+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2lgi | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Atomic Resolution Protein Structures using NMR Chemical Shift Tensors | ||||||
![]() | Immunoglobulin G-binding protein G | ||||||
![]() | PROTEIN BINDING / GB1 / IMMUNOGLOBULIN BINDING DOMAIN / TEDOR / IGG-BINDING PROTEIN / PEPTIDOGLYCAN-ANCHOR / SECRETED / THERMOSTABLE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 個体NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 10 | ||||||
![]() | Wylie, B.J. / Sperling, L.J. / Nieuwkoop, A.J. / Franks, W.T. / Oldfield, E. / Rienstra, C.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Ultrahigh resolution protein structures using NMR chemical shift tensors. 著者: Wylie, B.J. / Sperling, L.J. / Nieuwkoop, A.J. / Franks, W.T. / Oldfield, E. / Rienstra, C.M. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 171.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 141.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 401.2 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 455.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
---|---|
類似構造データ | |
その他のデータベース |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: 抗体 | 分子量: 6228.809 Da / 分子数: 1 / 断片: 2-1 repeat region residues 229-282 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: spg / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 個体NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | 内容: 20 mg U-2-13C-glycerol; U-100% 15N GB1 / 溶媒系: solid |
---|---|
試料 | 濃度: 20 mg/mL / 構成要素: GB1-1 / Isotopic labeling: U-2-13C-glycerol; U-100% 15N |
試料状態 | イオン強度: 50 / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 273 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian Infinity Plus / 製造業者: Varian / モデル: Infinity Plus / 磁場強度: 500 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |