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タイトルChoreography of rapid actin filament disassembly by coronin, cofilin, and AIP1.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 188, Issue 24, Page 6845-6860.e27, Year 2025
掲載日2025年11月26日
著者Wout Oosterheert / Micaela Boiero Sanders / Oliver Hofnagel / Peter Bieling / Stefan Raunser /
PubMed 要旨Rapid remodeling of actin filament (F-actin) networks is essential for the movement and morphogenesis of eukaryotic cells. The conserved actin-binding proteins coronin, cofilin, and actin-interacting ...Rapid remodeling of actin filament (F-actin) networks is essential for the movement and morphogenesis of eukaryotic cells. The conserved actin-binding proteins coronin, cofilin, and actin-interacting protein 1 (AIP1) act in synergy to promote rapid F-actin network disassembly, but the underlying mechanisms have remained elusive. Here, using cryo-electron microscopy (cryo-EM), we uncover the concerted molecular actions of coronin, cofilin, and AIP1 that lead to actin filament aging and severing. We find that the cooperative binding of coronin allosterically promotes inorganic phosphate release from F-actin and induces filament undertwisting, thereby priming the filament for cofilin binding. Cofilin then displaces coronin from the filament via a strand-restricted cooperative binding mechanism. The resulting cofilactin serves as a high-affinity platform for AIP1, which induces severing by acting as a clamp that disrupts inter-subunit filament contacts. In this "molecular squeezing" mechanism, AIP1 and not cofilin is responsible for filament severing. Our work redefines the role of key disassembly factors in actin dynamics.
リンクCell / PubMed:41075793
手法EM (単粒子) / EM (らせん対称)
解像度2.18 - 4.62 Å
構造データ

EMDB-53093, PDB-9qew:
Cryo-EM structure of the undecorated actin filament in the ADP-Pi state.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.18 Å

EMDB-53094, PDB-9qey:
Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.74 Å

EMDB-53096, PDB-9qf2:
Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.42 Å

EMDB-53105, PDB-9qfb:
Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state.
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.74 Å

EMDB-53106, PDB-9qfd:
Cryo-EM structure of the fully cofilin-1-decorated actin filament (cofilactin)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.61 Å

EMDB-53107, PDB-9qfe:
Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.12 Å

EMDB-53108, PDB-9qfg:
Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.49 Å

EMDB-53110, PDB-9qfj:
Cryo-EM structure of the cofilactin filament core at 2.3 Angstrom resolution.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.31 Å

EMDB-53111: Cryo-EM reconstruction of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by two Cofilin-1 molecules (crosslinked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.43 Å

EMDB-53112: Cryo-EM reconstruction of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by three Cofilin-1 molecules (crosslinked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.36 Å

EMDB-53113: Cryo-EM reconstruction of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by four Cofilin-1 molecules (crosslinked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.33 Å

EMDB-53114, PDB-9qfk:
Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.99 Å

EMDB-53118: Cryo-EM reconstruction of the cofilactin filament core bound by AIP1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.62 Å

EMDB-53119, PDB-9qfo:
Cryo-EM structure of the cofilactin filament pointed end
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.96 Å

EMDB-53121, PDB-9qfq:
Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.76 Å

EMDB-53122, PDB-9qfw:
Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.16 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-PO4:
PHOSPHATE ION / ホスファ-ト

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN / actin / filament / cytoskeleton / coronin / cofilin / pointed end / AIP1 / barbed end

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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