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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1f9m | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN F FROM SPINACH CHLOROPLAST (SHORT FORM) | ||||||
![]() | THIOREDOXIN F | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Capitani, G. / Markovic-Housley, Z. / DelVal, G. / Morris, M. / Jansonius, J.N. / Schurmann, P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of two functionally different thioredoxins in spinach chloroplasts. 著者: Capitani, G. / Markovic-Housley, Z. / DelVal, G. / Morris, M. / Jansonius, J.N. / Schurmann, P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 53.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 42.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 420.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 422.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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詳細 | The biological assembly is a monomer |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12507.648 Da / 分子数: 2 / 断片: SHORT FORM / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 細胞内の位置: CHLOROPLAST / プラスミド: PET-3D / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.43 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.44 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.8 詳細: ammonium sulphate, sodium acetate, PEG 4000, pH 5.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年10月2日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.86→25.5 Å / Num. obs: 20015 / % possible obs: 98.9 % / 冗長度: 2.9 % / Biso Wilson estimate: 19.8 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.082 / Net I/σ(I): 5.7 |
反射 シェル | 解像度: 1.86→1.96 Å / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.237 / % possible all: 95.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.86→25.5 Å / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber / 詳細: Used bulk solvent correction (X-PLOR 3.851)
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.86→25.5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | |||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 25.5 Å / σ(F): 0 / % reflection Rfree: 4.8 % / Rfactor obs: 0.197 | |||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 22.3 Å2 | |||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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