+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hm4 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | N219L PENTALENENE SYNTHASE | ||||||
![]() | PENTALENENE SYNTHASE | ||||||
![]() | LYASE / sesquiterpene synthase / pentalenene / terpene / ANTIBIOTIC BIOSYNTHESIS | ||||||
機能・相同性 | ![]() pentalenene synthase / pentalenene synthase activity / antibiotic biosynthetic process / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Seemann, M. / Paschall, C.M. / Christianson, D.W. / Cane, D.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Pentalenene synthase. Analysis of active site residues by site-directed mutagenesis. 著者: Seemann, M. / Zhai, G. / de Kraker, J.W. / Paschall, C.M. / Christianson, D.W. / Cane, D.E. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 115 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 91.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 376.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 407.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ![]()
| ||||||||||
2 | ![]()
| ||||||||||
単位格子 |
| ||||||||||
詳細 | The biological assembly is a monomer |
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 37918.273 Da / 分子数: 2 / 変異: N219L / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 64 % |
---|---|
結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: (NH4)2SO4, ethanol, MgCl2, Hepes pH 7.0, farnesyl diphosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 200 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1999年10月7日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: Yale Mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.47→20 Å / Num. all: 14067 / Num. obs: 12861 / % possible obs: 91.4 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.64 % / Biso Wilson estimate: 37.8 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.16 / Rsym value: 0.16 / Net I/σ(I): 8.9 |
反射 シェル | 解像度: 3.47→3.59 Å / 冗長度: 1 % / Rmerge(I) obs: 0.385 / Mean I/σ(I) obs: 3.9 / Num. unique all: 1341 / Rsym value: 0.385 / % possible all: 96.8 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 20 Å |
-
解析
ソフトウェア |
| |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1PS1 解像度: 3.47→20 Å / Isotropic thermal model: Anisotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
| |||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
| |||||||||||||||||||||
Refine analyze |
| |||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.47→20 Å
| |||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| |||||||||||||||||||||
LS精密化 シェル | 解像度: 3.47→3.59 Å /
| |||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 20 Å | |||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
|