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タイトルMolecular basis of cholesterol efflux via ABCG subfamily transporters.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 118, Issue 34, Year 2021
掲載日2021年8月24日
著者Yingyuan Sun / Jin Wang / Tao Long / Xiaofeng Qi / Linda Donnelly / Nadia Elghobashi-Meinhardt / Leticia Esparza / Jonathan C Cohen / Xiao-Song Xie / Helen H Hobbs / Xiaochun Li /
PubMed 要旨The ABCG1 homodimer (G1) and ABCG5-ABCG8 heterodimer (G5G8), two members of the adenosine triphosphate (ATP)-binding cassette (ABC) transporter G family, are required for maintenance of cellular ...The ABCG1 homodimer (G1) and ABCG5-ABCG8 heterodimer (G5G8), two members of the adenosine triphosphate (ATP)-binding cassette (ABC) transporter G family, are required for maintenance of cellular cholesterol levels. G5G8 mediates secretion of neutral sterols into bile and the gut lumen, whereas G1 transports cholesterol from macrophages to high-density lipoproteins (HDLs). The mechanisms used by G5G8 and G1 to recognize and export sterols remain unclear. Here, we report cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures of human G5G8 in sterol-bound and human G1 in cholesterol- and ATP-bound states. Both transporters have a sterol-binding site that is accessible from the cytosolic leaflet. A second site is present midway through the transmembrane domains of G5G8. The Walker A motif of G8 adopts a unique conformation that accounts for the marked asymmetry in ATPase activities between the two nucleotide-binding sites of G5G8. These structures, along with functional validation studies, provide a mechanistic framework for understanding cholesterol efflux via ABC transporters.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:34404721 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.6 - 3.7 Å
構造データ

EMDB-24310, PDB-7r87:
The structure of human ABCG5-WT/ABCG8-I419E
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-24311, PDB-7r88:
The structure of human ABCG5-I529W/ABCG8-WT
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-24312, PDB-7r89:
The structure of human ABCG5/ABCG8 purified from yeast
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-24313, PDB-7r8a:
The structure of human ABCG5/ABCG8 purified from mammalian cells
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

EMDB-24314, PDB-7r8b:
The structure of human ABCG5/ABCG8 supplemented with cholesterol
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-24315, PDB-7r8c:
The structure of human ABCG1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-24316, PDB-7r8d:
The structure of human ABCG1 E242Q with cholesterol
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-24317, PDB-7r8e:
The structure of human ABCG1 E242Q complexed with ATP
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

化合物

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードLIPID TRANSPORT/IMMUNE SYSTEM / sterol / lipids / ABC transporter / LIPID TRANSPORT / LIPID TRANSPORT-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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