登録情報 | データベース: PDB / ID: 5e1i |
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タイトル | Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis L,D-transpeptidase 2 with carbapenem drug T210 |
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要素 | L,D-transpeptidase 2 |
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キーワード | TRANSFERASE / Peptidoglycan synthesis enzyme / cell wall enzyme |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
peptidoglycan-protein cross-linking / peptidoglycan L,D-transpeptidase activity / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / acyltransferase activity / cell wall organization / regulation of cell shape / extracellular region / metal ion binding / plasma membrane類似検索 - 分子機能 Immunoglobulin-like - #3710 / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Bacterial Ig domain, transpeptidase-associated / Bacterial Ig domain / L,D-transpeptidase (L,D-TPase) catalytic domain profile. / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. ...Immunoglobulin-like - #3710 / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Bacterial Ig domain, transpeptidase-associated / Bacterial Ig domain / L,D-transpeptidase (L,D-TPase) catalytic domain profile. / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain / L,D-transpeptidase catalytic domain-like / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Immunoglobulin-like / Beta Barrel / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Mycobacterium tuberculosis (結核菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.003 Å |
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データ登録者 | Kumar, P. / Ginell, S.L. / Lamichhane, G. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/Office of the Director | 1DP2OD008459-01 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nat. Chem. Biol. / 年: 2017 タイトル: Non-classical transpeptidases yield insight into new antibacterials. 著者: Kumar, P. / Kaushik, A. / Lloyd, E.P. / Li, S.G. / Mattoo, R. / Ammerman, N.C. / Bell, D.T. / Perryman, A.L. / Zandi, T.A. / Ekins, S. / Ginell, S.L. / Townsend, C.A. / Freundlich, J.S. / Lamichhane, G. |
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履歴 | 登録 | 2015年9月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2016年10月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年11月9日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年11月23日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2016年12月28日 | Group: Database references |
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改定 1.4 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.5 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id |
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