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- EMDB-4735: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4735
タイトルStructure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.
マップデータStructure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.
試料
  • 複合体: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.
    • 複合体: Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.
      • タンパク質・ペプチド: x 84種
      • RNA: x 8種
    • 複合体: P- and E- site tRNA
    • 複合体: X-box-binding protein 1
    • 複合体: mRNA encoding XBP1u
    • 複合体: SRP
    • 複合体: Signal sequence (HR2)
  • リガンド: x 2種
キーワードtranslational pausing / XBP1 / UPR / cotranslational targeting / SRP. / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


epithelial cell maturation involved in salivary gland development / positive regulation of vascular wound healing / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / ATF6-mediated unfolded protein response / positive regulation of protein acetylation / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition / endoplasmic reticulum signal peptide binding / response to insulin-like growth factor stimulus / signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting / glandular epithelial cell maturation ...epithelial cell maturation involved in salivary gland development / positive regulation of vascular wound healing / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / ATF6-mediated unfolded protein response / positive regulation of protein acetylation / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition / endoplasmic reticulum signal peptide binding / response to insulin-like growth factor stimulus / signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting / glandular epithelial cell maturation / positive regulation of lactation / sterol homeostasis / IRE1alpha activates chaperones / ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperone genes / positive regulation of plasma cell differentiation / positive regulation of phospholipid biosynthetic process / negative regulation of myotube differentiation / positive regulation of ERAD pathway / signal recognition particle binding / intracellular triglyceride homeostasis / granulocyte differentiation / protein targeting to ER / signal-recognition-particle GTPase / negative regulation of translational elongation / cellular response to fructose stimulus / cellular response to laminar fluid shear stress / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation / XBP1(S) activates chaperone genes / 7S RNA binding / cellular response to nutrient / positive regulation of hepatocyte proliferation / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / cellular response to fluid shear stress / positive regulation of MHC class II biosynthetic process / negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response / exocrine pancreas development / positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration / endothelial cell proliferation / ribosomal subunit / positive regulation of T cell differentiation / cellular response to peptide hormone stimulus / positive regulation of B cell differentiation / positive regulation of immunoglobulin production / muscle organ development / IRE1-mediated unfolded protein response / negative regulation of SMAD protein signal transduction / ubiquitin ligase inhibitor activity / intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / positive regulation of endothelial cell apoptotic process / cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus / positive regulation of TOR signaling / positive regulation of fat cell differentiation / 90S preribosome / adipose tissue development / fatty acid homeostasis / vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway / neuron development / phagocytic cup / ribonucleoprotein complex binding / negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / endoplasmic reticulum unfolded protein response / cellular response to glucose starvation / cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / ribosomal small subunit export from nucleus / positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation / rough endoplasmic reticulum / translation regulator activity / gastrulation / ERAD pathway / MDM2/MDM4 family protein binding / neutrophil chemotaxis / positive regulation of autophagy / cytosolic ribosome / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / cellular response to interleukin-4 / response to endoplasmic reticulum stress / cholesterol homeostasis / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / cellular response to leukemia inhibitory factor / ribosomal large subunit biogenesis / positive regulation of apoptotic signaling pathway / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / nuclear estrogen receptor binding / maturation of SSU-rRNA / RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / cellular response to amino acid stimulus / small-subunit processome / cellular response to glucose stimulus / regulation of cell growth / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / chromatin DNA binding / negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway / liver development / protein destabilization / regulation of protein stability / negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade / positive regulation of interleukin-6 production / positive regulation of protein import into nucleus
類似検索 - 分子機能
: / Signal recognition particle, SRP9 subunit / SRP9 domain / Signal recognition particle SRP9 / Signal recognition particle 9 kDa protein (SRP9) / Signal recognition particle, SRP14 subunit / Signal recognition particle, SRP9/SRP14 subunit / Signal recognition particle 14kD protein / Signal recognition particle subunit SRP68 / Signal recognition particle subunit SRP68, RNA-binding domain ...: / Signal recognition particle, SRP9 subunit / SRP9 domain / Signal recognition particle SRP9 / Signal recognition particle 9 kDa protein (SRP9) / Signal recognition particle, SRP14 subunit / Signal recognition particle, SRP9/SRP14 subunit / Signal recognition particle 14kD protein / Signal recognition particle subunit SRP68 / Signal recognition particle subunit SRP68, RNA-binding domain / SRP68, N-terminal domain superfamily / RNA-binding signal recognition particle 68 / Signal recognition particle, SRP54 subunit, eukaryotic / Signal recognition particle, SRP19 subunit / Signal recognition particle, subunit SRP19-like superfamily / SRP19 protein / SRP/SRP receptor, N-terminal / Signal recognition particle, SRP54 subunit / Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain / Signal recognition particle, SRP54 subunit, M-domain superfamily / Signal peptide binding domain / SRP54-type proteins GTP-binding domain signature. / Signal recognition particle SRP54, helical bundle / Signal recognition particle SRP54, N-terminal domain superfamily / SRP54-type protein, helical bundle domain / SRP54-type protein, helical bundle domain / Signal recognition particle, SRP54 subunit, GTPase domain / SRP54-type protein, GTPase domain / SRP54-type protein, GTPase domain / Basic region leucine zipper / Basic-leucine zipper (bZIP) domain signature. / Basic-leucine zipper (bZIP) domain profile. / basic region leucin zipper / Basic-leucine zipper domain / Basic-leucine zipper domain superfamily / 60S acidic ribosomal protein P0 / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L23 / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal protein L30e signature 1. / 60S ribosomal protein L10P, insertion domain / Insertion domain in 60S ribosomal protein L10P / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein L30/YlxQ / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein L27e, conserved site / S27a-like superfamily / Ribosomal protein L27e signature. / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein L10e / : / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L24e, conserved site / : / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / : / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Signal recognition particle 9 kDa protein / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL29 ...Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Signal recognition particle 9 kDa protein / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Large ribosomal subunit protein eL6 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein eL8 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein eS10 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL15/eL18 domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein eL27 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / 60S acidic ribosomal protein P0 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Signal recognition particle 19 kDa protein / Signal recognition particle 14 kDa protein / X-box-binding protein 1 / Signal recognition particle subunit SRP54 / Signal recognition particle subunit SRP68 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / Homo sapiens (ヒト) / Canis lupus familiaris (イヌ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.7 Å
データ登録者Shanmuganathan V / Cheng J
資金援助 ドイツ, 1件
OrganizationGrant number国
German Research FoundationGRK1721 ドイツ
引用ジャーナル: Elife / 年: 2019
タイトル: Structural and mutational analysis of the ribosome-arresting human XBP1u.
著者: Vivekanandan Shanmuganathan / Nina Schiller / Anastasia Magoulopoulou / Jingdong Cheng / Katharina Braunger / Florian Cymer / Otto Berninghausen / Birgitta Beatrix / Kenji Kohno / Gunnar von ...著者: Vivekanandan Shanmuganathan / Nina Schiller / Anastasia Magoulopoulou / Jingdong Cheng / Katharina Braunger / Florian Cymer / Otto Berninghausen / Birgitta Beatrix / Kenji Kohno / Gunnar von Heijne / Roland Beckmann /
要旨: XBP1u, a central component of the unfolded protein response (UPR), is a mammalian protein containing a functionally critical translational arrest peptide (AP). Here, we present a 3 Å cryo-EM ...XBP1u, a central component of the unfolded protein response (UPR), is a mammalian protein containing a functionally critical translational arrest peptide (AP). Here, we present a 3 Å cryo-EM structure of the stalled human XBP1u AP. It forms a unique turn in the ribosomal exit tunnel proximal to the peptidyl transferase center where it causes a subtle distortion, thereby explaining the temporary translational arrest induced by XBP1u. During ribosomal pausing the hydrophobic region 2 (HR2) of XBP1u is recognized by SRP, but fails to efficiently gate the Sec61 translocon. An exhaustive mutagenesis scan of the XBP1u AP revealed that only 8 out of 20 mutagenized positions are optimal; in the remaining 12 positions, we identify 55 different mutations increase the level of translational arrest. Thus, the wildtype XBP1u AP induces only an intermediate level of translational arrest, allowing efficient targeting by SRP without activating the Sec61 channel.
履歴
登録2019年3月27日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年7月10日-
マップ公開2019年7月10日-
更新2024年11月13日-
現状2024年11月13日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.08
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.08
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6r6g
  • 表面レベル: 0.08
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4735.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4735.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 236.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.08 Å/pix.
x 396 pix.
= 429.264 Å		1.08 Å/pix.
x 396 pix.
= 429.264 Å		1.08 Å/pix.
x 396 pix.
= 429.264 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.084 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.08 / ムービー #1: 0.08
最小 - 最大-0.45232785 - 0.6131792
平均 (標準偏差)0.001940717 (±0.025703479)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ396396396
Spacing396396396
セルA=B=C: 429.264 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0841.0841.084
M x/y/z396396396
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z429.264429.264429.264
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS396396396
D min/max/mean-0.4520.6130.002

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添付データ

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追加マップ: Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP...

ファイルemd_4735_additional.map
注釈Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP (lowpass filtered at 6 A)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

+
全体 : Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.

全体名称: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.
要素
  • 複合体: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.
    • 複合体: Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.
      • タンパク質・ペプチド: eS31
      • タンパク質・ペプチド: X-box-binding protein 1
      • RNA: P-tRNA
      • RNA: E-tRNA
      • RNA: mRNA
      • RNA: 28S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein RACK1
      • RNA: 5S ribosomal RNA
      • RNA: 5.8S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: uS14
      • タンパク質・ペプチド: uL2
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
      • タンパク質・ペプチド: uL3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: uL4
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S9 (Predicted)
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S11
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S28
      • タンパク質・ペプチド: uL30
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S20
      • タンパク質・ペプチド: eL8
      • タンパク質・ペプチド: uL6
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L10 (Predicted)
      • タンパク質・ペプチド: uS13
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L11
      • RNA: 18S ribosomal RNA
      • タンパク質・ペプチド: eS17
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L14
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13a
      • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS25
      • タンパク質・ペプチド: uL22
      • タンパク質・ペプチド: eS19
      • タンパク質・ペプチド: eL18
      • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS15
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: eL20
      • タンパク質・ペプチド: eS10
      • タンパク質・ペプチド: eL21
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S15a
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S16
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S23
      • タンパク質・ペプチド: eL14
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24
      • タンパク質・ペプチド: uS19
      • タンパク質・ペプチド: uL23
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L26
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: uL15
      • タンパク質・ペプチド: eL29
      • タンパク質・ペプチド: eL30
      • タンパク質・ペプチド: eL31
      • タンパク質・ペプチド: eL32
      • タンパク質・ペプチド: eL33
      • タンパク質・ペプチド: eL34
      • タンパク質・ペプチド: uL29
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
      • タンパク質・ペプチド: eL39
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40
      • タンパク質・ペプチド: 60s ribosomal protein l41
      • タンパク質・ペプチド: eL42
      • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL43
      • タンパク質・ペプチド: uS2
      • タンパク質・ペプチド: eL28
      • タンパク質・ペプチド: 60S acidic ribosomal protein P0
      • タンパク質・ペプチド: uL11
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
      • タンパク質・ペプチド: uS5
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
      • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 54 kDa protein
      • RNA: 7S RNA
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle subunit SRP19
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle subunit SRP68
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 9 kDa protein
      • タンパク質・ペプチド: Signal recognition particle 14 kDa protein
      • タンパク質・ペプチド: Signal sequence (HR2)
    • 複合体: P- and E- site tRNA
    • 複合体: X-box-binding protein 1
    • 複合体: mRNA encoding XBP1u
    • 複合体: SRP
    • 複合体: Signal sequence (HR2)
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.

超分子名称: Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#92

+
超分子 #2: Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.

超分子名称: Structure of XBP1u-paused nascent chain complex with SRP.
タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#92 / 詳細: ribosome
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)

+
超分子 #3: P- and E- site tRNA

超分子名称: P- and E- site tRNA / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #3-#4
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
超分子 #4: X-box-binding protein 1

超分子名称: X-box-binding protein 1 / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2 / 詳細: Pausing sequence of XBP1u
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #5: mRNA encoding XBP1u

超分子名称: mRNA encoding XBP1u / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #5
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #6: SRP

超分子名称: SRP / タイプ: complex / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #86-#91
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)

+
超分子 #7: Signal sequence (HR2)

超分子名称: Signal sequence (HR2) / タイプ: complex / ID: 7 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #92
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: eS31

分子名称: eS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.98644 KDa
配列文字列:
KSYTTPKKNK HKRKKVKLAV LKYYKVDENG KISRLRRECP SDECGAGVFM ASHFDRHYCG KCCLTYCF

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein

+
分子 #2: X-box-binding protein 1

分子名称: X-box-binding protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 2.89538 KDa
組換発現生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
配列文字列:
DPVPYQPPFL CQWGRHQPAW KPLM

UniProtKB: X-box-binding protein 1

+
分子 #7: ribosomal protein RACK1

分子名称: ribosomal protein RACK1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.669113 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1

+
分子 #10: uS14

分子名称: uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.559625 KDa
配列文字列:
GHQQLYWSHP RKFGQGSRSC RVCSNRHGLI RKYGLNMCRQ CFRQYAKDIG FIKLD

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #11: uL2

分子名称: uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 26.998613 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGRLRG T

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.317539 KDa
配列文字列:
SLARVGKVRG QTLKVAKQEK KKKRTGRAKR RMQYNRRFVN VVPTFGKKKG PNANS

UniProtKB: Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein

+
分子 #13: uL3

分子名称: uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 45.119812 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVSQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.629309 KDa
配列文字列: AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF ...文字列:
AKIVKPNGEK PDEFESGISQ ALLELEMNSD LKAQLRELNI TAAKEIEVGG GRKAIIIFVP VPQLKSFQKI QVRLVRELEK KFSGKHVVF IAQRRILPKP TRKSRTKNKQ KRPRSRTLTA VHDAILEDLV FPSEIVGKRI RVKLDGSRLI KVHLDKAQQN N VEHKVETF SGVYKKLTGK DVNFEFPEFQ L

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS7

+
分子 #15: uL4

分子名称: uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 41.101414 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCV IYNEDNGIVK AFRNIPGITL LNVTKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDDLYGTWR KAASLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYAKTMRR NTILRQARNH KLRVERAAAA LAAKSD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #16: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.003012 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #17: Ribosomal protein S9 (Predicted)

分子名称: Ribosomal protein S9 (Predicted) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.649633 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK KGQGGAG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.077391 KDa
配列文字列: FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG ...文字列:
FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIM GQNVADYMRY LMEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKR EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQERAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #19: Ribosomal protein S11

分子名称: Ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.586766 KDa
配列文字列:
DIQTERAYQK QPTIFQNKKR VLLGETGKEK LPRYYKNIGL GFKTPKEAIE GTYIDKKCPF TGNVSIRGRI LSGVVTKMKM QRTIVIRRD YLHYIRKYNR FEKRHKNMSV HLSPCFRDVQ IGDIVTVGEC RPLSKTVRFN VLKVTKAAGT KK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 28.818293 KDa
配列文字列: KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKREK VLATVTKPVG GDKNGGTRVV KLRKMPRYYP TEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR HRGKRVVFLK QLSSGLLLVT GPLSLNRVPL RRTHQKFVIA T STKIDISG ...文字列:
KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKREK VLATVTKPVG GDKNGGTRVV KLRKMPRYYP TEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR HRGKRVVFLK QLSSGLLLVT GPLSLNRVPL RRTHQKFVIA T STKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EKEKYEITEQ RKVDQKAVDS QILPKIKAVP QLQGYLRSVF AL TNGVYPH KLVF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL6

+
分子 #21: Ribosomal protein S28

分子名称: Ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.007069 KDa
配列文字列:
QPIKLARVTK VLGRTGSQGQ CTQVRVEFMD DTSRSIIRNV KGPVREGDVL TLLESEREAR RL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #22: uL30

分子名称: uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 26.658754 KDa
配列文字列: NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI ...文字列:
NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI HEIYTVGKHF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGG DAGNREDQIN RLIRRMN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #23: Ribosomal protein S20

分子名称: Ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.395489 KDa
配列文字列:
HRIRITLTSR NVKSLEKVCA DLIRGAKEKN LKVKGPVRMP TKTLRITTRK TPCGEGSKTW DRFQMRIHKR LIDLHSPSEI VKQITSISI EPGVEVEVTI A

+
分子 #24: eL8

分子名称: eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.351377 KDa
配列文字列: VVNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET KQEKKQRLL ARAEKKAAGK GDVPTKRPPV LRAGVNTVTT LVENKKAQLV VIAHDVDPIE LVVFLPALCR KMGVPYCILK G KARLGRLV ...文字列:
VVNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET KQEKKQRLL ARAEKKAAGK GDVPTKRPPV LRAGVNTVTT LVENKKAQLV VIAHDVDPIE LVVFLPALCR KMGVPYCILK G KARLGRLV HRKTCTTVAF TQVNSEDKGA LAKLVEAIRT NYNDRYDEIR RHWGGNVLGP KSVARIAKLE KAKAKELATK LG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL8

+
分子 #25: uL6

分子名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #26: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

+
分子 #27: Ribosomal protein L10 (Predicted)

分子名称: Ribosomal protein L10 (Predicted) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.511861 KDa
配列文字列: GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNKEHVVE ALRRAKFKFP G RQKIHISK ...文字列:
GRRPARCYRY CKNKPYPKSR FCRGVPDAKI RIFDLGRKKA KVDEFPLCGH MVSDEYEQLS SEALEAARIC ANKYMVKSCG KDGFHIRVR LHPFHVIRIN KMLSCAGADR LQTGMRGAFG KPQGTVARVH IGQVIMSIRT KLQNKEHVVE ALRRAKFKFP G RQKIHISK KWGFTKFNAD EFEDMVAEKR LIPDGCGVKY IPNRGPLDKW RALHS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #28: uS13

分子名称: uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.898648 KDa
配列文字列:
SLVIPEKFQH ILRVLNTNID GRRKIAFAIT AIKGVGRRYA HVVLRKADID LTKRAGELTE DEVERVITIM QNPRQYKIPD WFLNRQKDV KDGKYSQVLA NGLDNKLRED LERLKKIRAH RGLRHFWGLR VRGQHTKTTG RRGRT

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #29: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.34899 KDa
配列文字列:
PLAKDLLHPS PEEEKRKHKK KRLVQSPNSY FMDVKCPGCY KITTVFSHAQ TVVLCVGCST VLCQPTGGKA RLTEGCSFRR KQH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27

+
分子 #30: Ribosomal protein L11

分子名称: Ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 19.399498 KDa
配列文字列:
KENPMRELRI RKLCLNICVG ESGDRLTRAA KVLEQLTGQT PVFSKARYTV RSFGIRRNEK IAVHCTVRGA KAEEILEKGL KVREYELRK NNFSDTGNFG FGIQEHIDLG IKYDPSIGIY GLDFYVVLGR PGFSIADKKR RTGCIGAKHR ISKEEAMRWF Q QKYDGIIL PG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #32: eS17

分子名称: eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.250714 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGMNFKT PRG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.200525 KDa
配列文字列: APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI ...文字列:
APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #34: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.645794 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

+
分子 #35: Ribosomal protein L14

分子名称: Ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.217355 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTRVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRY KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QRAALLKAS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14

+
分子 #36: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.544659 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

+
分子 #37: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL15

+
分子 #38: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.432125 KDa
配列文字列:
TVTIRTRKFM TNRLLQRKQM VIDVLHPGKA TVPKTEIREK LAKMYKTTPD VIFVFGFRTH FGGGKTTGFG MIYDSLDYAK KNEPKHRLA RHGLYEKKKT SRKQRKERKN RMKKVRGTAK ANVGA

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L13a

分子名称: 60S ribosomal protein L13a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.144859 KDa
配列文字列: QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK ...文字列:
QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKISKF TDVLKTHGLL V

+
分子 #40: ribosomal protein eS25

分子名称: ribosomal protein eS25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.526119 KDa
配列文字列:
RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25

+
分子 #41: uL22

分子名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.758678 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLKKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #42: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.611003 KDa
配列文字列:
GVTVKDVNQQ EFVRALAAFL KKSGKLKVPE WVDTVKLAKH KELAPYDENW FYTRAASTAR HLYLRGGAGV GSMTKIYGGR QRNGVMPSH FSRGSKSVAR RVLQALEGLK MVEKDQDGGR KLTPQGQRDL DRIAGQVAAA KK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #43: eL18

分子名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.568492 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGRENKTAV VVGTVTDDV RVQEVPKLKV CALRVTSRAR SRILKAGGKI LTFDQLALDS PKGRGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15/eL18 domain-containing protein

+
分子 #44: ribosomal protein uS15

分子名称: ribosomal protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #45: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #46: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.048244 KDa
配列文字列:
VNTALQEVLK TALIHDGLAR GIREAAKALD KRQAHLCVLA SNCDEPMYVK LVEALCAEHQ INLIKVDDNK KLGEWVGLCK IDREGKPRK VVGCSCVVVK DYGKESQAKD VIEEYFKC

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS12

+
分子 #47: eL20

分子名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 20.827561 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

+
分子 #48: eS10

分子名称: eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.529682 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS10

+
分子 #49: eL21

分子名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL21

+
分子 #50: Ribosomal protein S15a

分子名称: Ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #51: Ribosomal protein S16

分子名称: Ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.032804 KDa
配列文字列:
GPLQSVQVFG RKKTATAVAH CKRGNGLIKV NGRPLEMIEP RTLQYKLLEP VLLLGKERFA GVDIRVRVKG GGHVAQIYAI RQSISKALV AYYQKYVDEA SKKEIKDILI QYDRTLLVAD PRRCESKKFG GPGARARYQK SYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #52: 60S ribosomal protein L22

分子名称: 60S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.495275 KDa
配列文字列:
QLLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVSLERS KSKITVTSEV PFSKRYLKYL TKKYLKKNNL RDWLRVVAN TKESYELRYF

+
分子 #53: Ribosomal protein S23

分子名称: Ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.626392 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER PR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #54: eL14

分子名称: eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #55: Ribosomal protein L24

分子名称: Ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.131536 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24

+
分子 #56: uS19

分子名称: uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.246854 KDa
配列文字列:
FRKFTYRGVD LDQLLDMSYE QLMQLYSARQ RRRLSRGLRR KQHSLLKRLR KAKKEAPPME KPEVVKTHLR DMIILPEMVG SMVGVYNGK TFNQVEIKPE MIGHYLGEFS ITYKPVKHGR P

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #57: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.727181 KDa
配列文字列:
KIRTSPTFRR PKTLRLRRQP KYPRKSAPRR NKLDHYAIIK FPLTTESAMK KIEDNNTLVF IVDVKANKHQ IKQAVKKLYD IDVAKVNTL IRPDGEKKAY VRLAPDYDAL DVANKIGII

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #58: Ribosomal protein L26

分子名称: Ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #59: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL27

+
分子 #60: uL15

分子名称: uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #61: eL29

分子名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.401047 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMAARAEA IKALVKPKEV KPTIPKGVS RKLHRLAYIA HPKLGRRARA RIARGLR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL29

+
分子 #62: eL30

分子名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 10.914756 KDa
配列文字列:
SLESINSRLQ LVMKSGKYVL GYKQSLKMIR QGKAKLVILA NNCPALRKSE IEYYAMLAKT GVHHYSGNNI ELGTACGKYY RVCTLSIID PGDSDIIRS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30

+
分子 #63: eL31

分子名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL31

+
分子 #64: eL32

分子名称: eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL32

+
分子 #65: eL33

分子名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.449612 KDa
配列文字列:
SGRLWCKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL33

+
分子 #66: eL34

分子名称: eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL34

+
分子 #67: uL29

分子名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.435403 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE SLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #68: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.888371 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SSVLAAMRKA AAK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL36

+
分子 #69: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 10.090891 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPKPK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL37

+
分子 #70: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #71: eL39

分子名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.324579 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIWMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39

+
分子 #72: 60S ribosomal protein L40

分子名称: 60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.199574 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC RKCYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK VK

+
分子 #73: 60s ribosomal protein l41

分子名称: 60s ribosomal protein l41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32

+
分子 #74: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.198603 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVIQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL42

+
分子 #75: ribosomal protein eL43

分子名称: ribosomal protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL43

+
分子 #76: uS2

分子名称: uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.361861 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE IEKEEQAAA

+
分子 #77: eL28

分子名称: eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.220686 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVMKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYHPDLRMAA IRRASAILRS QKPVM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL28

+
分子 #78: 60S acidic ribosomal protein P0

分子名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.521062 KDa
配列文字列: DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLL ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA ...文字列:
DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLL ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA TLLNMLNISP FSFGLIIQQV FDNGSIYN

UniProtKB: 60S acidic ribosomal protein P0

+
分子 #79: uL11

分子名称: uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.561117 KDa
配列文字列:
EIKVVYLRCT GGEVGATSAL APKIGPLGLS PKKVGDDIAK ATGDWKGLRI TVKLTIQNRQ AQIEVVPSAS ALIIKALKEP PRDRKKQKN IKHSGNITFD EIVNIARQMR HRSLARELSG TIKEILGTAQ SVGCNVDGRH PHDIIDDINS GAVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11

+
分子 #80: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.759145 KDa
配列文字列: VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL ...文字列:
VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #81: uS5

分子名称: uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.441846 KDa
配列文字列: KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ...文字列:
KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ARGCTATLGN FAKATFDAIS KTYSYLTPDL WKETVFTKSP YQEFTDHLVK THT

+
分子 #82: Ribosomal protein S3

分子名称: Ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 25.215586 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQKG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #83: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 29.523674 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI TDFIKFDTGN LCMVTGGANL GRIGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG KGNKPWISLP RG KGIRLTI AEERDKRLAA KQSSG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4

+
分子 #84: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.525941 KDa
配列文字列: TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA ...文字列:
TPDIKLFGKW STDDVQINDI SLQDYIAVKE KYAKYLPHSA GRYAAKRFRK AQCPIVERLT NSMMMHGRNN GKKLMTVRIV KHAFEIIHL LTGENPLQVL VNAIINSGPR EDSTRIGRAG TVRRQAVDVS PLRRVNQAIW LLCTGAREAA FRNIKTIAEC L ADELINAA KGSSNSYAIK KKDELERVAK SNR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #85: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 85 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.471535 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #86: Signal recognition particle 54 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 54 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 86 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 47.844172 KDa
配列文字列: ADLGRKITSA LRSLSNATII NEEVLNAMLK EVCTALLEAD VNIKLVKQLR ENVKSAIDLE EMASGLNKRK MIQHAVFKEL VKLVDPGVK AWTPTKGKQN VIMFVGLQGS GKTTTCSKLA YYYQRKGWKT CLICADTFRA GAFDQLKQNA TKARIPFYGS Y TEMDPVII ...文字列:
ADLGRKITSA LRSLSNATII NEEVLNAMLK EVCTALLEAD VNIKLVKQLR ENVKSAIDLE EMASGLNKRK MIQHAVFKEL VKLVDPGVK AWTPTKGKQN VIMFVGLQGS GKTTTCSKLA YYYQRKGWKT CLICADTFRA GAFDQLKQNA TKARIPFYGS Y TEMDPVII ASEGVEKFKN ENFEIIIVDT SGRHKQEDSL FEEMLQVANA IQPDNIVYVM DASIGQACEA QAKAFKDKVD VA SVIVTKL DGHAKGGGAL SAVAATKSPI IFIGTGEHID DFEPFKTQPF ISKLLGMGDI EGLIDKVNEL KLDDNEALIE KLK HGQFTL RDMYEQFQNI MKMGPFSQIL GMIPGFGTDF MSKGNEQESM ARLKKLMTIM DSMNDQELDS TDGAKVFSKQ PGRI QRVAR GSGVSTRDVQ ELLTQYTKFA QMVKKM

UniProtKB: Signal recognition particle subunit SRP54

+
分子 #88: Signal recognition particle subunit SRP19

分子名称: Signal recognition particle subunit SRP19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 88 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 12.159153 KDa
配列文字列:
DRFICIYPAY LNNKKTIAEG RRIPISKAVE NPTATEIQDV CSAVGLNVFL EKNKMYSREW NRDVQYRGRV RVQLKQEDGS LCLVQFPSR KSVMLYAAEM IPKLKT

UniProtKB: Signal recognition particle 19 kDa protein

+
分子 #89: Signal recognition particle subunit SRP68

分子名称: Signal recognition particle subunit SRP68 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 89 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 23.220695 KDa
配列文字列: LSLEILQIIK ESQQQHGLRH GDFQRYRGYC SRRQRRLRKT LNFKMGNRHK FTGKKVTEDL LTDNRYLLLV LMDAERAWSY AMQLKQEAN TEPRKRFHLL SRLRKAVKHA EELERLCESN RVDAKTKLEA QAYTAYLSGM LRFEHQEWKA AIEAFNKCKT I YEKLASAF ...文字列:
LSLEILQIIK ESQQQHGLRH GDFQRYRGYC SRRQRRLRKT LNFKMGNRHK FTGKKVTEDL LTDNRYLLLV LMDAERAWSY AMQLKQEAN TEPRKRFHLL SRLRKAVKHA EELERLCESN RVDAKTKLEA QAYTAYLSGM LRFEHQEWKA AIEAFNKCKT I YEKLASAF TEEQAVLYNQ RVEEISPNIR YCAYNIG

UniProtKB: Signal recognition particle subunit SRP68

+
分子 #90: Signal recognition particle 9 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 9 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 90 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 8.705137 KDa
配列文字列:
PQYQTWEEFS RAAEKLYLAD PMKARVVLKY RHSDGNLCVK VTDDLVCLVY KTDQAQDVKK IEKFHSQLMR LMVA

UniProtKB: Signal recognition particle 9 kDa protein

+
分子 #91: Signal recognition particle 14 kDa protein

分子名称: Signal recognition particle 14 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 91 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 10.651371 KDa
配列文字列:
VLLESEQFLT ELTRLFQKCR TSGSVYITLK KYDGRTKPIP RKGSVEGFEP SDNKCLLRAT DGKKKISTVV SSKEVNKFQM AYSNLLRAN MDGLK

UniProtKB: Signal recognition particle 14 kDa protein

+
分子 #92: Signal sequence (HR2)

分子名称: Signal sequence (HR2) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 92 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.375909 KDa
配列文字列:
LLLLLLLLLL LL

+
分子 #3: P-tRNA

分子名称: P-tRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
分子量理論値: 24.10833 KDa
配列文字列:
GCUUCCGUAG UGCAGCGGCA GCACGUUAGG CUCAUAAUCU AAAGGUCCUU GGUUCGAAAC CAUCCGGGGG CACCA

+
分子 #4: E-tRNA

分子名称: E-tRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
分子量理論値: 24.148355 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGCUGUA GAGCAUCAGA CUUAAAAUCU GAGGGUCCAG GGUUCAAGUC CCUGUUCGGG CGCCA

+
分子 #5: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.877157 KDa
配列文字列:
UUAAUG

+
分子 #6: 28S ribosomal RNA

分子名称: 28S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 6 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 1.148420625 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCCGGGGGGC CCAAGUCCUU CUGAUCGAGG CCCAGCCCGU GGACGGUGUG AGGCCGGUAG CG GCCCCCG GCGCGCCGGG CCCGGGUCUU CCCGGAGUCG GGUUGCUUGG GAAUGCAGCC CAAAGCGGGU GGUAAACUCC AUC UAAGGC UAAAUACCGG CACGAGACCG AUAGUCAACA AGUACCGUAA GGGAAAGUUG AAAAGAACUU UGAAGAGAGA GUUC AAGAG GGCGUGAAAC CGUUAAGAGG UAAACGGGUG GGGUCCGCGC AGUCCGCCCG GAGGAUUCAA CCCGGCGGCG CGGUC CGGC CGUGCCGGCG GGGCGGAUCU CCCGCUCCCG UCGGCGGGGG ACCGCCCCCC GGCCGGCGAC CGGCCGCCGC CGGGCG CAU UUCCACCGCG GCGGUGCGCC GCGACCGGCU CCGGGACGGC UGGGAAGGCC CCGGCGGGGA AGGUGGCCCG GGGGCCC CG GGUGUUACAG CCCCGCCCCG GCAGCAGCAG CUCGCCGAAU CCCGGGGCCG AGGGAGCGAG ACCCGUGCGC CGCGCUCU C CCCCCUCGGG GGGGCCGGGC CACCCCUCCC ACGGCGCGAC CGCUGGGGCG GACUGUCCAG UGCGCCCCGG GCGGGUCGC GCCGUCGGGC CCGGGGGGCC ACGCGUCCCC CGCGAGCGCA CGGGGUCGGC GGCGAUGUCG GCUACCCACC CGACCCGUCU UGAAACACG GACCAAGGAG UCUAACACGU GCGCGAGUCG GGGGCUACGA AAGCCGCCGU GGCGCAAUGA AGGUGAAGGC C GGCGCGCG CGCCGCCGGC CGAGGUGGGA UCCCGAGGCC UUCCAGUCCG CCGAGGGCGC ACCACCGGCC CGUCUCGCCC GC CGCGCCG GGGAGGUGGA GCACGAGCGC ACGUGUUAGG ACCCGAAAGA UGGUGAACUA UGCCUGGGCA GGGCGAAGCC AGA GGAAAC UCUGGUGGAG GUCCGUAGCG GUCCUGACGU GCGAAUCGGU CGUCCGACCU GGGUAUAGGG GCGAAAGACU AAUC GAACC AUCUAGUAGC UGGUUCCCUC CAAAGUUUCC CUCAGGAUAG CUGGCGCUCU CCGCAGUUUU AUCCGGUAAA GCGAA UGAU UAGAGGUCUU GGGGCCGAAA CGAUCUCAAC CUAUUCUCAA ACUUUAAAUG GGUAAGAAGC CCGGCUCGCU GGUGUG GAG CCGGGCGUGG AAUGCGAGUG CCUAGUGGGC CACUUUUGGU AAGCAGAACU GGCGCUGCGG GAUGAACCGA ACGCCGG GU UAAGGCGCCC GAUGCCGACG CUCAUCAGAC CCCAGAAAAG GUGUUGGUUG AUAUAGACAG CAGGAUGGUG GCCAUGGA A GUCGGAAUCC GCUAAGGAGU GUGUAACAAC UCACCUGCCG AAUCAACUAG CCCUGAAAAU GGAUGGCGCU GGAGCGUCG GGCCCAUACC CGGCCGUCGC UGGCAGUCGG CAGAGCGAGA AAGAGAGUGG CGCGGACGCU ACGCCGCGAC GAGUAGGAGG GCCGCUGCG GUGAGCCUUG AAGCCUAGGG CGCGGGCCCG GGUGGAGCCG CCGCAGGUGC AGAUCUUGGU GGUAGUAGCA A AUAUUCAA ACGAGAACUU UGAAGGCCGA AGUGGAGAAG GGUUCCAUGU GAACAGCAGU UGAACAUGGG UCAGUCGGUC CU GAGAGAU GGGCGAGCGC CGUUCCGAAG GGACGGGCGA UGGCCUCCGU UGCCCUCAGC CGAUCGAAAG GGAGUCGGGU UCA GAUCCC CGAAUCCGGA GUGGCGGAGA UGGGCGCCGC GAGGCGUCCA GUGCGGUAAC GCGACCGAUC CCGGAGAAGC CGGC GGGAG CCCCGGGGAG AGUUCUCUUU UCUUUGUGAA GGGCAGGGCG CCCUGGAAUG GGUUCGCCCC GAGAGAGGGG CCCGU GCCU UGGAAAGCGU CGCGGUUCCG GCGGCGUCCG GUGAGCUCUC GCUGGCCCUU GAAAAUCCGG GGGAGAGGGU GUAAAU CUC GCGCCGGGCC GUACCCAUAU CCGCAGCAGG UCUCCAAGGU GAACAGCCUC UGGCAUGUUG GAACAAUGUA GGUAAGG GA AGUCGGCAAG CCGGAUCCGU AACUUCGGGA UAAGGAUUGG CUCUAAGGGC UGGCAGCCGA CUUAGAACUG GUGCGGAC C AGGGGAAUCC GACUGUUUAA UUAAAACAAA GCAUCGCGAA GGCCCGCGGC GGGUGUUGAC GCGAUGUGAU UUCUGCCCA GUGCUCUGAA UGUCAAAGUG AAGAAAUUCA AUGAAGCGCG GGUAAACGGC GGGAGUAACU AUGACUCUCU UAAGGUAGCC AAAUGCCUC GUCAUCUAAU UAGUGACGCG CAUGAAUGGA UGAACGAGAU UCCCACUGUC CCUACCUACU AUCCAGCGAA A CCACAGCC AAGGGAACGG GCUUGGCGGA AUCAGCGGGG AAAGAAGACC CUGUUGAGCU UGACUCUAGU CUGGCACGGU GA AGAGACG UUUUUUCACU GACCCGGUGA GGCGGGGGGG CGAGCCGGGC UCUCGCUUCU GGCGCCAAGC GCCCGGCCGG CCG GGCGCG ACCCGCUCCG GGGACAGUGC CAGGUGGGGA GUUUGACUGG GGCGGUACAC CUGUCAAACG GUAACGCAGG UGUC CUAAG GCGAGCUCAG GGAGGACAGA AACCUCCCGU GGAGCAGAAG GGCAAAAGCU CGCUUGAUCU UGAUUUUCAG UACGA AUAC AGACCGUGAA AGCGGGGCCU CACGAUCCUU CUGACCUUUU GGGUUUUAAG CAGGAGGUGU CAGAAAAGUU ACCACA GGG AUAACUGGCU UGUGGCGGCC AAGCGUUCAU AGCGACGUCG CUUUUUGAUC CUUCGAUGUC GGCUCUUCCU AUCAUUG UG AAGCAGAAUU CACCAAGCGU UGGAUUGUUC ACCCACUAAU AGGGAACGUG AGCUGGGUUU AGACCGUCGU GAGACAGG U UAGUUUUACC CUACUGAUGA UGUGUUGUUG CCAUGGUAAU CCUGCUCAGU ACGAGAGGAA CCGCAGGUUC AGACAUUUG GUGUAUGUGC UUGGCUGAGG AGCCAAUGGG GCGAAGCUAC CAUCUGUGGG AUUAUGACUG AACGCCUCUA AGUCAGAAUC CCGCCCAGG CGGAACGAUA GCGCCGGAGC CUCGGUUGGC CUCGGAUAGC CGGUCCCCCG CCGGGGUCCG GUGCGGAGAG C CCUUCGUC CCGGGAAACG GGGCGGCCGG AAAGGGGGCC GCCCUCUCGC CCGUCACGCA CCGCACGUUC GUGGGGAACC UG GCGCUAA ACCAUUCGUA GACGACCUGC UUCUGGGUCG GGGUUUCGUA CGUAGCAGAG CAGCUGCUGC GAUCUAUUGA AAG UCAGCC CUCGACACAA GGGUUUGU

+
分子 #8: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

+
分子 #9: 5.8S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 9 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 48.545672 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGU UGAUCAUCG ACACUUCGAA CGCACUUGCG GCCCCGGGUU CCUCCCGGGG CUACGCCUGU CUGAGCGUCG CU

+
分子 #31: 18S ribosomal RNA

分子名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 31 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 548.040188 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG CCGACGGGCG CUGACCCCCU UCGCGGGGGG GAUGCGUGCA UUUAUCAGUG GUGACUCUAG AUAACCUCGG GC CGAUCGC ACGCCCGGCG GCGACGACCC AUUCGAACGU CUGCCCUAUC AACUUUCGAU GGUAGUCGCC GUGCCUACCA UGG UGACCA CGGGUGACGG GGAAUCAGGG UUCGAUUCCG GAGAGGGAGC CUGAGAAACG GCUACCACAU CCAAGGAAGG CAGC AGGCG CGCAAAUUAC CCACUCCCGA CCCGGGGAGG UAGUGACGAA AAAUAACAAU ACAGGACUCU UUCGAGGCCC UGUAA UUGG AAUGAGUCCA CUUUAAAUCC UUUAACGAGG AUCCAUUGGA GGGCAAGUCU GGUGCCAGCA GCCGCGGUAA UUCCAG CUC CAAUAGCGUA UAUUAAAGUU GCUGCAGUUA AAAAGCUCGU AGUUGGAUCU UGGGAGCGGC CGUCCCCUGC UCGGCGC CG GCCCGAAGCG UUUACUUUGA AAAAAUUAGA GUGUUCAAAG CAGGCCGCCU GGAUACCGCA GCUAGGAAUA AUGGAAUA G GACCGCGGUU CUAUUUUGUU GGUUUUCGGA ACUGAGGCCA UGAUUAAGAG GGACGGCCGG GGGCAUUCGU AUUGCGCCG CUAGAGGUGA AAUUCUUGGA CCGGCGCAAG ACGGACCAGA GCGAAAGCAU UUGCCAAGAA UGUUUUCAUU AAUCAAGAAC GAAAGUCGG AGGUUCGAAG ACGAUCAGAU ACCGUCGUAG UUCCGACCAU AAACGAUGCC GACUGGCGAU GCGGCGGCGU U AUUCCCAU GACCCGCCGG GCAGCUUCCG GGAAACCAAA GUCUUUGGGU UCCGGGGGGA GUAUGGUUGC AAAGCUGAAA CU UAAAGGA AUUGACGGAA GGGCACCACC AGGAGUGGAG CCUGCGGCUU AAUUUGACUC AACACGGGAA ACCUCACCCG GCC CGGACA CGGACAGGAU UGACAGAUUG AUAGCUCUUU CUCGAUUCCG UGGGUGGUGG UGCAUGGCCG UUCUUAGUUG GUGG AGCGA UUUGUCUGGU UAAUUCCGAU AACGAACGAG ACUCUGGCAU GCUAACUAGU UACGCGACCC CGGUCGGCGU AACUU CUUA GAGGGACAAG UGGCGUUCAG CCACCCGAGA UUGAGCAAUA ACAGGUCUGU GAUGCCCUUA GAUGUCCGGG GCUGCA CGC GCGCUACACU GACUGGCUCA GCGUGUGCCU ACCCUACGCC GGCAGGCGCG GGUAACCCGU UGAACCCCAU UCGUGAU GG GGAUCGGGGA UUGCAAUUAU UCCCCAUGAA CGAGGAAUUC CCAGUAAGUG CGGGUCAUAA GCUUGCGUUG AUUAAGUC C CUGCCCUUUG UACACACCGC CCGUCGCUAC UACCGAUUGG AUGGUUUAGU GAGGCCCUCG GAUCGGCCCC GCCGGGGUG CCCUGGCGGA GCGCUGAGAA GACGGUCGAA CUUGACUAUC UAGAGGAAGU AAAAGUCGUA ACAAGGUUUC CGUAGGUGAA CCUGCGGAA GGAUCAUUA

+
分子 #87: 7S RNA

分子名称: 7S RNA / タイプ: rna / ID: 87 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Canis lupus familiaris (イヌ)
分子量理論値: 66.779688 KDa
配列文字列: GCCGGGCGCG GUGGCGCGCG CCUGUAGUCC CAGCUACUCG GGAGGCUGAG GCUGGAGGAU CGCUUGACUA AGUUCGGCAU CAAUAUGGU GACCUCCCGG GAGCGGGGGA CCACCAGGUU GCCUAAGGAG GGGUGAACCG GCCCAGGUCG GAAACGGAGC A GGUCAAAA ...文字列:
GCCGGGCGCG GUGGCGCGCG CCUGUAGUCC CAGCUACUCG GGAGGCUGAG GCUGGAGGAU CGCUUGACUA AGUUCGGCAU CAAUAUGGU GACCUCCCGG GAGCGGGGGA CCACCAGGUU GCCUAAGGAG GGGUGAACCG GCCCAGGUCG GAAACGGAGC A GGUCAAAA CUCCCGUGCU GAUCAGUAGU UUAGCGAGAC CCCGUCUC

+
分子 #93: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 93 / コピー数: 299 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #94: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 94 / コピー数: 5 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
平均電子線量: 28.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

5lzv

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 24875
初期 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: RELION / 詳細: RELION
最終 角度割当タイプ: OTHER / ソフトウェア - 名称: RELION / 詳細: RELION
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

精密化プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-6r6g:
Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP.

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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