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- EMDB-10809: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-10809
タイトルAcinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit
マップデータAcinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, post-processed map
試料
  • 複合体: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 27種
  • リガンド: x 2種
キーワードantibiotic / amikacin / translation / ribosome
機能・相同性
機能・相同性情報


large ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / transferase activity / ribosomal large subunit assembly / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding ...large ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / transferase activity / ribosomal large subunit assembly / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L25, short-form / : / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. ...Ribosomal protein L25, short-form / : / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L32p, bacterial type / : / : / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L35 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein L16 / : / L28p-like / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L21 / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 superfamily / Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal L32p protein family / Ribosomal protein L32p / Ribosomal protein L24 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein L15, bacterial-type / 50S ribosomal protein uL4 / Ribosomal protein L5, conserved site / Ribosomal protein L5 signature. / Ribosomal protein L15, conserved site / Ribosomal protein L15 signature. / Ribosomal protein L5, N-terminal / Ribosomal protein L5 / Ribosomal protein L5, C-terminal / ribosomal L5P family C-terminus / Ribosomal protein L5 / Ribosomal protein L5 domain superfamily / : / Ribosomal protein L10e/L16 / Ribosomal protein L10e/L16 superfamily / Ribosomal protein L16p/L10e / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain / Ribosomal protein L6 / Ribosomal protein L6 / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain superfamily / Ribosomal protein L2, domain 3 / Ribosomal protein L14P, conserved site
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 ...Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein uL13
類似検索 - 構成要素
生物種Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.7 Å
データ登録者Nicholson D / Edwards TA / O'Neill AJ / Ranson NA
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Wellcome Trust203743/Z/16/Z 英国
Wellcome Trust108466/Z/15/Z 英国
引用ジャーナル: Structure / 年: 2020
タイトル: Structure of the 70S Ribosome from the Human Pathogen Acinetobacter baumannii in Complex with Clinically Relevant Antibiotics.
著者: David Nicholson / Thomas A Edwards / Alex J O'Neill / Neil A Ranson /
要旨: Acinetobacter baumannii is a Gram-negative bacterium primarily associated with hospital-acquired, often multidrug-resistant (MDR) infections. The ribosome-targeting antibiotics amikacin and ...Acinetobacter baumannii is a Gram-negative bacterium primarily associated with hospital-acquired, often multidrug-resistant (MDR) infections. The ribosome-targeting antibiotics amikacin and tigecycline are among the limited arsenal of drugs available for treatment of such infections. We present high-resolution structures of the 70S ribosome from A. baumannii in complex with these antibiotics, as determined by cryoelectron microscopy. Comparison with the ribosomes of other bacteria reveals several unique structural features at functionally important sites, including around the exit of the polypeptide tunnel and the periphery of the subunit interface. The structures also reveal the mode and site of interaction of these drugs with the ribosome. This work paves the way for the design of new inhibitors of translation to address infections caused by MDR A. baumannii.
履歴
登録2020年3月30日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年9月16日-
マップ公開2020年9月16日-
更新2024年5月22日-
現状2024年5月22日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.025
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面レベル: 0.025
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6yhs
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_10809.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_10809.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, post-processed map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 428. Å		1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 428. Å		1.07 Å/pix.
x 400 pix.
= 428. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.07 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.025 / ムービー #1: 0.025
最小 - 最大-0.1510258 - 0.34048384
平均 (標準偏差)0.00025076594 (±0.0062989923)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 428.00003 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.071.071.07
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z428.000428.000428.000
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.1510.3400.000

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添付データ

-
マスク #1

ファイルemd_10809_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex, consensus map filtered by...

ファイルemd_10809_additional.map
注釈Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex, consensus map filtered by local resolution
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, half...

ファイルemd_10809_half_map_1.map
注釈Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, half...

ファイルemd_10809_half_map_2.map
注釈Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit, half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit

全体名称: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit
要素
  • 複合体: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit
    • RNA: 23S ribosomal RNA
    • RNA: 5S ribosomal RNA
    • RNA: E-site tRNA
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

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超分子 #1: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit

超分子名称: Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#30
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)

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分子 #1: 23S ribosomal RNA

分子名称: 23S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 940.330125 KDa
配列文字列: AGUCAAGUAA UUAAGUGCAU GUGGUGGAUG CCUUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAAGACGUG AUAGCCUGCG AAAAGCUCCG GGGAGGCGG CAAAUAUCCU UUGAUCCGGA GAUGUCUGAA UGGGGGAACC CACCUACUUU AAGGUAGGUA UUGCAACAUG A AUACAUAG ...文字列:
AGUCAAGUAA UUAAGUGCAU GUGGUGGAUG CCUUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAAGACGUG AUAGCCUGCG AAAAGCUCCG GGGAGGCGG CAAAUAUCCU UUGAUCCGGA GAUGUCUGAA UGGGGGAACC CACCUACUUU AAGGUAGGUA UUGCAACAUG A AUACAUAG UGUUGCAAGG CGAACGAGGG GAAGUGAAAC AUCUCAGUAC CCUUAGGAAA AGAAAUCAAU UGAGAUUCCC UC AGUAGCG GCGAGCGAAC GGGGAUCAGC CCAUUAAGUU AUGUGUGUUU UAGUGGAACG CUCUGGGAAG UGCGAACGUA GAG GGUGAU AUUCCCGUAC ACGAAAGGGC ACACAUAAUG AUGACGAGUA GGGCGAGGCA CGUGAAACCU UGUCUGAAUA UGGG GGGAC CAUCCUCCAA GGCUAAAUAC UCCUGACUGA CCGAUAGUGA ACCAGUACCG UGAGGGAAAG GCGAAAAGAA CCCCU GUGA GGGGAGUGAA AUAGAUCCUG AAACCGCAUG CAUACAAGCA GUGGGAGCAC CUUUGUGGUG UGACUGCGUA CCUUUU GUA UAAUGGGUCA GCGACUUAUA UUCAGUAGCG AGGUUAACCG UAUAGGGGAG CCGUAGAGAA AUCGAGUCUU AAUAGGG CG UUUAGUUGCU GGGUAUAGAC CCGAAACCAG GCGAUCUAUC CAUGAGCAGG UUGAAGGUUG GGUAACACUA ACUGGAGG A CCGAACCCAC UGUCGUUGAA AAGCCAGGGG AUGACUUGUG GAUAGGGGUG AAAGGCUAAU CAAGCCUGGU GAUAGCUGG UUCUCCCCGA AAGCUAUUUA GGUAGCGCCU CGGACGAAUA CCAUAGGGGG UAGAGCACUG UUUCGGCUAG GGGGUCAUCC CGACUUACC AAACCGAUGC AAACUCCGAA UACCUAUGAG UACUAUCCGG GAGACAGACU GCGGGUGCUA ACGUCCGUAG U CAAGAGGA AAACAAUCCA GACCGCCAGC UAAGGCCCCA AAAUCAUAGU UAAGUGGGAA ACGAUGUGGG AAGGCAUAGA CA GCUAGGA GGUUGGCUUA GAAGCAGCCA CCCUUUAAAG AAAGCGUAAU AGCUCACUAG UCGAGUCGGC CUGCGCGGAA GAU GUAACG GGGCUAAAAC UAUGUGCCGA AGCUGCGGAU GUAUACUUUG UAUACGUGGU AGGGGAGCGU UCUGUAAGCC GAUG AAGGU GUGUUGAGAA GCAUGCUGGA GGUAUCAGAA GUGCGAAUGC UGACGUGAGU AACGACAAAA CGGGUGAAAA ACCCG UUCG CCGAAAGACC AAGGGUUCCA GUCCAACGUU AAUCGGGGCU GGGUGAGUCG ACCCCUAAGG CGAGGCCGAA AGGCGU AGU CGAUGGGAAA AUGGUUAAUA UUCCAUUACU UCUGUGUAAU GCGAUGAGAG GACGGAGAAG GCUAAAUCAG CCUGGCG UU GGUUGUCCAG GUGAAAGGAU GUAGGCAUGU AUCUUAGGCA AAUCCGGGGU ACUCUAUGCU GAGAUCUGAU AGCAAGCU G UACUUGUACA GCGAAGUGGU UGAUGCCAUG CUUCCAGGAA AAGUCUCUAA GCUUCAGUUA CACAGGAAUC GUACCCGAA ACCGACACAG GUGGUCAGGU CGAGUAGACC AAGGCGCUUG AGAGAACUCU GCUGAAGGAA CUAGGCAAAA UGGUACCGUA ACUUCGGGA GAAGGUACGC UGUUGUUGGU GAUGGAACUC GCUUCCUGAG CUGACGACAG CCGCAGAAAC CAGGCCGCUG C AACUGUUU AUUAAAAACA UAGCACUCUG CAAACACGAA AGUGGACGUA UAGGGUGUGA UGCCUGCCCG GUGCUGGAAG GU UAAUUGA UGGGGUUAGC GUAAGCGAAG CUCUUGAUCG AAGCCCCAGU AAACGGCGGC CGUAACUAUA ACGGUCCUAA GGU AGCGAA AUUCCUUGUC GGGUAAGUUC CGACCUGCAC GAAUGGCAUA AUGAUGGCGG CGCUGUCUCC AGCAGAGGCU CAGU GAAAU CGAAAUCGCU GUGAAGAUGC AGUGUACCCG CGGCUAGACG GAAAGACCCC GUGAACCUUU ACUGCAGCUU GACAC UGAA CUUUGACCUU ACUUGUGUAG GAUAGGUGGG AGGCUUUGAA GCUGGAACGC UAGUUCCAGU GGAGCCGUCC UUGAAA UAC CACCCUGGUA AUGUUGAGGU UCUAACUCUG UCCCGUGAUC CGGGACGAGG ACCGUGUCUG GUGGGUAGUU UGACUGG GG CGGUCUCCUC CUAAAGAGUA ACGGAGGAGU ACGAAGGUGC GCUCAGCGUG GUCGGAAAUC ACGCGUAGAG UAUAAAGG C AAAAGCGCGC UUAACUGCGA GACCCACAAG UCGAGCAGGU ACGAAAGUAG GUCUUAGUGA UCCGGUGGUU CUGUAUGGA AGGGCCAUCG CUCAACGGAU AAAAGGUACU CUGGGGAUAA CAGGCUGAUA CCGCCCAAGA GUUCAUAUCG ACGGCGGUGU UUGGCACCU CGAUGUCGGC UCAUCUCAUC CUGGGGCUGA AGCAGGUCCC AAGGGUAUGG CUGUUCGCCA UUUAAAGAGG U ACGCGAGC UGGGUUUAGA ACGUCGUGAG ACAGUUCGGU CCCUAUCUAC CGUGGGCGCU GGAAAUUUGA GAGGAUCUGC UC CUAGUAC GAGAGGACCA GAGUGGACGA ACCUCUGGUG UACCGGUUGU GACGCCAGUC GCAUCGCCGG GUAGCUAUGU UCG GAAGGG AUAACCGCUG AAAGCAUCUA AGCGGGAAGC CUACCUCAAG AUAAGAUUUC CCUAGGACUU UAUGUCCUCU AAAG AGCCG UUCGAGACUA GGACGUUGAU AGGUUGGAUG UGGAAGCAUA GUGAUAUGUG AAGCUGACCA AUACUAAUUG CUCGU GAGG CUUGACUAUA CAACACCCA

GENBANK: GENBANK: CP015121.1

+
分子 #2: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 37.608344 KDa
配列文字列:
UGCUGGCGAC CAUAGCAAGA GUGAACCACC UGAUCCCUUC CCGAACUCAG AAGUGAAACC UCUUAGCGCU GAUGGUAGUG UGGGAUUAC CCAUGUGAGA GUAAGUCAUC GCCAGCUC

GENBANK: GENBANK: CP035183.1

+
分子 #3: E-site tRNA

分子名称: E-site tRNA / タイプ: rna / ID: 3
詳細: E. coli fMet-tRNA from PDB 5AFI fitted into EM density - represents a mixture of tRNAs
コピー数: 2
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 24.346498 KDa
配列文字列:
CGCGGGG(N)GG AGCAGCCUGG (N)AGCUCGUCG GGCUCAUAAC CCGAAGAUCG UCGG(N)(N)CAAA UCCGGCCCCC GC AACCA

+
分子 #4: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 30.319092 KDa
配列文字列: MPIQKCKPTS PGRRFVEKVV HDHLHKGAPY APLVEAKKRT GGRNNNGHIT TRHVGGGHKQ HYRIVDFKRN KDGVPAVVER IEYDPSRTA HIALLKYADG ERRYIIAPKG LRAGDKVQSG NDAPIRPGNC LPLRNMPIGS TLHNVELKIG KGAQLARSAG A SVQLLGRD ...文字列:
MPIQKCKPTS PGRRFVEKVV HDHLHKGAPY APLVEAKKRT GGRNNNGHIT TRHVGGGHKQ HYRIVDFKRN KDGVPAVVER IEYDPSRTA HIALLKYADG ERRYIIAPKG LRAGDKVQSG NDAPIRPGNC LPLRNMPIGS TLHNVELKIG KGAQLARSAG A SVQLLGRD GSYAIIRLRS GEMRKVHVEC RAVIGEVSNQ ENNLRSLGKA GAARWRGVRP TVRGMAMNPI DHPHGGGEGR NK GIQPVSP WGQKAKGYKT RTNKRTTKMI IRDRRVK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 22.512639 KDa
配列文字列: MAIGLVGRKC GMTRIFTDAG VSVPVTVIEV DPNRITQIKT LETDGYQAVQ VTTGERRESR VTNAQKGHFA KAGVAAGRLV KEFRVTEAE LEGREVGGTI GVDLFTVGQI VDVTGQSKGK GFQGGVKRWN FRTQDATHGN SVSHRVLGST GQNQTPGRVF K GKKMAGHL ...文字列:
MAIGLVGRKC GMTRIFTDAG VSVPVTVIEV DPNRITQIKT LETDGYQAVQ VTTGERRESR VTNAQKGHFA KAGVAAGRLV KEFRVTEAE LEGREVGGTI GVDLFTVGQI VDVTGQSKGK GFQGGVKRWN FRTQDATHGN SVSHRVLGST GQNQTPGRVF K GKKMAGHL GDERVTVQGL EIVSVDTERS VLVVKGAIPG ATGGDVIVRP TIKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / 詳細: residues 2-12 modelled without side chains / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 21.583904 KDa
配列文字列: MNLKTVSGSA VELSEVAFGR EFNEALVHQV VTAYLAGGRQ GTRAHKSRAD VSGGGKKPFR QKGTGRARAG SIRSPIWVGG GKTFAARPQ DWSQKVNRKM YRGAMQCILA ELVRQDRLVL VEEFAVAAPK TKELLAKLND LNAARALIVT DAVDENLYLA A RNLPHVDV ...文字列:
MNLKTVSGSA VELSEVAFGR EFNEALVHQV VTAYLAGGRQ GTRAHKSRAD VSGGGKKPFR QKGTGRARAG SIRSPIWVGG GKTFAARPQ DWSQKVNRKM YRGAMQCILA ELVRQDRLVL VEEFAVAAPK TKELLAKLND LNAARALIVT DAVDENLYLA A RNLPHVDV VDATAIDPVS LIAFDKVVMS VAAAKKIEVE LG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / 詳細: modelled without side chains / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 20.051471 KDa
配列文字列:
MARLKARYND ELKAKLQEEL SIKNVMEIPR ITKITLNMGV GAAATDKKLL DGAVADMQLI AGQKPVVTLA RKSIAGFKIR DGWPIGCKV TLRGDQMYEF LDRLISIAIP RIRDFRGFSA KSFDGRGNYS MGLKEQIVFP EIDFDKIDRI RGMDITITTT A RTDDEGRA LMRAFGFPFK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 19.126047 KDa
配列文字列:
MSRVAKAPVT VPNGVTVTQN GRQVEVKGSK GTLSFNLHAL VELKQEEGKL QLAPAKESKD AWMQAGTARA VLNNLVKGVS EGFERKLQL VGVGYKAAVK GTVVNLNLGY SHPIDYALPE GVTAETPTAT EIILKSANKQ LLGQVAAEIR AYRSPEPYKG K GVRYSDEV ILRKEAKKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 15.95144 KDa
配列文字列:
MKTLSAKPAE VQHDWFVVDA TGKTLGRLAT EIARRLRGKH KTSYTPHVDA GDYIIVINAE QVQVTGNKAL DKKYYRHTEF PGGLKETNF EKLVAHKPEE IFERAVKGML PKGPLGYAMI KKMKVYAGSE HPHAAQQPQV LDI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #10: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 13.523863 KDa
配列文字列:
MIQTETMLDV ADNSGARRVQ CIKVLGGSHR RYASVGDIIK VTVKEAIPRA RVKKGDVMNA VVVRTKFGIR RPDGSVIRFD DNAAVILNN NKAPIATRIF GPVTRELRTE QFMKIISLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 15.509915 KDa
配列文字列:
MTLRLNELAP AEGAKREHRR LGRGIGSGVG KTGGRGIKGQ KSRKSGGVRP GFEGGQTAIY RRLPKFGFTS QIALKTAEVR LSELSKVEG DIVSLETLKA ANVVRRDQIR ARIVLSGEIT RAFTVQGVAL TKGAKAAIEA AGGKVEE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 15.498312 KDa
配列文字列:
MLQPKRTKFR KVHKGRNTGL AHRGSTVSFG SIAIKATERG RMTARQIEAA RRTISRRIKR GGKIFIRVFP DKPITEKPLE VRMGNGKGN VEYWVCEIKP GKILYEIEGV NEDLAREAFA LAAAKLPFKT TIVTRTVM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 14.02123 KDa
配列文字列:
MRHRNSGVKL GRTSSHRKAM FQNLANSLFE HELIKTTLPK AKELRRVAEP LITLAKNDTV ANRRLAFART RNAATVGKLF TVLGPRYKE RNGGYLRVLK AGFRAGDAAP MAYVELVDRE VNTSAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 12.443341 KDa
配列文字列:
MNEKKQSRLR RAKSTRLHIR ALGATRLCVN RTPRHIYAQV ISADGGKVLA QASTLDASLR SGTTGNIEAA TKVGALIAER AKAAGVTKV AFDRSGFKYH GRIKALADAA REGGLEF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 13.619865 KDa
配列文字列:
MSGKHPLVQA IENSQLKTDL PEFAPGDTVV VQVKVKEGDR ERLQAFEGVV IAKKNRGLNS AFTVRKISSG VGVERVFQTH SPVVAKIEV KRRGDVRRAK LYYLRDLSGK AARIREKLPA RKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 13.468946 KDa
配列文字列:
MARVKRGVVA HRRHKKILAR AKGYYGARSR VYRVAFQAVI KAGQYAYRDR RQKKRQFRAL WIARINAGAR QNGLSYSRMI DGLKKAQVI IDRRVLADIA MHDAVAFAAL AEKAKGALAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 11.496364 KDa
配列文字列:
MYAVIQSGGK QHRVVEGETL KVELLKAESG ATITFDDVLM VVNGDNIQIG APVVAGAKVT AEVIGHGRHD KIRIIKMRRR KHYRKQQGH RQWFTELKIT GISG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 11.960126 KDa
配列文字列:
MMEVTAKLRG AAISAQKARL VADLIRGKSV AHALNILNFS NKKAAVLVKK ALESAIANAE HNNSLDVDDL KVSTIYVDEG MSLKRIMPR AKGRADRITK RTCHITVKVG V

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 11.607392 KDa
配列文字列:
MNNERIYQVL KGPVFSEKAQ VLGDTAGVQV FKVDINATKL EIKKAVEKLF GVEVVKVNTT ITKGKTKRFG RTLGRRSDVK KAYVTLKAG QDVEMADLGD TAESAAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 11.187929 KDa
配列文字列:
MAKIKKGDQV IVIAGKEKGK QGTVLSVSED RVKVEGLNLV KKHQKPNRVT GAEGGIVTQE ASLHISNVAI LNATTQKADR VGYQVIDGV KTRVYKSTGE SVAVAK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 10.914539 KDa
配列文字列:
MANFVLNAQA RAEDKQGKGA SRRLRRESLV PAIIYGGNAE PVAVTLELRE LVKALESNAF FEEVVEIKVG DKVENVKIQA LQRHPAKNT PMHADFKRA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 9.072387 KDa
配列文字列:
MATKKAGGST KNGRDSNPKM LGVKVYGGQT VTAGNIIVRQ RGTEFHAGAN VGMGRDHTLF ATADGVVKFE VKGQFGRRYV KVETV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 9.125756 KDa
配列文字列:
MSKVCQVTGK RPVVGNNVSH ANNKTKRRFE PNLHHHRFWL ESEKRFVRLR LTTKGMRIID KLGIEKVVAD LRAQGQKI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 7.449678 KDa
配列文字列:
MKTKDLREKS VEELKALLDE QQLNQFRLRM AKATGQLGKS HEVQVARKTI ARIKTLLTEK QGNGQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 6.654788 KDa
配列文字列:
MKTIKVTQTK SSSHRLKNHK LCLQGLGLRR IGHTVEVQDT PSNRGMINKV YYMVSVEE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L32

分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 7.096888 KDa
配列文字列:
MAVQQNRKSR SRRDMRRSHD ALTENALTVD QATGETHRRH HVTKDGFYRG RQLFAKAADA E

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 6.10531 KDa
配列文字列:
MRDKIRLVSS AGTGYFYTTT KNKRTMPEKM EIKKFDPKIR QHVIFKEAKI K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 5.192247 KDa
配列文字列:
MKRTFQPSEL KRKRVHGFRA RMATKAGRQV LARRRAKGRH SLTV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 7.424098 KDa
配列文字列:
MAKLKTRRGA AKRFKATANG FKRKQAFKRH ILTKKSAKRI RQLRGCVMVH VSDVASVRRM CPYI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Acinetobacter baumannii ATCC 19606 = CIP 70.34 = JCM 6841 (バクテリア)
分子量理論値: 4.276201 KDa
配列文字列:
MKVQASVKKI CGSCKVIRRN GVIRVICSAE PRHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #31: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 31 / コピー数: 160 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #32: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 32 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / 平均露光時間: 10.0 sec. / 平均電子線量: 58.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.7 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 130000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
In silico モデル: Made by stochastic gradient descent in RELION 3.0
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
詳細: Multi-body refinement was carried out in RELION 3.0 to obtain the final '50S subunit' reconstruction. The mask used for this procedure is deposited with this entry.
使用した粒子像数: 51958
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデル
PDB IDChain

5mdz

source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

5afi

chain_id: w, source_name: PDB, initial_model_type: experimental model
精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT / 当てはまり具合の基準: correlation coefficient
得られたモデル

PDB-6yhs:
Acinetobacter baumannii ribosome-amikacin complex - 50S subunit

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る