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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qpv | ||||||
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タイトル | YEAST COFILIN | ||||||
![]() | YEAST COFILIN | ||||||
![]() | ACTIN-BINDING PROTEIN / THREE LAYERS:ALPHA/MIXED BETA/ALPHA / COFILIN FOLD | ||||||
機能・相同性 | ![]() actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton ...actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fedorov, A.A. / Lappalainen, P. / Fedorov, E.V. / Drubin, D.G. / Almo, S.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure determination of yeast cofilin. 著者: Fedorov, A.A. / Lappalainen, P. / Fedorov, E.V. / Drubin, D.G. / Almo, S.C. #1: ![]() タイトル: Essential Functions and Actin-Binding Surfaces of Yeast Cofilin Revealed by Systematic Mutagenesis 著者: Lappalainen, P. / Fedorov, E.V. / Fedorov, A.A. / Almo, S.C. / Drubin, D.G. #2: ![]() タイトル: Cofilin Promotes Rapid Actin Filament Turnover in Vivo 著者: Lappalainen, P. / Drubin, D.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 36.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 362.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 369.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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詳細 | biological unit is monomer |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15919.742 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 38 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.4 詳細: PEG 4000 , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995年2月15日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3→25.2 Å / Num. all: 2529 / Num. obs: 2377 / % possible obs: 89.1 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 2.9 % / Biso Wilson estimate: 16.2 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.083 / Net I/σ(I): 19.8 |
反射 シェル | 解像度: 3→3.1 Å / 冗長度: 2.2 % / Rmerge(I) obs: 0.185 / Mean I/σ(I) obs: 4.9 / % possible all: 77.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1COF 解像度: 3→8 Å / Isotropic thermal model: RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file | Serial no: 1 / Param file: PROTEIN_REP.PARAM / Topol file: TOPHCSDX.PRO |