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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1z7t | ||||||
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タイトル | Solution structure of Bacillus subtilis BLAP apo-form | ||||||
![]() | Biotin/Lipoyl Attachment Protein | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / Bacillus subtilis / single-domain Biotin Carboxyl Carrier Protein / solution structure / apo-form / STRUCTURAL GENOMICS | ||||||
機能・相同性 | ![]() RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain / Biotin-requiring enzyme / Biotinyl/lipoyl domain profile. / Biotin/lipoyl attachment / Single hybrid motif / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Beta Barrel / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
![]() | Cui, G. / Xia, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of Bacillus subtilis BLAP apo-form 著者: Cui, G. / Xia, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 436.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 366.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 343.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 414.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 35.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7920.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 生物種: Bacillus subtilis / 株: subsp. subtilis str. 168 / プラスミド: pET 21a(+) / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 3D heteronuclear techniques. |
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試料調製
詳細 | 内容: 1.2mM s-BCCP U-15N, 13C; 50mM phosphate buffer NA; 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 150mM / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: the structures are based on a total of 4125 restraints. 3731 are NOE-derived distance constraints, 109 dihedral angle restraints,28 distance restraints from hydrogen bonds, 257 charity restraints. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |