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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1axk | ||||||
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タイトル | ENGINEERED BACILLUS BIFUNCTIONAL ENZYME GLUXYN-1 | ||||||
![]() | GLUXYN-1 | ||||||
![]() | FUSION PROTEIN / GLUXYN-1 / BIFUNCTIONAL / 1 / 4-BETA-XYLANASE / 3-1 / 4-BETA-GLUCANASE / HYBRID ENZYME | ||||||
機能・相同性 | ![]() licheninase activity / licheninase / endo-1,4-beta-xylanase activity / endo-1,4-beta-xylanase / xylan catabolic process / carbohydrate metabolic process 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ay, J. / Heinemann, U. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure and function of the Bacillus hybrid enzyme GluXyn-1: native-like jellyroll fold preserved after insertion of autonomous globular domain. 著者: Ay, J. / Gotz, F. / Borriss, R. / Heinemann, U. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 166.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 133.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 434.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 446.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 46.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43812.676 Da / 分子数: 2 断片: FUSION OF 1,3-1,4-BETA-GLUCANASE DOMAIN AND 1,4-BETA-XYLANASE DOMAIN 由来タイプ: 組換発現 詳細: ACTIVE AS BOTH A 1,3-1,4-BETA-GLUCANASE AND A 1,4-BETA-XYLANASE 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P23904, UniProt: P18429, licheninase, endo-1,4-beta-xylanase #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.4 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 8.5 / 詳細: pH 8.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 8.7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 123 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年8月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.008 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→20 Å / Num. obs: 48499 / % possible obs: 91.3 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.4 % / Biso Wilson estimate: 23.98 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.058 / Rsym value: 0.058 / Net I/σ(I): 11.6 |
反射 シェル | 解像度: 2.1→2.21 Å / 冗長度: 3.2 % / Rmerge(I) obs: 0.23 / Mean I/σ(I) obs: 3.3 / Rsym value: 0.23 / % possible all: 80 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 165157 |
反射 シェル | *PLUS 最低解像度: 2.17 Å / % possible obs: 80 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: CIRCULARLY PERMUTED 1,3-1,4-ENDO-BETA-GLUCANASE CPMAC57 (PDB ENTRY 1CPN) AND BACILLUS CIRCULANS 1,3-ENDO-BETA-XYLANASE (PDB ENTRY 1BCX). 解像度: 2.1→19.96 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.7 Å2
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.3 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→19.96 Å
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拘束条件 |
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