EMDB-24664: Composite cryo-EM density map of the 48-nm repeat doublet microtu...

基本情報

• 登録情報: データベース: EMDB / ID: EMD-24664
• タイトル: Composite cryo-EM density map of the 48-nm repeat doublet microtubule from bovine tracheal cilia

試料

• 複合体: Doublet microtubule
  • タンパク質・ペプチド: x 36種
• リガンド: x 3種

• キーワード: cilia / microtubule / dynein / motility / STRUCTURAL PROTEIN

機能・相同性

分子機能:

regulation of cilium beat frequency / mucociliary clearance / outer dynein arm docking complex / sperm flagellum assembly / outer acrosomal membrane / regulation of brood size / establishment of left/right asymmetry / protein localization to motile cilium / manchette assembly / axonemal B tubule inner sheath / axonemal A tubule inner sheath / epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry / protein polyglutamylation / positive regulation of feeding behavior / Microtubule-dependent trafficking of connexons from Golgi to the plasma membrane / Cilium Assembly / Intraflagellar transport / Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin / Sealing of the nuclear envelope (NE) by ESCRT-III / Kinesins / cerebrospinal fluid circulation / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / outer dynein arm assembly / sperm axoneme assembly / cilium-dependent cell motility / COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic / RHO GTPases activate IQGAPs / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / COPI-mediated anterograde transport / RHO GTPases Activate Formins / regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility / cilium movement involved in cell motility / 9+2 motile cilium / 転移酵素; リンを含む基を移すもの / acrosomal membrane / regulation of cilium assembly / MHC class II antigen presentation / ciliary transition zone / cilium movement / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / axoneme assembly / axonemal microtubule / Aggrephagy / left/right axis specification / cilium organization / gamma-tubulin ring complex / The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint / flagellated sperm motility / Separation of Sister Chromatids / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / AURKA Activation by TPX2 / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / ventricular system development / manchette / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / Hedgehog 'off' state / positive regulation of cilium assembly / CTP biosynthetic process / UTP biosynthetic process / motile cilium / positive regulation of cell motility / determination of left/right symmetry / GTP biosynthetic process / Neutrophil degranulation / microtubule organizing center / intermediate filament / regulation of neuron projection development / ciliary base / nucleoside diphosphate kinase activity / beta-tubulin binding / axoneme / centriolar satellite / spermatid development / mitotic cytokinesis / alpha-tubulin binding / cilium assembly / single fertilization / cellular response to UV-C / sperm flagellum / sperm midpiece / Hsp70 protein binding / centriole / 3'-5' exonuclease activity / mitotic spindle organization / acrosomal vesicle / ciliary basal body / G protein-coupled receptor binding / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / lung development / Hsp90 protein binding / protein localization / brain development / structural constituent of cytoskeleton / mitotic spindle / cilium

ドメイン・相同性:

Outer dynein arm-docking complex subunit 4 / Outer dynein arm-docking complex subunit 3 / MalT-like TPR region / MalT-like TPR region / Tektin bundle interacting protein 1 / Tektin bundle interacting protein 1 / Sperm-associated antigen 8 / Cilia- and flagella-associated protein 95 / NDPK7, first NDPk domain / Cilia- and flagella-associated protein 107 / : / Protein CFAP95 / Tektin / Cilia- and flagella-associated protein 276 / Tektin family / Protein of unknown function (DUF3695) / Uncharacterised protein FAM166/UPF0605 / Protein Flattop / Ciliary microtubule inner protein 2B-like / Nucleoside diphosphate kinase 7 / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / NDPK7, second NDPk domain / Cilia- and flagella- associated protein 210 / CFAP53/TCHP / Trichohyalin-plectin-homology domain / Trichohyalin-plectin-homology domain / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / RIB43A / RIB43A / DM10 domain / EF-hand domain-containing protein EFHC1/EFHC2/EFHB / DM10 domain / DM10 domain profile. / Domains in hypothetical proteins in Drosophila, C. elegans and mammals. Occurs singly in some nucleoside diphosphate kinases. / Enkurin domain / Calmodulin-binding / Enkurin domain profile. / CFA20 domain / Cilia- and flagella-associated protein 20/CFAP20DC / CFA20 domain / Parkin co-regulated protein / Parkin co-regulated protein / Recoverin family / : / Nucleoside diphosphate kinase (NDPK)-like domain profile. / EF hand / Nucleoside diphosphate kinase / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase / NDK / Nucleoside diphosphate kinase-like domain superfamily / Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile. / Armadillo/beta-catenin-like repeat / Armadillo/beta-catenin-like repeats / Armadillo / TPR repeat region circular profile. / Alpha tubulin / Tubulin-beta mRNA autoregulation signal. / Beta tubulin, autoregulation binding site / Beta tubulin / TPR repeat profile. / Tubulin / Tubulin, C-terminal / Tubulin C-terminal domain / Tubulin, conserved site / Tubulin subunits alpha, beta, and gamma signature. / Tetratricopeptide repeats / Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ, C-terminal / Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily / Tetratricopeptide repeat / EF-hand domain pair / EF-hand, calcium binding motif / EF-Hand 1, calcium-binding site / EF-hand calcium-binding domain. / EF-hand calcium-binding domain profile. / EF-hand domain / Armadillo-like helical / EF-hand domain pair / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / Armadillo-type fold / WD40 repeat, conserved site / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily

構成要素:

Piercer of microtubule wall 2 protein / EF-hand domain-containing family member C2 / TTC25 protein / Parkin coregulated gene protein / Tektin-3 / Outer dynein arm-docking complex subunit 3 / Enkurin / Armadillo repeat containing 4 / Cilia- and flagella-associated protein 276 / Cilia- and flagella- associated protein 210 / Cilia- and flagella-associated protein 52 / EF-hand domain-containing protein 1 / Sperm-associated antigen 8 / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / EF-hand domain-containing family member B / Coiled-coil domain containing 114 / Cilia- and flagella-associated protein 53 / Cilia- and flagella-associated protein 161 / Tubulin alpha-1D chain / Uncharacterized protein C19orf71 homolog / Tektin-2 / Cilia- and flagella-associated protein 107 / Tektin-4 / Protein FAM166B / Tektin-1 / EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / Cilia- and flagella-associated protein 95 / RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / Piercer of microtubule wall 1 protein / Tubulin beta-4B chain / Protein Flattop / Nucleoside diphosphate kinase homolog 7 / Cilia- and flagella-associated protein 20

• 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 手法: 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å
• データ登録者: Gui M / Anderson JR / Botsch JJ / Meleppattu S / Singh SK / Zhang Q / Brown A

資金援助

米国, 1件

Organization	Grant number	国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)		米国

• 引用: ジャーナル: Cell / 年: 2021; タイトル: De novo identification of mammalian ciliary motility proteins using cryo-EM.; 著者: Miao Gui / Hannah Farley / Priyanka Anujan / Jacob R Anderson / Dale W Maxwell / Jonathan B Whitchurch / J Josephine Botsch / Tao Qiu / Shimi Meleppattu / Sandeep K Singh / Qi Zhang / James Thompson / Jane S Lucas / Colin D Bingle / Dominic P Norris / Sudipto Roy / Alan Brown / ; 要旨: Dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) are critical components of the oscillatory molecular machine of cilia, the axoneme, and have luminal surfaces patterned periodically by microtubule inner proteins (MIPs). Here we present an atomic model of the 48-nm repeat of a mammalian DMT, derived from a cryoelectron microscopy (cryo-EM) map of the complex isolated from bovine respiratory cilia. The structure uncovers principles of doublet microtubule organization and features specific to vertebrate cilia, including previously unknown MIPs, a luminal bundle of tektin filaments, and a pentameric dynein-docking complex. We identify a mechanism for bridging 48- to 24-nm periodicity across the microtubule wall and show that loss of the proteins involved causes defective ciliary motility and laterality abnormalities in zebrafish and mice. Our structure identifies candidate genes for diagnosis of ciliopathies and provides a framework to understand their functions in driving ciliary motility.

履歴

登録	2021年8月10日	-
ヘッダ(付随情報) 公開	2021年10月27日	-
マップ公開	2021年10月27日	-
更新	2024年6月5日	-
現状	2024年6月5日	処理サイト: RCSB / 状態: 公開

マップ

• ファイル: ダウンロード / ファイル: emd_24664.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.1 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
• ボクセルのサイズ: X=Y=Z: 1.09 Å

密度

表面レベル	登録者による: 7.0 / ムービー #1: 7
最小 - 最大	0.0 - 49.831657
平均 (標準偏差)	0.28448406 (±1.4580382)

• 対称性: 空間群: 1

詳細

EMDB XML:

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セル	A=B=C: 732.48004 Å α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

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添付データ

マスク #1

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追加マップ: local refined fragment of Pierce1/2 region 2

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• 注釈: local refined fragment of Pierce1/2 region 2

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• 注釈: multi-body local refined fragment of ODA-DC

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• 注釈: local refined fragment of Pierce1/2 region 1

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• 注釈: local refined fragment 9-3

追加マップ: Overall cylinder mask

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• 注釈: Overall cylinder mask

追加マップ: local refined fragment of 8 tektin filaments 2

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• 注釈: local refined fragment of 8 tektin filaments 2

追加マップ: local refined fragment 6-2

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• 注釈: local refined fragment 6-2

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追加マップ: local refined fragment 7-2

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追加マップ: local refined fragment 1-1

• ファイル: emd_24664_additional_9.map
• 注釈: local refined fragment 1-1

試料の構成要素

全体 : Doublet microtubule

• 全体: 名称: Doublet microtubule

要素

• 複合体: Doublet microtubule
  • タンパク質・ペプチド: Protein C9orf135 homolog
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain family member B
  • タンパク質・ペプチド: Methyl-CpG binding domain protein 1
  • タンパク質・ペプチド: Nucleoside diphosphate kinase 7
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein C1orf158 homolog
  • タンパク質・ペプチド: Meiosis-specific nuclear structural protein 1
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-1
  • タンパク質・ペプチド: Tubulin alpha-1D chain
  • タンパク質・ペプチド: Tubulin beta-4B chain
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-2
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein C1orf189 homolog
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-3
  • タンパク質・ペプチド: Sperm associated antigen 8
  • タンパク質・ペプチド: Tektin-4
  • タンパク質・ペプチド: Cilia and flagella associated protein 161
  • タンパク質・ペプチド: TEKTIP1
  • タンパク質・ペプチド: Pierce2
  • タンパク質・ペプチド: Protein FAM166B
  • タンパク質・ペプチド: Coiled-coil domain containing 114
  • タンパク質・ペプチド: Outer dynein arm-docking complex subunit 3
  • タンパク質・ペプチド: Armadillo repeat containing 4
  • タンパク質・ペプチド: TTC25 protein
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1
  • タンパク質・ペプチド: RIB43A-like with coiled-coils protein 2
  • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain containing 1
  • タンパク質・ペプチド: EFHC2
  • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 20
  • タンパク質・ペプチド: PACRG protein
  • タンパク質・ペプチド: Cilia and flagella associated protein 45
  • タンパク質・ペプチド: Cilia and flagella associated protein 52
  • タンパク質・ペプチド: Enkurin, TRPC channel interacting protein
  • タンパク質・ペプチド: Protein Flattop
  • タンパク質・ペプチド: Coiled-coil domain containing 173
  • タンパク質・ペプチド: Chromosome 3 C1orf194 homolog
  • タンパク質・ペプチド: EFCAB6
  • タンパク質・ペプチド: Pierce1
• リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
• リガンド: MAGNESIUM ION
• リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

超分子 #1: Doublet microtubule

• 超分子: 名称: Doublet microtubule / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#36
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)

分子 #1: Protein C9orf135 homolog

• 分子: 名称: Protein C9orf135 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 26.661025 KDa

配列

文字列:

MDSSDSSCQE WCSHGQYWLE LGPTDLMERK GSLTLRSHHK KYSKPVLVYS WHRDRETYPK DYDIEGPEEV KKLCNSTYRR LGTSEPPVW ISETREKMAQ VCLNTKLAKI KSKALLNEET MNSGIIERDT GLPATGFGAL FTRHSPDWSK MCTLTTYAEE Y APPYEYQP LGDPCQDDDY SIVHRKCRSQ FTDLDGSKRV GINTWHDESG IYANSYVKRK LYSLTGGPIA PFLK

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 95

分子 #2: EF-hand domain family member B

• 分子: 名称: EF-hand domain family member B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 97.960547 KDa

配列

文字列:

MCSFLRVPSP KGLEPSKGLG APLQPGTAYP SEMSALGPGM TVSGRKSPLS MEVGLAPEGK DDLEERRVFM GTTSPTELGL RVGLRKDFP CSKTYEERMA SPEIRSPSSK GLELRLKRQN ISRTVMDGSN LGVHRVSASQ ETKPPLSALP GRVGLEKERF L AGYCPGRV TQPPLGQGCE SPQASGGRRC PVTGDPEGFG ASVSKLPALG MECRGELGGE SACVVMKPRA ETEPPVEVDM GL TRLEEPA EMESPEPQMG LVMEPPAWQL AQQPEEQREA ENTEPGVEPP DRIRPIYSGK FFDRMPCWPS AGKVLPIGYR AAT CLTERF PRLMTPPEAK KFFNFRYPPA GAERVFYGRA NDPQIAPSLT HGIRSKISIP AKVLINPQPI TTFQQKMKDK KESV YFSNQ RAPLGKSHDQ TPGLPKGLDI LNTTFGTAIV RETSARDMVN PPKPYKEVFE EAQAGHDLYV VSHNDYFVGE AKNRK YDPS SFHRFNLYGI PTPHFNDGRN MAKTLHWLHE LQMKRGAKIV SKRVDDFKEK FQHRLGRVLD PIAETMNVPP DYTFGA FLR PEDYGVGDLI HRRLPGEYLR GKDRQRGLVA AVRHHLKKVN YQNFDTLLAA FRHYDKKGDG VIDRAELQEA CDQACLH LD EKLLDQLFEY CDVDKDGLIN YLEFANFLTW KDKTPLKEYE ERVLIKGRKA DCANPAEANV EESEPALLLK PEDIVLKE P GSSEKTLRTL LRPSDKVSNH YKTTSSEISA VVGAVPSTCY PTYGVPTIRS DIPAPLIRRV SDRTSYGEEG NAYSLLHPT IFAQKGVFER DFFKTRSKQE ISEILCNIGV KLSEDEFENV WNLASKKHHR GEVCVENIRS VLDELQHADG AKCKAAT

UniProtKB: EF-hand domain-containing family member B

分子 #3: Methyl-CpG binding domain protein 1

• 分子: 名称: Methyl-CpG binding domain protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 62.138992 KDa

配列

文字列:

MYSQRFGIVQ REVKGPTPKV VIVRAKPPKG QGAEHHLQRI QHSHQKHHAI LASIKSIERD RLKTEWDQHN DCKFVDSLVK ARVKDAMQG FIINTEERRN KLRELLASEE NEYFTEMQLK EETIEEKKDR MRDKIRLLRE KKEKERQDFV AEKLDQQFRE R CQELRAEL FCIHQKAVCE ERKAQIAFNE ELKRQKVVEE QMFSKLWEED RLAKERREAK EERRQKELVE NTRLGLNAQV TS IQAQRQA AQRLKEEEAL LVENENAQVK LENEQDKLKK QKTKQEIRAA LQKALQEKME RMQQEYREEQ DLNMKLMQNA LQS LQEETD KKKQKKEDMR REQKIYYQYL AQRHEEEKAQ EKELDRMLEK EKEKKFAEKD KELRLEKEAR KQLLNEVMCT RKLQ VQEKL QRKAKEQEER TMEQERINEG LKELNCEERE NFIRRCSLAQ EYRKQLQMQI CSQQQAREAE EEEERREFEA GIAAE KSFQ DKIQGILSTH QVVPRNIHPM RRACSTKLPP

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 53

分子 #4: Nucleoside diphosphate kinase 7

• 分子: 名称: Nucleoside diphosphate kinase 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: nucleoside-diphosphate kinase
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 42.650895 KDa

配列

文字列:

MNHSERFVFI AEWFDPNASL FRRYELLFYP GDGSVEMHDV KNHRTFLKRT KYEDLHLEDL FIGNKVNIFS RQLVLLDYGD QYTARQLGS KKEKTLALIK PDAVSKAGEI IEIINKAGFT LTKLKMMTLS RKEATDFHID HQSRPFLNEL IQFITSGPII A MEILRDDA VCEWKRLLGP ANSGLARTDA PESIRALFGT DGIKNAAHGP DSFACAAREM ELFFPSSGVC GPANTAKFTN CT TCCIVKP HAVSEGLLGK ILMTIRDAGF EISAMQMFNM DRINVEEFYE VYKGVVSEYN EMVTEMYSGP CVAMEIQQTN PTM TFREFC GPADPEIARH LRPGTLRAIF GKTKIQNAVH CTDLPEDGLL EVQYFFKILD N

UniProtKB: Nucleoside diphosphate kinase homolog 7

分子 #5: Uncharacterized protein C1orf158 homolog

• 分子: 名称: Uncharacterized protein C1orf158 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 23.271453 KDa

配列

文字列:

MQFLTAVSPQ SSSTPSWKIE TKYSTRVLTG NWTEERRKFI KATEKTPQTI YRKEYVPFPG HRPDQISRWY SKRTVEGLPY KYLITHHQE PSQRYLISTY DDHYNRHNYH PGLPELRTWN RHKLLWLPEK ADFPLLGPPT NYGLYEQLKQ KWLPPPEATL R ESIYTSSY PRPPAGAMSR REHAIPVPPP RLQPVPHF

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 107

分子 #6: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

• 分子: 名称: Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 60.572148 KDa

配列

文字列:

MASIRRTLSF SERHQKLVDI NYCKKLHVEA LQRLQNQTRD QMVQNENDDR AERKRFLRLL QDEQFELDME EAIQKAEENK RLRELQLAQ EEKLATELAK LKRESLKDEK LRQQVRENSA ELRELEKKLK AAYMNKERAA QIAEKDAIKY EQMKRDAEIA R TMMEEHER LIKEESAAED KRNQAKAQYS HDLEKQLEEQ EKKKQEAYEQ LLKEKLMIDE IVRKIYEEDQ LERQQRLEKM NT TRRYIEE FQKEQALWRK KKREEMEEEN RKIIEFAKLQ QQREEDRMAK VQESEEKRLQ LKNMLTQRLE EMLRQREDLE QVR QELYQE EQAEIYKKKL EEEAEEKLRK QKELKQDFMD QMALKELILQ AAKEEEETFR KAMLAKFAED DRIELMNAQK QRMK QLEHK RAVEKLIEER RNQFLADKQR ELEEWQWQQR RQGCINAIVE EERLKLLKEH ATKLLGYLPK GVFKNEDDID MLGEE FRKA YQKRSEICEK

UniProtKB: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

分子 #7: Tektin-1

• 分子: 名称: Tektin-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 48.798375 KDa

配列

文字列:

MAKLLQQPPK FLRAEWQIAN KNQYHRAEAQ RSRSERLVAE SQRLVDEIEK TTRKSQSDVN KKLEQRLEEV RFWKKELDDK LEQLVYATE DLLLYQTRLQ KALESFKEPL HITEKCLEYR EKRVGIDLVH DEVEQELIKE HEIIRGVMTL LTRTLEETCE Q IRLNRSAK YNLEKDLRDK FTAITIDDIC FSLNNNSPNI KYSENVVRVE PNSVSLEDWL DFSNTNVEKA DKQRNNSLTL KA LVDRILF QTASDLRRQC DVVDTAFKNG LKETKDARDK LALHLDKVME EIASQEKNIV VLEKAILDQE GPAKVAHTRL ETR THRPNV ELCRDVAQYR LIKEVDEITH NVARLKETLA QAHVELKGLN RRQLALQEEI QIKENTIYID EVLCVPMRKS IPPR DGDDH GEWAGGSHPE AVC

UniProtKB: Tektin-1

分子 #8: Tubulin alpha-1D chain

• 分子: 名称: Tubulin alpha-1D chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 149 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 50.335594 KDa

配列

文字列:

MRECISVHVG QAGVQIGNAC WELYCLEHGI QPDGQMPSDK TIGGGDDSFN TFFSETGAGK HVPRAVFVDL EPTVIDEVRT GTYRQLFHP EQLITGKEDA ANNYARGHYT IGKELIDLVL DRIRKLADQC TGLQGFLIFH SFGGGTGSGF TSLLMERLSV D YGKKSKLE FSIYPAPQVS TAVVEPYNSI LTTHTTLEHS DCAFMVDNEA IYDICRRNLD IERPTYTNLN RLIGQIVSSI TA SLRFDGA LNVDLTEFQT NLVPYPRIHF PLATYAPVIS AEKAYHEQLS VAEITNACFE PANQMVKCDP RHGKYMACCL LYR GDVVPK DVNAAIATIK TKRTIQFVDW CPTGFKVGIN YQPPTVVPGG DLAKVQRAVC MLSNTTAIAE AWARLDHKFD LMYA KRAFV HWYVGEGMEE GEFSEAREDM AALEKDYEEV GMDSVEGEGE EEEGDEY

UniProtKB: Tubulin alpha-1D chain

分子 #9: Tubulin beta-4B chain

• 分子: 名称: Tubulin beta-4B chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 153 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 49.877824 KDa

配列

文字列:

MREIVHLQAG QCGNQIGAKF WEVISDEHGI DPTGTYHGDS DLQLERINVY YNEATGGKYV PRAVLVDLEP GTMDSVRSGP FGQIFRPDN FVFGQSGAGN NWAKGHYTEG AELVDSVLDV VRKEAESCDC LQGFQLTHSL GGGTGSGMGT LLISKIREEY P DRIMNTFS VVPSPKVSDT VVEPYNATLS VHQLVENTDE TYCIDNEALY DICFRTLKLT TPTYGDLNHL VSATMSGVTT CL RFPGQLN ADLRKLAVNM VPFPRLHFFM PGFAPLTSRG SQQYRALTVP ELTQQMFDAK NMMAACDPRH GRYLTVAAVF RGR MSMKEV DEQMLNVQNK NSSYFVEWIP NNVKTAVCDI PPRGLKMSAT FIGNSTAIQE LFKRISEQFT AMFRRKAFLH WYTG EGMDE MEFTEAESNM NDLVSEYQQY QDATAEEEGE FEEEAEEEVA

UniProtKB: Tubulin beta-4B chain

分子 #10: Tektin-2

• 分子: 名称: Tektin-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 10 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 49.962656 KDa

配列

文字列:

MATLSVKPSP RFRLPDWQTN SYLLSTNAER QRDASHQIRQ EARVLRNETN NQTIWDEHDN RTRLAERIDT VSRWKEMLDK CLTDLDAEI DALAQMKESA EQNLQAKNLP LDVAIECLTL RESRRDIDVV KDPVEEELHK EVEVIEATKK ALQQKISQAF E KLFLLQEA RQRLNSDHRG KMETLDIDRG CLSLNLTSPN ISLKINPTRV PNGSTSLQQW DDLSRFNKDH GEAEMKKAIE LR EAIALTI AETNNELEAQ RVATEFAFRK RLREMEKLYS ELKWQEKNTL EEIAELHEDI RHLEEDLRRK LQNLKLCHTR LEA RTYRPN VELCRDQAQY GLTDEVHQLE ATIAALKQKL AQAQDALDAL YKHLARLQAD IACKANSMLL DTKCMDTRRK LTVP AEKFV PEVDTFTRTT NRTLSPLKTC QLELA

UniProtKB: Tektin-2

分子 #11: Uncharacterized protein C1orf189 homolog

• 分子: 名称: Uncharacterized protein C1orf189 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 12.361437 KDa

配列

文字列:

MSMEKMGKVE EHFQRALELK KMVHRWRNSH THCLWQITLS QRRNPYAILR MQDTMVQELA LANKQLLMVR QAALHQLFEK EHQQYQQEL NEKGKAFYME RL

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 141

分子 #12: Tektin-3

• 分子: 名称: Tektin-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 15 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 56.76091 KDa

配列

文字列:

MELLGSTLTA TYAHPRPTPT NFLPAISTMA STYRDRFPHY NLTHSLSLPW RPSTYYKAAS NWPTLDPYCT RSQRVSESTM LPFVSNRTT LFTRYTPDDW YRSNLTNFQE SNTSRHNSER LRVDTSRLIQ DKYQQTRKTQ ADSTQNLGER VNDIGFWKSE I IHELDAMI GETNELTDIK KRLERALMET EAPLQVAREC LFHREKRMGI DLVHDEVEKE LLTEVDTILC CQERMKLYLD KA IAQLAAN RAAQHELEKD LSDKQSAYRI DDKCHHLRNT SDGVSYFHGV ERVDATVSVP ESWAKFTDDN ILRSQSERAA SAK LRDDIQ NVLVVTANEM WNQFNKVNLA FTNRIAETAD AKNKIQTHLA KTLQEIFQTE MTIESIKKAI VEKSAFLKVA QTRL DERTR RPNIELCRDM AQLRLVNEVY EVDDTIQTLQ QRLRDAEDTL QSLAHTKATL EHDLAVKANS LYIDQDKCMS MRRSF PSTL RLVGFC

UniProtKB: Tektin-3

分子 #13: Sperm associated antigen 8

• 分子: 名称: Sperm associated antigen 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 51.604398 KDa

配列

文字列:

METSESTDRS QSRCLDLQPS SDGLGSSSDP FSSWDGRHRS ALVAATAAAS AAATAASTAR AAALWTKSPA PYSHGNLLTE PSSDSLTER YTGPRFTHKI SHGRLGFQPA YFSHIAWNPY TTNDLSSSRG PIPGSSSGPV PGSSSSPGPD SSSDPGPSSS S GPGGSPGG SGRGPGHGPG PGGGSGQGPG GGSGQGTDLG PAIDSRHSPG HGHGPRFNFS APVGFRNPRG DLIPNYTGCK HH CHWEPQK QSWKFLKVSE PGARGLWKPP EVEGKSTVLS ETLPRGQCLL YNWEEERATN YLDQVPVMQD GSESFFFRHG HRG LLTLQP QSPTSSCTTQ KDSYQPPKSH CQPIRGKREA ILEMLLRQQI CKEVQAEQEP TRKDSEVESV THHDYKKELV QAGP PAPTK IHDYHTEQPE TFWLERAPQL PGVSNIRTLD TPFRKNCSFS TPVPLSLEQP LPFEPESYSQ HGEISSLACQ GGGQG GGGG

UniProtKB: Sperm-associated antigen 8

分子 #14: Tektin-4

• 分子: 名称: Tektin-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 9 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 52.025488 KDa

配列

文字列:

MAQTDILLTK EPAPQTVPAC QLPRKLYDVA RNTGAHTSSG LATSGFRTAK YLLDEWFQNC YARYHQAFAD RDQSERQRHE SQQLAAETE ALAQRTQQDS TRKVGERLQD MHGWKSELQR QVEELVSETE LLLAQKQRLE RALDATAGPF SIVTDNLQCR E RRQHPDLV RDCVEIELLK EAELIRNIQE LLKRTIKQAV SQIRLNWEHK ETCEMDWSDK VEAYNIDEAC CRYNNQSTDV QF YPHSAKF EESASTPETW AKFTQEHLYR AERERLASVN LRNLIDCILQ DTSEDLRLQC DAVNLAFGRR CEELEDARHK LEH HLRKTL REISDQEHNI AALKQAIKDK EAPLKVAQTR LYQRSHRPNV ELCRDAAQFR LASEVEELNL SLAALKEKLL EAEQ SLRNL EDTRMSLEKD IAIKTNSLFI DRHKCMAHRA HYPTVLQLAG YQ

UniProtKB: Tektin-4

分子 #15: Cilia and flagella associated protein 161

• 分子: 名称: Cilia and flagella associated protein 161 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 36.519594 KDa

配列

文字列:

MAQNLYGPRV RIGNWNEDVY LEEEIMKDFL AKRDKGQLLI QRNRRLKENL LRPMQLSVSE DGYIHYGDKV MLVSPDHPET EADLFLPGD LSLCMTPDEI KAHLSNELEV PCGLSAAQTK IPVGRNTFTI LCAAGEVIGQ VLRYGQNFRL GITGGFDDRM L YLSSDHRT LLKSSKRSWL QEVFLTHEDS YLNCWQAAFP HPQLRLEYEG SPVPANTKIL ITHCHTNRGL VAHRHLFLRT YF GQEAEVA AHTYLDSHRV EKPKNHWMLV TGAPRKDLST MLDLPKPPAE DTRALEQERE QVSDPGARST PDARGCVPQC TLP M

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 161

分子 #16: TEKTIP1

• 分子: 名称: TEKTIP1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 24.533445 KDa

配列

文字列:

MQTLRRQAAW PCVPRGTLEV DFPPPLYSDD YLSQEGPRWT PAIKQATRWK YTPMGRDAAG QLWYTGLTNS DSREAWYTLP RAPDSPYRE AYARWHGCYG HRERSLPSAY TQRLRETAWY DPIIPAQYTD PSTRWGSVLW KDRPIRGKEF AINRHRFGVE A LWRASDYV RYLSAPQRPR YTAQNYRQWG LEPYCPATNQ RPPPVYTPSH

UniProtKB: Uncharacterized protein C19orf71 homolog

分子 #17: Pierce2

• 分子: 名称: Pierce2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 13.784531 KDa

配列

文字列:

MTECDWEKKS TSASNSDTEM KPELPPCVNP GNPVFSCMLD PKTLHTTTSL SKPKMIMYKT NSSNYGEFLP MPQFFPCYYT PREQVFSSH IRATGFYQNN TLNTAPDRTR TLDFPNFQHT L

UniProtKB: Piercer of microtubule wall 2 protein

分子 #18: Protein FAM166B

• 分子: 名称: Protein FAM166B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 30.551627 KDa

配列

文字列:

MASTFIPGLN PQNPHYIPGY TGHCPLLRFS MGQTYGQMTG QLLRGSPGLA WPPAHRTLLP PIQPPRSPEP RRRSLPVRPG HERLSSSMV PGYTGFVPQA QFIFAKNCSQ VWAEALNGFT QRNGGQGSQE LPKEAKGEKD VEKDQEPKPE VEKEPELGQE A EQASPYSM DDRDPRKFFM SGFTGYVPRA RFLFGSSFPV LSNQALQEFG EMKSPGRSQK DPKHLPALSR TYPQHLGLLP KY GGYVPGY KFQFGRTYGH LTQDALGLST LQKQLLV

UniProtKB: Protein FAM166B

分子 #19: Coiled-coil domain containing 114

• 分子: 名称: Coiled-coil domain containing 114 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 77.675969 KDa

配列

文字列:

MPFGLSAGST RSEDGSEAFL EGMVDWELSR LQRQCKVMED ERRAYSKEVH QRINKQLEEI QRLEGVRHKL RVQISIAQSQ VRRLRDSER LESMGHLLKC QVRVQAEVKE LQAQNQALDR EIQEWESRNS AHSKNARSPG CVQHDKVKSQ RRIKSLENQL D KVICRFDI QLAQNATLRE ELDLLRIERN RYLNVDRKLQ KEIQLLKDSV RNLMVSSTSA YTVREEAKAK LGMLRERAEK EV AQNETEV QILQRQIAHL EQLHHFLKLK NGDRQPDSAI VEKREQRARE VAEGLRKTSQ EKLVLRYEDA LNKLSQMTGE SDP DLLVEK YLELEERNFA EFNFINEQNS ELEHLQEEIK EMQEALVSGR RSEEDRRAQQ EQQRAELQQR VDDVHSEADD LEAR YHNFR EQLEKLKTNI QHLFTRAQCD STLINDLLGI KTHMRDRDIS LFLSLIEKRL VQLLTVQAFL ETQVVVMFNA ALMVL GQSS EDFPKKVAPP QPPDNLEDPP GFEAKDDYPL SKEELLSSVM KAEQHLKELV ESIKVESTPS MTSSTQKVSS SSRLVT QRP SQVPGSIMSH RTSGILVSSG GRATSSNVGH VTFGDSSATT GGLMSSRGSI PGRVTFRSPN SSSYLGSTGY VGSSRDH DS FEASKGPGSE SSGGLGSSPG PASSPGPASS TGQASSTSKD SQSNY

UniProtKB: Coiled-coil domain containing 114

分子 #20: Outer dynein arm-docking complex subunit 3

• 分子: 名称: Outer dynein arm-docking complex subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 72.163984 KDa

配列

文字列:

MTSPLCWAAA SNAMPSQDQI STPSKVKATQ VQLKPYRSRG KGLVPVWHSL HSKAGPLHAS EGKSAVNMQV AELQRKIQLL EGDRKAFYE STQWNIKKNQ ETINQLREET RVLQLQLTAL LQGDEKVVQA VIREWKSEKP YLKNRTGQQA LEHLDYRLNE K VKQLNALR HQLGLRQKWL EELQLQHSLR ELEIAEAQDS NTEVAKTMRN LENRLEKARM KAEEAEHITS VYLQLKAYLQ EE SLHLGNR LDFMEAEVVR TKHELEELHL VNQEALNARD IAKNQLQYLE ETVFRERKKR ERYLTECKKR AEEKKLQNER MER KTQREH VLLQSDDTLQ DSMYSKEEEL KRRWSMYQME VLFGKVKDAT GVAETHAVVR RFLAQGDTFT QLEMLKSENE QTLL RLKQE KQRLQQELED LKYSGEALLV SEQKRQAELQ GRLKMEEQRR ADAQNQLDRT MRALQITKEG LEHLAGKLNH IVVAG PTYE EGSPGASLDT KGSATPQPQE TGRSVGKMDP KVDDYLPNLL GLVEEKLLKL HSQLENHNVP EMLRHIVDLE FYATLE GKL PSYNTRIALP VAGHKDKFFD EEESEEDDSD VVTRAALKMR SQKLIESRSK RRGRSRRS

UniProtKB: Outer dynein arm-docking complex subunit 3

分子 #21: Armadillo repeat containing 4

• 分子: 名称: Armadillo repeat containing 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 116.01707 KDa

配列

文字列:

MGVALTRSAQ WTAAGHGAKT LEVTPLNEAI VKEIIMFVES FIYKYPQEAN YVFVEPLEWK TNLDPSAFGS GYAVSGTTVK SEEADKNGE PLLYLSVPQI KIRSFGQLSR MLYIAKNMKL KEAQACIEAN RNPVAKILGL DYNIISEKIG NSFVSNILDK I TKDDDSES EIKMKIALQL KQLDLHLLNH SLKHISLEIR LNPGTVKNDI ELLKQFSGKG KQTVLESIEY TSDYEFSNGC RA PPWRQIK GEICYVLVKP HDAETLCVTC SKEGVFLNGG KTDDEGQINY ERKGEIYKDL VTLLKEKSAI FSENMSKQEI KFS EQPQKD QPNEAPKEEV AITHKASVTS RKSTQEKNRI NLGRSQLTKR LEPSLNWRTS VSSKDRNTLR DTQVEKHGGK LEKS RSSVS PGRAQLIRKS VEKIEEIISD SSSESEEDEE QPDHRQEANA DLPSEYWQIQ KLVKYLKGGN QTATVIALCS MKDFN LAQE TCQLAIRDVG GLEVLINLLE TDEVKCKIGS LKILKEISHN PQIRRNIVDL GGLPVMVNIL DSPHKSLKCL AAETIA NVA KFRRARRVVR RHGGITKLVA LLDCGKHSGE PAQSSLYETR DVEVARCGAL ALWSCSKSYA NKEAIRKAGG IPLLARL LK TSHENMLIPV VGTLQECASE ENYRAAIKAE RIIENLVKNL NSENEQLQEH CAMAIYQCAE DEETRDLVRL HGGLKPLA S LLNNTDNKER LAAVTGAIWK CSISKENVTK FREYKAIETL VGLLTDQPEE VLVNVVGALG ECCQEHENRV IIRRCGGIQ PLVNLLVGIN QALLVNVTKA VGACAVEPES MMIIDRLDGV RLLWSLLKNP HPDVKASAAW ALCPCIQNAK DAGEMVRSFV GGLELVVNL LKSDNKEVLA SVCAVITNIA KDQENLAVIT DHGVVPLLSK LANTNNDKLR RHLAETISRC CMWGRNRVAF G EHKAVAPL VRYLKSNDTN VHRATAQALY QLSEDADNCV TMHENGAVKL LLDMVGSPDE ELQEAAAGCI SNIRRLALAI EK ARYS

UniProtKB: Armadillo repeat containing 4

分子 #22: TTC25 protein

• 分子: 名称: TTC25 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 78.492633 KDa

配列

文字列:

MADPENEVLR STFPSYMAEG ERLYLCGEFA KAAHSFSNAL HLQSGDKNCL VARSKCFLKM GELEKSLEDA EASLQGDPTF CKGILQKAE TLYTMGDFEF ALVFYHRGYK LRPDREFKVG IQKAQEAINN SVGSPSSIKL ENKGDLSFLS KQAESMRAQQ K PHPVRQLI HHPKRESKRK GSLKSEKIVR QLLGELYVDK EYLEKLLLDE DLIKGTIKHG LTVEDLIMTG INYLETRSDF WR QQKPIYA RERDRKLMQE KWLRDRKRRP SQTARYILKS LEDIDMLLTS GSAEGSLQKA EKVLKKVLEW NKEEVPNKDE LVG NLYSCI GNAQIELGQM VAALQSHRKD LEIAKEYDLP DAKSRALDNI GRVFARVGKF QQAIDTWEEK IPLAKTTLEK TWLF HEIGR CYLELDQAWE AQSYGEKSQQ CAEEEGDMEW QLNASVLVAQ AQVKLRDFES AVNNFEKALE RAKLVHNNEA QQAII NALD DANKGIIEEL KKTNYREILK EKKEKENATM LDGQTRTAKE KETRKTKDEP EKVMKQWVQE QTEKQLEGVL SKETLG VTA RQPEQRQRED PEKASWRKEL GAKERGPGDT AKGQFGEAGR TEQNREETRE IYRRPSELDQ NLSDESSPRE SEGLEKR LS KTDGGELEAL GKTESGEIKE MEITENSEKI EKDEKEDEPI E

UniProtKB: TTC25 protein

分子 #23: EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1

• 分子: 名称: EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 24.667131 KDa

配列

文字列:

MNRKKLQKLT DSLTKNCKHF SKFEVKCLIN LFYNLVGEVT ERQGVIIGLD RNAFRNILHM TFGMTDDMIM DRVFRGFDKD NDGCISVTE WVYGLSVFLR GTLEEKMKYC FEVFDLNGDS FISKEEMFHM LKNSLLKQPS EEDPDEGIKD LVEITLKKMD H DHDGKLSF ADYEQAVREE TLLLEAFGPC LPDPKSQSEF EAQVFKDPNE FNEV

UniProtKB: EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1

分子 #24: RIB43A-like with coiled-coils protein 2

• 分子: 名称: RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 44.773418 KDa

配列

文字列:

MEVAQPKDLK EDFVLAKRRH AELVRQKRIF NARNRIIGGD TTAWDAQVCD QNIKAATEKA RDEAFAAEMR QNDKIACLSE NRERRDRKN LCKAINDFQQ SFQRPETRRE FDLSDPLALK KDRPARQSDY DARNTISGMQ KFMGEDLNFH LRKKFQEEQN R EWSLQQQK EQMIGRENQK CAEDLYLKTR LQFDETAKHL QNLETATRKA VCATVKEFNK NQALESAEKK IQERKQEQED NL AEISNML RGDLLSENPQ QAASSFGPHR VVPDRWKGMS QEQLEEIRLV QRQQVQEKLR LQEEERQRDM DWDRRRIQKA RAT LLFEQQ QQRLQRGLRR ALDCSNLSLA REQLLQKKHM KELCTNHATE DYFTQFNTGS R

UniProtKB: RIB43A-like with coiled-coils protein 2

分子 #25: EF-hand domain containing 1

• 分子: 名称: EF-hand domain containing 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 74.125344 KDa

配列

文字列:

MVSNPVHGLP FLPGTSFKDL TKTAFHRSQT LGYRNGYAVV RRPTVGIGGD RLQVNQLSQA DLDELASKIP ILTYGQARQA PPAAFVPAH VAFDKKVLKF DAYFQEDVPM SIEEHYRIRQ VHIYYYLEDD SMSVIEPVVE NSGIPQGKLI KRQRLSKNDR G DHYHWKDL NRGINITIYG KTFRIVDCDK FTQVFLESQG IELNPPEKMA LDPYTELRKQ PLRKYVTPTD FDQLKQFLTF DK QVLRFYA IWDDTDSMFG ECRTYIIHYY LMDDTVEIRE VHERNDGRDP FPLLMNRQRM PKVLVENAKN FPRCVLEISD KEV LEWYTA KDFIVGKPLT ILGRTFFIYD CDPFTRQYYQ EKFGISDLPR IDMSKKEPPP MKQELPPYNG FGLIEDSAQN CFAL IPKAP QKDVIKMLMN ENKVLRYLAT LESPFPEDKG RRFVLSYFLA TDMISIFEPP VRNSGIIGGK YLGRTKVVKP GSSVE NPVY YGPSDFFIGA VIEVFGHRFV ILDTDDYVLK YMESNAAQYS PEALLSIQNH IRKQEAPAPE LDGQQAEEDP GVRDLE ALI DTIQKQLKDR PCRDNIREAF QIYDKEASGY VDRETFFKIC GSYQLPVDDS LIKELIRMCS HGEDKIDYYN FVRAFSN

UniProtKB: EF-hand domain-containing protein 1

分子 #26: EFHC2

• 分子: 名称: EFHC2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 85.566766 KDa

配列

文字列:

MGKEKFHKSQ HWGFCNNVRM LVGEDKPGIG GELLFGQKIK PKYSVFPKGM GTDSPSWVAF DKQVLSFDAY LEDEVPDKSQ ENYRIRRYK IYFYLEDDTV EVNEPVLQNS GLPQGIFIRR HRISLPPPNE DQFYTVHHFN VNTDIVFYGR TFKVYDCDAF T KNFLTKIG VKLNPPGQCP EDPYMKTRRE KLDCMEPICP YESFDTLKQF LEYDRKVLRF FCVWDDSGSV FGDRRELILH YF LSDDTIE IKEVLPHNSG RDAMSLFLQR RKLPKYGPPG VYQPGQLTDQ TVLNVYGGYS ETRVYGFLLD KYQLGKLDQE FYK DTDLSI GTTINVWGRK VLLCDCDDFT KTYYRTKYGI ENFTSIPCKA PSPPKIERKF PPYTGFGSEE DSLRSCIGLM PTPH QRNFK KFIEFDSYGN ISNTLRFFAK LITHKCADVE RMFVISYFLS DDTISVFEPI ERNSGYTGGM FLKRVRVKKP GQEVF KSEF SEYIKAEELY VGAKVNVNGY LFFLVNADEY TLNYMERNSD KFPLSSIELV IQKLKEEECK SRELKQVFTA ADCMHT KMV DFNTFREIMM NLTVGKLTDQ EVITIARRYR VPEDPCPHRN VLVAQAHEQL KKNAFENFER LIAMCVYEDR EKKKVLP SK DIKRLCKSSR LPLNEDLLGS LLSGFEDSEK QINYESFFCA LNWRVNPVPV LEVASYIKER CEDEWLGMPS PIPVKYIY Y LNLLKDVFGV DE

UniProtKB: EF-hand domain-containing family member C2

分子 #27: Cilia- and flagella-associated protein 20

• 分子: 名称: Cilia- and flagella-associated protein 20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 22.781389 KDa

配列

文字列:

MFKNTFQSGF LSILYSIGSK PLQIWDKKVR NGHIKRITDN DIQSLVLEIE GTNVSTTYIT CPADPKKTLG IKLPFLVMII KNLKKYFTF EVQVLDDKNV RRRFRASNYQ STTRVKPFIC TMPMRLDDGW NQIQFNLSDF TRRAYGTNYI ETLRVQIHAN C RIRRVYFS DRLYSEDELP AEFKLYLPVQ NKAKQ

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 20

分子 #28: PACRG protein

• 分子: 名称: PACRG protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 29.323059 KDa

配列

文字列:

MVAEKETLSL NKCPAKLPTR TKLLAQQPLP VHQPHSLVSE GFTVKAMMKN SVVRGPPSAG AFKERPTKPT AFRKFYERGD FPIALEHDS KGNKIAWKVE IEKLDYHHYL PLFFDGLCEM TFPYEFFARQ GIHDMLEHGG NKILPVIPQL IIPIKNALNL R NRQVICVT LKVLQHLVVS AEMVGEALVP YYRQILPILN IFKNKNVNSG DGIDYSQQKR ENIGDLIQET LEAFERYGGE DA FINIKYM VPTYESCLLN

UniProtKB: Parkin coregulated gene protein

分子 #29: Cilia and flagella associated protein 45

• 分子: 名称: Cilia and flagella associated protein 45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 65.800328 KDa

配列

文字列:

MPLSTAGVLS SASTASNRSR NRPRYRTKAL SSEVDESLFG AIKPLTRSDS PIVLLRDKHA IRKTLTALGL DHKPETIQLI TRDMVRELI IPTKDPSGQS LIMSPEEFER IKWASHVLTK EELEAREQAF KKEKEAIVDT VTTRKKIMKQ KEMVWRNNRK L SDLEEVAK ERAQNLLQRA NQLRMEQEEE LKDMKKIILN AKCHAIRDAQ ILEKQLIQKE LDAEEKRLDQ MMEVERQKSV QR QEELDRK RREERIRGRR HIVEQMEKNQ EERSLLAEQR EQEKEQMLEY MEKLQEEDLR DLEQRHQQKL KMQAEIKRIN DEN QRQKAE LLAQEKLADQ MVMEFTKKKM AREAEFEAEQ ERIRREKEKE IARLRAMQEK AQDYQAEQDA LRAKRNQEVA DREW RRKEK ENAQKKMETE AKLRKSRLEQ VAFKEHTLAV QVQRDRDEFE RILRAQREQI EKERLEEEKK ATGRLQHANE LRRQV RENQ QKQVQARIAT FDEGRRLKEE AQKRRERIED IKRKKLEELR ATGLPEKYCI EAERKANIPV NTSVN

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 45

分子 #30: Cilia and flagella associated protein 52

• 分子: 名称: Cilia and flagella associated protein 52 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 68.719602 KDa

配列

文字列:

METQASPKDE VAEAVELELE AVIGFNGHVP TGLKCHPDQE HLVYPLGCTI LIQAINTQEQ NFLHGHGNNV SCVAISKSGL YIASGQVTF MGFKADIILW DYKKRELMAR LSLHKGKIEA LAFSPNDMYL VSLGGPDDGS VVVWSIAKRE AICGSPAAGL N VGNATTVI FSKCRDEMFV TAGNGTIRVW ELDLPNRKIW PTECQTGQMK RIVMSISMAN DDSFFYLGTT TGDILKMNPR TK LLADTGP AKDKFSLGVS AICCLKMGGL LVGSGDGLLV FCKSPSYKPI KKIQLQGGIT SITLRGEGHQ FFVGTEESHI YRV NFTNFK ETLITTCHFE SVEDIVFPFG TAELFATCAK KDIRVWHTLT NRELLRITVP NMTCHGIDFM RDGKSIISAW DDGR IRAFA PETGRLMYVI NNAHRIGVTA IATTSDCKRV ISGGGEGEVR VWHIGHQTQK LEEALKEHKS SVSCIRVKKS NEECV TAST DGTCIIWDLV RLRRNQMILA NTLFQCVCYH PEEFQIITSG TDRKIAYWEV FDGSVIRELD GSLSGAVNGM DITVEG VHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ YIVSVSADGA ILRWKYPFPS

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 52

分子 #31: Enkurin, TRPC channel interacting protein

• 分子: 名称: Enkurin, TRPC channel interacting protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 30.215129 KDa

配列

文字列:

MVAMDPTGPS ESIYNLIPSD WKEPPQPPRY VSIFKATVKD DMQKFKTAMK TMGPAKLEVP SPKDFLKKHS KEKILPPKKK FEWNERRKP PVPLRTDHPV MGIQSEKNFI NTNAADVIMG VAKKPKPIYV DKRTGDKHDL ETSGLVPKYI NKKDYGVTPE Y ICKRNEEV KKAQEEYDNY IQENLRKAAM KRLSDEEREA VLQGLKKNWE EVHKEFQSLS VFIDSIPKKI RKQKLEEEMK QL EHDIGVL EKHKVIYIAN KK

UniProtKB: Enkurin

分子 #32: Protein Flattop

• 分子: 名称: Protein Flattop / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 21.214035 KDa

配列

文字列:

MATNYSANQY EKPFSPKYLQ NWSLAKPTKE RISSHEGYTQ IIANDRGHLL PSVPRSKASP WGSFMGTWQM PLKVPPARAT LTSRTAAGA ASLTRWIQKN PDLLKASNGL RPEIFGKPHD PDSQKKLRKS ITKTVQQAPS PTIIPSSPAS NLSSPDQLQS S HPSAGHTP GPQSPLNSPK CPPGSPCLPH AGRNLAEV

UniProtKB: Protein Flattop

分子 #33: Coiled-coil domain containing 173

• 分子: 名称: Coiled-coil domain containing 173 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 65.437598 KDa

配列

文字列:

MLVRFGRRSG QAKESAEMKN CEEDPVLYPP LLPTKVDLRQ VTIIPHNEWE RIRDSLDSLT REAACLRAER KAKKEMHLRS QEVVKHWTN TYAGMKEQKL EAKKKRDEEI EAERQILDIE EAIYKQGERK KAIELAKQYQ FYQTERVKNF HSGLLLSRVM K ERDAQIEF QKSKIKSDKK WEEQVKLNVE KAFKEEREKA EKQRRERVAL AKDHLKQIKE HEEEEERRRK EEEKDAEEIK RQ NSLYEIE MKKKQGKKKE EINESRRLFF EHLNDKHIIK AVEQQQQEEE DEKIRKFIKA KKRLTQMGKE KEAETHRLME ERR KRINNF LSKLMKEKFD NEDLIIARDI AEAEAEWEKR EREKYEKNKA ELKAIAEHRA LVMKNKEEEE RQRKIEATEQ MLAI LKADQ IFWEHEKEKK QKADKERREV QDAHIQQMAK HKFNALQAKQ AESEYCRLTE ALVAEKEKEF QDYAREVIES ESEST KKYI YPLVKAVQEG PGGGRGPVLV DRGGLRPSYQ ANDTTGVQLP FYNSPGSKYN NFQKSKGRLG FTW

UniProtKB: Cilia- and flagella- associated protein 210

分子 #34: Chromosome 3 C1orf194 homolog

• 分子: 名称: Chromosome 3 C1orf194 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 19.387805 KDa

配列

文字列:

MPLTRDPFQN PALDKDDSYL GKSRASKKLP YKNPTHLAQQ QEPWCRLSST PTITSMKRDG FFFYSEIPKD DLDFRLAALY NHHTGTFKN KSEILTHQET IQDTRRIKTQ FPGEFLPAPQ PPLITSRANI RHWINPKKES IHSIQGSIVS PHTAATNGGY S RKNDGGFF ST

UniProtKB: Cilia- and flagella-associated protein 276

分子 #35: EFCAB6

• 分子: 名称: EFCAB6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 172.993375 KDa

配列

文字列:

MCKMAVVPDW HIICPYTRKF THSRPHSSPC RVYSRSVFQN MFRPSSSTTV ANPILSSLDV KRILFQKITE KGDELKRAFH LLDTANNMT VTKSELRRVI TTFLLPLTRE QFQDVLAQIP LTSSGAVPYL VFLSRFGGID LNINVIKRGG ENEMNGCRTL K DLEAQVGE KIFKNIKTVI KALMLIDVNT TGLVQPHELR RVLETFCLKM KDEEYKKFAQ HYNIDKDAAV DYNVFLKNLG SN NDLNLKY NMGSQEVLWE NQRVKSFKRE EPPSSAVSDN IWKNYSLDEI ETAFCLELSK CYEKVEKALS AGDPCTSGYV SLN YLKIVL DTFVYRLPRR IFIQLMKRFG LKTTTKVNWK QFLTSFYEPQ YEASSKAPLT KRNSINFRNQ VHKENVITKL FRHE DHDSS LKKALLLIKS KPDGQITGQE LQRILNCMVV KISDSEFREL MRILDPGCTG CVNVSRFIEL IEESPKLHKI PAYKD TKMP LFLAWDSVEE IIHDSIAKNL SAFCNMLRSY DLGDTGLIGR NNFKKIMRVF CPFLTTEHLV KLCSKFQDIA SGRILY KKL LACLGINRPP TVSPVSMPKG QLLNEHLQKE EQPLPDHSER ATPAESQGAV TRNMTKDEVI EKLKSSIRQQ DPAFRKR FL DFTKEPNGKI HTHDFKKVLE DYGMPMDDDQ YALLTTKLGY KKEGMSYLDF AAGFEDPKMN EPEVTPPQTP VLPKGDVD S FFVTAEECLR QFPRRLKEFF RDPYAAFFKM DTDRDGVLTM HDLHRLLQHL LFNLKDEEFE RLLGLLGLRL SITLNFREF RNLCEKRSFS ADDDAPQRLP RPKQKVADSE LACEQAHQYL VTKAKTRWSD LSKNFIETDS EGNGILRRRD MKNALYGFDI PLTPREFEK LWMRYDSEGR GHITYQEFLQ KLGINYSADI HRPYAEEYFN FMGHFTKPQQ VQEELKELQQ STEKAMPARD K LKDHDQDI SKALAKLDKS RTGYISLGRL QRLLQECGCS LKEEELIDLL NSWGIAWHNN SINYLDFLRA VENNKLTRPQ SQ EKEESVP INFAALSPEE VLKNIQGVIA ASSLALSTAF SALDKEDTGF VKASDFGQVL KDFCYKLTDN QYHYFLRKLR LHL TPYINW KYFLQNFSSY VEETAVEWAE KMPRGPRPLS PKEMANQELL ARLHKAVTSH YHAIAQEFEN FDTMKTNTAS RDEF RSICT RHVQVLTDEQ FDRLWEEMPV NSKGRLRYLD FLSSFNVDKQ ATPLATSDSA KAQRGSSVPE VSDRGRSAGS SPTRD PKAG SKPRSHPCTP SSVSGTPPLQ NCEPIETKLR KKVQGCWREL LRECKERDFN KQGEIPGPEF LALVEKFNLD ISRDEC QQL LIKYDLKNNG KFAYCSFIQS CVLLLKAKET SLMQRMKIQN ANKMKEAGAE TCSFYSALLR IQPKIVHCWR PMRRTFK AY DEGGTGLLSV ADFRKVLRQY SINLSEEEFF HILEYYDKTL SSKISYNDFL RAFLQ

分子 #36: Pierce1

• 分子: 名称: Pierce1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: Bos taurus (ウシ)
• 分子量: 理論値: 15.673458 KDa

配列

文字列:

MSEEDPKACA EPEEPKAGPP PEKTSDWYRV SEDLPARFNN PAWFRGYRTK EPPSVYRTSN QAYGSRAPTV HEMPKVFYPN SYKFSRQVA VGGMFQNNTL NVYMEKSIVT GPDNYITSYD RLNFHPSYRV CRPSICD

UniProtKB: Piercer of microtubule wall 1 protein

分子 #37: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

• 分子: 名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 37 / コピー数: 149 / 式: GTP
• 分子量: 理論値: 523.18 Da

Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

分子 #38: MAGNESIUM ION

• 分子: 名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 38 / コピー数: 149 / 式: MG
• 分子量: 理論値: 24.305 Da

分子 #39: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

• 分子: 名称: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 39 / コピー数: 153 / 式: GDP
• 分子量: 理論値: 443.201 Da

Chemical component information

ChemComp-GDP:
GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

実験情報

構造解析

• 手法: クライオ電子顕微鏡法
• 解析: 単粒子再構成法
• 試料の集合状態: filament

試料調製

• 緩衝液: pH: 7.4
• グリッド: 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec. / 詳細: unspecified
• 凍結: 凍結剤: ETHANE

電子顕微鏡法

• 顕微鏡: FEI TITAN KRIOS
• 撮影: フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k); 平均電子線量: 60.0 e/Ų
• 電子線: 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
• 電子光学系: 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
• 試料ステージ: 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER; ホルダー冷却材: NITROGEN
• 実験機器: モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

画像解析

• 粒子像選択: 選択した数: 1267170

初期モデル

モデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

20631

• 最終 再構成: 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1) / 使用した粒子像数: 80503
• 初期 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
• 最終 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)

原子モデル構築 1

• 精密化: プロトコル: AB INITIO MODEL

得られたモデル

PDB-7rro:
Structure of the 48-nm repeat doublet microtubule from bovine tracheal cilia