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検索 (著者・登録者: v. & kostyuchenko)の結果53件中、1から50件目までを表示しています

PDB-7dwt:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 1 strain WestPac 74 in complex with human antibody 1C19 Fab at 37 deg C (Class 1 particle)
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ng TS, Kostyuchenko VA, Shi J, Lok SM

PDB-7dwu:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 1 strain WestPac 74 in complex with human antibody 1C19 Fab at 37 deg C (Class 2 particle)
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ng TS, Kostyuchenko VA, Shi J, Lok SM

PDB-7cvy:
Cryo-EM structure of Chikungunya virus in complex with Fab fragments of mAb CHK-124
手法: 単粒子 / : Zhou QF, Fox JM, Earnest JT, Ng TS, Kim AS, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Shu B, Diamond MS, Lok SM

PDB-7cvz:
Cryo-EM structure of Chikungunya virus in complex with Fab fragments of mAb CHK-263
手法: 単粒子 / : Zhou QF, Fox JM, Earnest JT, Ng TS, Kim AS, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Shu B, Diamond MS, Lok SM

PDB-7cw0:
Cryo-EM structure of Chikungunya virus in complex with mAb CHK-263 IgG
手法: 単粒子 / : Zhou QF, Fox JM, Earnest JT, Ng TS, Kim AS, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Shu B, Diamond MS, Lok SM

PDB-7cw2:
Cryo-EM structure of Chikungunya virus in complex with Fab fragments of mAb CHK-263 (subregion around icosahedral 5-fold vertex)
手法: 単粒子 / : Zhou QF, Fox JM, Earnest JT, Ng TS, Kim AS, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Shu B, Diamond MS, Lok SM

PDB-7cw3:
Cryo-EM structure of Chikungunya virus in complex with mAb CHK-263 IgG (subregion around icosahedral 2-fold vertex)
手法: 単粒子 / : Zhou QF, Fox JM, Earnest JT, Ng TS, Kim AS, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Shu B, Diamond MS, Lok SM

PDB-7c2s:
Helical reconstruction of Dengue virus serotype 3 complexed with Fab C10
手法: らせん対称 / : Morrone S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Zhang S, Lok SM

PDB-7c2t:
Helical reconstruction of Zika virus complexed with Fab C10
手法: らせん対称 / : Morrone S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Zhang S, Lok SM

PDB-7bu8:
Cryo-EM structure of zika virus complexed with Fab SIgN-3C at pH 6.5
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-7bua:
Cryo-EM structure of zika virus complexed with Fab SIgN-3C at pH 8.0
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-7bub:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 complexed with Fab SIgN-3C at pH 6.5
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-7bud:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 complexed with Fab SIgN-3C at pH 8.0
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-7bue:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 complexed with Fab SIgN-3C at pH 5.0
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-7buf:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 complexed with SIgN-3C IgG
手法: 単粒子 / : Zhang S, Chew SV, Lim XN, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lok SM

PDB-6lnt:
Cryo-EM structure of immature Zika virus in complex with human antibody DV62.5 Fab
手法: 単粒子 / : Tan TY, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Ng TS, Lim XX, Lim XN, Shi J, Morais MC, Corti D, Lok SM

PDB-6lnu:
Cryo-EM structure of immature Zika virus
手法: 単粒子 / : Tan TY, Fibriansah G, Kostyuchenko VA, Ng TS, Lim XX, Lim XN, Shi J, Morais MC, Corti D, Lok SM

PDB-6idi:
Cryo-EM structure of Immature Dengue virus serotype 3 in complex with human antibody 1H10 Fab at pH 8.0.
手法: 単粒子 / : Wirawan M, Fibriansah G, Ng TS, Zhang Q, Kostyuchenko VA, Shi J, Lok SM

PDB-6idk:
Cryo-EM structure of Immature Dengue virus serotype 3 in complex with human antibody 1H10 Fab at pH 5.0 (Class I particle)
手法: 単粒子 / : Wirawan M, Fibriansah G, Ng TS, Zhang Q, Kostyuchenko VA, Shi J, Lok SM

PDB-6idl:
Cryo-EM structure of Immature Dengue virus serotype 3 in complex with human antibody 1H10 Fab at pH 5.0 (Class II particle)
手法: 単粒子 / : Wirawan M, Fibriansah G, Ng TS, Zhang Q, Kostyuchenko VA, Shi J, Lok SM

PDB-5h30:
Cryo-EM structure of zika virus complexed with Fab C10 at pH 6.5
手法: 単粒子 / : Zhang S, Kostyuchenko V, Ng TS, Lok SM

PDB-5h32:
Cryo-EM structure of zika virus complexed with Fab C10 at pH 5.0
手法: 単粒子 / : Zhang S, Kostyuchenko V, Ng TS, Lok SM

PDB-5h37:
Cryo-EM structure of zika virus complexed with Fab C10 at pH 8.0
手法: 単粒子 / : Zhang S, Kostyuchenko V, Ng TS, Lim XN, Ooi JSG, Lambert S, Tan TY, Widman D, Shi J, Baric RS, Lok SM

PDB-5iz7:
Cryo-EM structure of thermally stable Zika virus strain H/PF/2013
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Zhang S, Fibriansah G, Lok SM

PDB-4uif:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 in complex with antigen-binding fragments of human antibody 2D22
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ibarra KD, Ng TS, Smith SA, Tan JL, Lim XN, Ooi JSG, Kostyuchenko VA, Wang J, de Silva AM, Harris E, Crowe Junior JE, Lok SM

PDB-4uih:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 strain New Guinea-C complexed with human antibody 2D22 Fab at 37 degree C. The Fab molecules were added to the virus before 37 degree C incubation.
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ibarra KD, Ng TS, Smith SA, Tan JL, Lim XN, Ooi JSG, Kostyuchenko VA, Wang J, de Silva AM, Harris E, Crowe JE, Lok SM

PDB-5a1z:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 2 strain PVP94-07 complexed with human antibody 2D22 Fab at 37 degrees C
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ibarra KD, Ng TS, Smith SA, Tan JL, Lim XN, Ooi JSG, Kostyuchenko VA, Wang J, de Silva AM, Harris E, Crowe Jr JE, Lok SM

PDB-3j6s:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 3 at 28 degrees C
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Tan JL, Smith SA, de Alwis R, Ng TS, Kostyuchenko VA, Kukkaro P, de Silva AM, Crowe Jr JE, Lok SM

PDB-3j6t:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 3 at 37 degrees C
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Tan JL, Smith SA, de Alwis R, Ng TS, Kostyuchenko VA, Kukkaro P, de Silva AM, Crowe Jr JE, Lok SM

PDB-3j6u:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 3 in complex with human antibody 5J7 Fab
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Tan JL, Smith SA, de Alwis R, Ng TS, Kostyuchenko VA, Kukkaro P, de Silva AM, Crowe Jr JE, Lok SM

PDB-4c2i:
Cryo-EM structure of Dengue virus serotype 1 complexed with Fab fragments of human antibody 1F4
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Tan JL, de Alwis R, Smith SA, Ng TS, Kostyuchenko VA, Ibarra KD, Harris E, de Silva A, Crowe Junior JE, Lok SM

PDB-4cbf:
Near-atomic resolution cryo-EM structure of Dengue serotype 4 virus
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Chew PL, Ng TS, Lok SM

PDB-4cct:
Dengue 1 cryo-EM reconstruction
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Zhang Q, Tan JL, Ng TS, Lok SM

PDB-4cau:
THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF DENGUE VIRUS SEROTYPE 1 COMPLEXED WITH 2 HMAB 14C10 FAB
手法: 単粒子 / : Teoh EP, Kukkaro P, Teo EW, Lim AP, Tan TT, Yip A, Schul W, Aung M, Kostyuchenko VA, Leo YS, Chan SH, Smith KG, Chan AH, Zou G, Ooi EE, Kemeny DM, Tan GK, Ng JK, Ng ML, Alonso S, Fisher D, Shi PY, Hanson BJ, Lok SM, Macary PA

PDB-4b03:
6A Electron cryomicroscopy structure of immature Dengue virus serotype 1
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Zhang Q, Tan LC, Ng TS, Lok SM

PDB-3zko:
The structure of ''breathing'' dengue virus.
手法: 単粒子 / : Fibriansah G, Ng TS, Kostyuchenko VA, Lee S, Wang J, Lok SM

PDB-2yew:
Modeling Barmah Forest virus structural proteins
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Jakana J, Liu X, Haddow AD, Aung M, Weaver SC, Chiu W, Lok SM

PDB-3ixx:
The pseudo-atomic structure of West Nile immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53
手法: 単粒子 / : Cherrier MV, Kaufmann B, Nybakken GE, Lok SM, Warren JT, Nelson CA, Kostyuchenko VA, Holdaway HA, Chipman PR, Kuhn RJ, Diamond MS, Rossmann MG, Fremont DH

PDB-3ixy:
The pseudo-atomic structure of dengue immature virus in complex with Fab fragments of the anti-fusion loop antibody E53
手法: 単粒子 / : Cherrier MV, Kaufmann B, Nybakken GE, Lok SM, Warren JT, Nelson CA, Kostyuchenko VA, Holdaway HA, Chipman PR, Kuhn RJ, Diamond MS, Rossmann MG, Fremont DH

PDB-3foh:
Fitting of gp18M crystal structure into 3D cryo-EM reconstruction of bacteriophage T4 extended tail
手法: 単粒子 / : Aksyuk AA, Leiman PG, Kurochkina LP, Shneider MM, Kostyuchenko VA, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-3foi:
Fitting of gp18M crystal structure into 3D cryo-EM reconstruction of bacteriophage T4 contracted tail
手法: 単粒子 / : Aksyuk AA, Leiman PG, Kurochkina LP, Shneider MM, Kostyuchenko VA, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-3c6r:
Low pH Immature Dengue Virus
手法: 単粒子 / : Yu I, Zhang W, Holdway HA, Li L, Kostyuchenko VA, Chipman PR, Kuhn RJ, Rossmann MG, Chen J

PDB-2r6p:
Fit of E protein and Fab 1A1D-2 into 24 angstrom resolution cryoEM map of Fab complexed with dengue 2 virus.
手法: 単粒子 / : Lok SM, Kostyuchenko VK, Holdaway HA, Chipman PR, Kuhn RJ, Rossmann MG

PDB-2nsu:
Crystal structure of the ectodomain of human transferrin receptor fitted into a cryo-EM reconstruction of canine parvovirus and feline transferrin receptor complex
手法: 単粒子 / : Hafenstein S, Kostyuchenko VA, Rossmann MG

PDB-2bsg:
The modeled structure of fibritin (gpwac) of bacteriophage T4 based on cryo-EM reconstruction of the extended tail of bacteriophage T4
手法: らせん対称 / : Kostyuchenko VA, Chipman PR, Leiman PG, Arisaka F, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-1zku:
Fitting of the gp9 structure in the EM density of bacteriophage T4 extended tail
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA

PDB-1tja:
Fitting of gp8, gp9, and gp11 into the cryo-EM reconstruction of the bacteriophage T4 contracted tail
手法: 単粒子 / : Leiman PG, Chipman PR, Kostyuchenko VA, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-1pdf:
Fitting of gp11 crystal structure into 3D cryo-EM reconstruction of bacteriophage T4 baseplate-tail tube complex
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Leiman PG, Chipman PR, Kanamaru S, van Raaij MJ, Arisaka F, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-1pdi:
Fitting of the C-terminal part of the short tail fibers into the cryo-EM reconstruction of T4 baseplate
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Leiman PG, Chipman PR, Kanamaru S, van Raaij MJ, Arisaka F, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

PDB-1pdj:
Fitting of gp27 into cryoEM reconstruction of bacteriophage T4 baseplate
手法: 単粒子 / : Kostyuchenko VA, Leiman PG, Chipman PR, Kanamaru S, van Raaij MJ, Arisaka F, Mesyanzhinov VV, Rossmann MG

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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