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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kce | ||||||
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タイトル | BINDING OF THE ANTICANCER DRUG ZD1694 TO E. COLI THYMIDYLATE SYNTHASE: ASSESSING SPECIFICITY AND AFFINITY | ||||||
![]() | THYMIDYLATE SYNTHASE | ||||||
![]() | METHYLTRANSFERASE / REACTION INTERMEDIATE / ANTIFOLATE / DRUG DESIGN | ||||||
機能・相同性 | ![]() thymidylate synthase / thymidylate synthase activity / dTMP biosynthetic process / dTTP biosynthetic process / response to radiation / regulation of translation / methylation / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / RNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Rutenber, E.E. / Stroud, R.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Binding of the anticancer drug ZD1694 to E. coli thymidylate synthase: assessing specificity and affinity. 著者: Rutenber, E.E. / Stroud, R.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 151.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 121.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 575.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 592 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 21.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30515.654 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.57 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.4 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 8 / 詳細: pH 8.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 23 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 300 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS-NICOLET X100 / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1994年1月1日 |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2.2 Å / Num. obs: 249261 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 8.2 % / Rmerge(I) obs: 0.101 |
反射 | *PLUS Num. obs: 30531 / Num. measured all: 249261 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.4 Å / % possible obs: 99 % / 冗長度: 5.2 % / Num. possible: 6047 / Num. unique obs: 2109 / Num. measured obs: 31268 / Rmerge(I) obs: 0.351 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→7 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→7 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.2→2.4 Å / Total num. of bins used: 5 /
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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