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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2g4y | ||||||
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タイトル | structure of thaumatin at 2.0 A wavelength | ||||||
![]() | Thaumatin-1![]() | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mueller-Dieckmann, C. / Weiss, M.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: On the routine use of soft X-rays in macromolecular crystallography. Part IV. Efficient determination of anomalous substructures in biomacromolecules using longer X-ray wavelengths. 著者: Mueller-Dieckmann, C. / Panjikar, S. / Schmidt, A. / Mueller, S. / Kuper, J. / Geerlof, A. / Wilmanns, M. / Singh, R.K. / Tucker, P.A. / Weiss, M.S. | ||||||
履歴 |
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Remark 999 | SEQUENCE THERE ARE TWO ISOFORMS OF THAUMATION, I AND II. LYS46 FROM THE FORM I IS USED BECAUSE THE ...SEQUENCE THERE ARE TWO ISOFORMS OF THAUMATION, I AND II. LYS46 FROM THE FORM I IS USED BECAUSE THE CRYSTALLIZATION MATERIAL CONTAINS A MIXTURE OF LYS AND ASN. ASP IS USED AT POSITION 113 AS SUGGESTED BY KO ET AL., ACTA CRYST. D50,813(1994) |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 49.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 39 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2g4hC ![]() 2g4iC ![]() 2g4jC ![]() 2g4kC ![]() 2g4lC ![]() 2g4mC ![]() 2g4nC ![]() 2g4oC ![]() 2g4pC ![]() 2g4qC ![]() 2g4rC ![]() 2g4sC ![]() 2g4tC ![]() 2g4uC ![]() 2g4vC ![]() 2g4wC ![]() 2g4xC ![]() 2g4zC ![]() 2g51C ![]() 2g52C ![]() 2g55C ![]() 2illC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 22243.119 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-TAR / ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.83 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.57 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2005年1月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.98→30 Å / Num. obs: 18622 / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 30.25 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.98→30 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.98→2.031 Å / Total num. of bins used: 20
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