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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aqn | ||||||
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タイトル | SUBTILISIN MUTANT 8324 | ||||||
![]() | SUBTILISIN 8324 | ||||||
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機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Whitlow, M. / Howard, A.J. / Wood, J.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Large increases in general stabilityfor subtilisin BPN' through incremental changes in the free energy of unfolding 著者: Muralikrishna, P. / Wickstrom, E. #1: ![]() タイトル: The Engineering of Binding Affinity at Metal Ion Binding Sites for the Stabilization of Proteins: Subtilisin as a Test Case 著者: Pantoliano, M.W. / Whitlow, M. / Wood, J.F. / Rollence, M.L. / Finzel, B.C. / Gilliland, G.L. / Poulos, T.L. / Bryan, P.N. #2: ![]() タイトル: Protein Engineering of Subtilisin Bpn': Enhanced Stabilization Through the Introduction of Two Cysteines to Form a Disulfide Bond 著者: Pantoliano, M.W. / Ladner, R.C. / Bryan, P.N. / Rollence, M.L. / Wood, J.F. / Poulos, T.L. #3: ![]() タイトル: Proteases of Enhanced Stability: Characterization of a Thermostable Variant of Subtilisin 著者: Bryan, P.N. / Rollence, M.L. / Pantoliano, M.W. / Wood, J. / Finzel, B.C. / Gilliland, G.L. / Howard, A.J. / Poulos, T.L. #4: ![]() タイトル: Atomic Coordinates for Subtilisin Bpn' (or Novo) 著者: Alden, R.A. / Birktoft, J.J. / Kraut, J. / Robertus, J.D. / Wright, C.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 64.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 49.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 27514.631 Da / 分子数: 1 / 変異: T22C, M50F, S87C, G169A, Q206C, Y217K, N218S / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 株: GX8324 / 細胞内の位置: SECRETED ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | ![]() #5: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.61 % |
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結晶化![]() | 手法: 蒸気拡散法 / pH: 8.7 詳細: CRYSTAL WERE GROWN BY VAPOR DIFFUSION OF 10 MG/ML PROTEIN IN 100 MM TRIS-HCL PH 8.7, 40 MM CACL2 AGAINST 20% 2-PROPANOL., vapor diffusion |
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: Bryan, P.N., (1986) Proteins: Struct.,Funct., Genet., 1, 326. |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 55 % / 一般名: acetone |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 290 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1987年5月20日 / 詳細: HUBER MONOCHROMATOR |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.73→99 Å / Num. obs: 18552 / % possible obs: 79.8 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.7 % / Rsym value: 0.0634 / Net I/σ(I): 17.3 |
反射 シェル | 解像度: 1.73→1.84 Å / 冗長度: 2.33 % / Mean I/σ(I) obs: 2.9 / Rsym value: 0.3174 / % possible all: 41.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROFFT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.139 / Rfactor Rwork![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |