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検索結果

検索 (著者・登録者: zimanyi & m)の結果全39件を表示しています

EMDB-72658:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 1
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Cheng Y, Craik C

EMDB-72659:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 2
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Detomasi TC, Cheng Y, Craik C

EMDB-72660:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 3
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Detomasi TC, Cheng Y, Craik C

PDB-9y7l:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 1
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Cheng Y, Craik C

PDB-9y7m:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 2
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Detomasi TC, Cheng Y, Craik C

PDB-9y7n:
HCMV Protease in complex with Fab5 - Class 3
手法: 単粒子 / : Zimanyi M, Hulce KR, Bohn MF, Norman J, Rohweder PJ, Detomasi TC, Cheng Y, Craik C

EMDB-71091:
Cas1-Cas2/3 integrase, heterohexameric assembly
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71097:
Cas1-Cas2/3 integrase bound to foreign dsDNA fragment
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71101:
Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, first transesterification
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71112:
Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, CRISPR leader association
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71114:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, CRISPR leader association
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71115:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, first transesterification
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71116:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, full repeat
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

PDB-9p11:
Cas1-Cas2/3 integrase, heterohexameric assembly
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

PDB-9p1d:
Cas1-Cas2/3 integrase bound to foreign dsDNA fragment
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-72122:
MS2 bacteriophage coat protein after reassembly as a nanocrate (MS2nc) with no cargo and with waters modeled
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Bobe D, Jenkins MC, Kopylov M

EMDB-72124:
MS2 bacteriophage coat protein with waters modeled
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Bobe D, Jenkins MC, Kopylov M

PDB-9q1b:
MS2 bacteriophage coat protein after reassembly as a nanocrate (MS2nc) with no cargo and with waters modeled
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Bobe D, Jenkins MC, Kopylov M

PDB-9q1d:
MS2 bacteriophage coat protein with waters modeled
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Bobe D, Jenkins MC, Kopylov M

EMDB-72123:
Mouse apoferritin encapsulated in an MS2-nanocrate: MS2nc@ApoF
手法: 単粒子 / : Kopylov M, Bobe D, Jenkins MC, Zimanyi CM

EMDB-72176:
Porcine thyroglobulin encapsulated in an MS2-nanocrate: MS2nc@Tg
手法: 単粒子 / : Kopylov M, Bobe D, Jenkins MC, Zimanyi CM

EMDB-72177:
Dihydroneopterin aldolase encapsulated in an MS2-nanocrate: MS2nc@DHNA
手法: 単粒子 / : Kopylov M, Bobe D, Jenkins MC, Bourne CR, Zimanyi CM

EMDB-29028:
CryoEM structure of Conalbumin from chicken egg white (sigma-Cas 1391-06-6)
手法: 単粒子 / : Newton TP, Zimanyi C, Kopylov M

PDB-8fei:
CryoEM structure of Conalbumin from chicken egg white (sigma-Cas 1391-06-6)
手法: 単粒子 / : Newton TP, Zimanyi C, Kopylov M

EMDB-22907:
SARS-CoV-2 Spike bound to Nb6 in closed conformation
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF

EMDB-22908:
SARS-CoV-2 Spike bound to Nb6 in open conformation
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF, Saunders RA, Sangwan S, Rezelj V, Hoppe N, Boone M, Billesboelle CB, Puchades C, Azumaya CM, Kratochvil HT, Zimanyi M, Desphande I, Liang J, Dickinson S, Nguyen HC, Chio CM, Merz GE, Thompson MC, Diwanji D, Schaefer K, Anand AA, Dobzinski N, Zha BS, Simoneau CR, Leon K, White KM, Chio US, Gupta M, Jin M, Li F, Liu Y, Zhang K, Bulkley D, Sun M, Smith AM, Rizo AN, Moss F, Brilot AF, Pourmal S, Trenker R, Pospiech T, Gupta S, Barsi-Rhyne B, Belyy V, Barile-Hill AW, Nock S, Krogan NJ, Ralston CY, Swaney DL, Garcia-Sastre A, Ott M, Vignuzzi M, Walter P, Manglik A, QCRG Structural Biology Consortium

EMDB-22909:
SARS-CoV-2 Spike bound to Nb11 in closed conformation
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF, Saunders RA, Sangwan S, Rezelj V, Hoppe N, Boone M, Billesboelle CB, Puchades C, Azumaya CM, Kratochvil HT, Zimanyi M, Desphande I, Liang J, Dickinson S, Nguyen HC, Chio CM, Merz GE, Thompson MC, Diwanji D, Schaefer K, Anand AA, Dobzinski N, Zha BS, Simoneau CR, Leon K, White KM, Chio US, Gupta M, Jin M, Li F, Liu Y, Zhang K, Bulkley D, Sun M, Smith AM, Rizo AN, Moss F, Brilot AF, Pourmal S, Trenker R, Pospiech T, Gupta S, Barsi-Rhyne B, Belyy V, Barile-Hill AW, Nock S, Krogan NJ, Ralston CY, Swaney DL, Garcia-Sastre A, Ott M, Vignuzzi M, Walter P, Manglik A, QCRG Structural Biology Consortium

EMDB-22910:
SARS-CoV-2 Spike bound to mNb6 in closed conformation
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF

EMDB-22911:
SARS-CoV-2 Spike bound to Nb11 in open conformation
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF, Saunders RA, Sangwan S, Rezelj V, Hoppe N, Boone M, Billesboelle CB, Puchades C, Azumaya CM, Kratochvil HT, Zimanyi M, Desphande I, Liang J, Dickinson S, Nguyen HC, Chio CM, Merz GE, Thompson MC, Diwanji D, Schaefer K, Anand AA, Dobzinski N, Zha BS, Simoneau CR, Leon K, White KM, Chio US, Gupta M, Jin M, Li F, Liu Y, Zhang K, Bulkley D, Sun M, Smith AM, Rizo AN, Moss F, Brilot AF, Pourmal S, Trenker R, Pospiech T, Gupta S, Barsi-Rhyne B, Belyy V, Barile-Hill AW, Nock S, Krogan NJ, Ralston CY, Swaney DL, Garcia-Sastre A, Ott M, Vignuzzi M, Walter P, Manglik A, QCRG Structural Biology Consortium

PDB-7kkk:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing nanobody Nb6
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF, Saunders RA, Sangwan S, Rezelj V, Hoppe N, Boone M, Billesboelle CB, Puchades C, Azumaya CM, Kratochvil HT, Zimanyi M, Desphande I, Liang J, Dickinson S, Nguyen HC, Chio CM, Merz GE, Thompson MC, Diwanji D, Schaefer K, Anand AA, Dobzinski N, Zha BS, Simoneau CR, Leon K, White KM, Chio US, Gupta M, Jin M, Li F, Liu Y, Zhang K, Bulkley D, Sun M, Smith AM, Rizo AN, Moss F, Brilot AF, Pourmal S, Trenker R, Pospiech T, Gupta S, Barsi-Rhyne B, Belyy V, Barile-Hill AW, Nock S, Liu Y, Krogan NJ, Ralston CY, Swaney DL, Garcia-Sastre A, Ott M, Vignuzzi M, Walter P, Manglik A, QCRG Structural Biology Consortium

PDB-7kkl:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing nanobody mNb6
手法: 単粒子 / : Schoof MS, Faust BF, Saunders RA, Sangwan S, Rezelj V, Hoppe N, Boone M, Billesboelle CB, Puchades C, Azumaya CM, Kratochvil HT, Zimanyi M, Desphande I, Liang J, Dickinson S, Nguyen HC, Chio CM, Merz GE, Thompson MC, Diwanji D, Schaefer K, Anand AA, Dobzinski N, Zha BS, Simoneau CR, Leon K, White KM, Chio US, Gupta M, Jin M, Li F, Liu Y, Zhang K, Bulkley D, Sun M, Smith AM, Rizo AN, Moss F, Brilot AF, Pourmal S, Trenker R, Pospiech T, Gupta S, Barsi-Rhyne B, Belyy V, Barile-Hill AW, Nock S, Liu Y, Krogan NJ, Ralston CY, Swaney DL, Garcia-Sastre A, Ott M, Vignuzzi M, Walter P, Manglik A, QCRG Structural Biology Consortium

EMDB-5430:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 closed ring conformation
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5431:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 1
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5432:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 2
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5433:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 3
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5434:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 4
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5435:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 5
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5436:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 6
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

EMDB-5437:
dATP-inhibited class Ia ribonucleotide reductase from E. coli: alpha4beta4 open conformation 7
手法: 単粒子 / : Zimanyi CM, Ando N, Brignole E, Asturias FJ, Stubbe J, Drennan CL

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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