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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1.0E+68 | ||||||
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タイトル | Solution structure of bacteriocin AS-48 | ||||||
要素 | AS-48 PROTEIN | ||||||
キーワード | ANTIBIOTIC / BACTERIOCINS / CATIONIC ANTIBACTERIAL PEPTIDES / FIVE-HELIX GLOBULE / CYCLIC POLYPEPTIDE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 killing of cells of another organism / defense response to bacterium / extracellular region / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ENTEROCOCCUS FAECALIS (乳酸球菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS | ||||||
データ登録者 | Gonzalez, C. / Langdon, G. / Bruix, M. / Galvez, A. / Valdivia, E. / Maqueda, M. / Rico, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2000 タイトル: Bacteriocin as-48, a Microbial Cyclic Polypeptide Structurally and Functionally Related to Mammalian Nk-Lysin 著者: Gonzalez, C. / Langdon, G. / Bruix, M. / Galvez, A. / Valdivia, E. / Maqueda, M. / Rico, M. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1998 タイトル: Sequence-Specific 1H Assignment and Secondary Structure of the Bacteriocin as-48 Cyclic Peptide 著者: Langdon, G. / Bruix, M. / Galvez, A. / Valdivia, E. / Maqueda, M. / Rico, M. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1e68.cif.gz | 406.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1e68.ent.gz | 342.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1e68.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e6/1e68 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e6/1e68 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7177.538 Da / 分子数: 1 / 断片: BACTERIOCIN AS-48, RESIDUES 36-105 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: PEPTIDE LINK BETWEEN RESIDUES 1 AND 70 / 由来: (天然) ENTEROCOCCUS FAECALIS (乳酸球菌) / プラスミド: PMB2 / 参照: UniProt: Q47765 |
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構成要素の詳細 | PEPTIDE LINK BETWEEN RESIDUES 1 AND 70 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
試料状態 | pH: 3 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NONE / 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |