.pdf.gz | 543.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2mfl_full_validation.pdf.gz | 622.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2mfl_validation.xml.gz | 20.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2mfl_validation.cif.gz | 37.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mf/2mfl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mf/2mfl | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19983.512 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 1-179 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 遺伝子: rpsA, EcDH1_2732, ECDH1ME8569_0862 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: C9QZU1 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.2 / pH: 6.8 / 圧: 1.000 atm / 温度: 293.000 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 660 / NOE intraresidue total count: 198 / NOE long range total count: 195 / NOE medium range total count: 67 / NOE sequential total count: 200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |