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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. | |||||||||
![]() | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Locally filtered | |||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Jones ML / Yeeles JTP | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: How Pol α-primase is targeted to replisomes to prime eukaryotic DNA replication. 著者: Morgan L Jones / Valentina Aria / Yasemin Baris / Joseph T P Yeeles / ![]() 要旨: During eukaryotic DNA replication, Pol α-primase generates primers at replication origins to start leading-strand synthesis and every few hundred nucleotides during discontinuous lagging-strand ...During eukaryotic DNA replication, Pol α-primase generates primers at replication origins to start leading-strand synthesis and every few hundred nucleotides during discontinuous lagging-strand replication. How Pol α-primase is targeted to replication forks to prime DNA synthesis is not fully understood. Here, by determining cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures of budding yeast and human replisomes containing Pol α-primase, we reveal a conserved mechanism for the coordination of priming by the replisome. Pol α-primase binds directly to the leading edge of the CMG (CDC45-MCM-GINS) replicative helicase via a complex interaction network. The non-catalytic PRIM2/Pri2 subunit forms two interfaces with CMG that are critical for in vitro DNA replication and yeast cell growth. These interactions position the primase catalytic subunit PRIM1/Pri1 directly above the exit channel for lagging-strand template single-stranded DNA (ssDNA), revealing why priming occurs efficiently only on the lagging-strand template and elucidating a mechanism for Pol α-primase to overcome competition from RPA to initiate primer synthesis. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 7.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 19.3 KB 19.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 120.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() ![]() | 118.1 MB 63 MB 116 MB 116 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
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注釈 | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Locally filtered | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: Human replisome prepared in the presence of a...
ファイル | emd_15923_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Sharpened | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Human replisome prepared in the presence of a...
ファイル | emd_15923_additional_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Unsharpened | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Human replisome prepared in the presence of a...
ファイル | emd_15923_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Half map B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Human replisome prepared in the presence of a...
ファイル | emd_15923_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Human replisome prepared in the presence of a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. Off DNA. Half map A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Human replisome bound by pol alpha, engaged on a fork DNA substra...
全体 | 名称: Human replisome bound by pol alpha, engaged on a fork DNA substrate with a 60 nucleotide lagging strand. |
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要素 |
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-超分子 #1: Human replisome bound by pol alpha, engaged on a fork DNA substra...
超分子 | 名称: Human replisome bound by pol alpha, engaged on a fork DNA substrate with a 60 nucleotide lagging strand. タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#21 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.6 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 37.8 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: INSILICO MODEL |
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初期 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 74940 |